Biochemistry I - MC250P40A

• Title: Biochemie I (kata)
• Czech title: Biochemie I (kata)
• Guaranteed by: Department of Biochemistry (31-250)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2024
• Semester: summer
• E-Credits: 6
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:3/2, C [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment; priority enrollment if the course is part of the study plan
• Guarantor: prof. RNDr. Helena Ryšlavá, CSc.
• Teacher(s): RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D.; prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc.; prof. RNDr. Helena Ryšlavá, CSc.; RNDr. Dagmar Svášková, Ph.D.
• Is incompatible with: MC250P03C

Annotation

English

The course is intended for students of "Clinical and toxicological analysis", it is the first half of a two-semester course.
Introduction, basic terms and principles of biochemistry. Biomolecules (proteins, saccharides, lipids and nucleic acids) - their structure and biochemical properties. Enzymes - properties, structure, coenzymes and cofactors. Bioenergetics - thermodynamic principles, macroergic compounds.
Basic methodology of biochemistry (isolation and purification of biomolecules, laboratory animals, immunochemical methods, microscopy
Lectures - in Czech (English possible).

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)

Czech

Tato přednáška je určena pro studenty KATA. Jedná se o první polovinu dvousemestrálního kursu.
Probíraná témata: Vymezení oboru biochemie, základní pojmy, struktura buňky, typy organismů dle trofiky. Základní složky živé hmoty (proteiny, sacharidy, lipidy a nukleové kyseliny) jejich struktura a funkce. Bioenergetika - termodynamika v organismech, makroergické sloučeniny. Enzymy - pojem koenzymu, vlastnosti enzymů, enzymová kinetika.
Základy práce v biochemické laboratoři, izolace biomolekul z biochemického materiálu. Práce s laboratorními zvířaty, imunochemické metody analýzy, základy mikroskopie optické a elektronové.
(Ve druhé části kursu jsou pak probírány základní principy metabolismu a základní metody charakterizace biomolekul.)

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)

Literature

English

J. M.Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry, 6th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2007; D. Voet, J.G. Voet: Biochemistry, Wiley, N.Y. 1995; R.H. Garrett, C.M. Grisham: Biochemistry, Saunders Col. Publ., N.Y. 1995, D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed.,  W. H. Freeman and Co., N.Y. 2008.

 

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)

Czech

Literatura:

M. Kodíček, O. Valentová, R. Hynek: Biochemie. Chemický pohled na biologický svět.  VŠCHT Praha 2015

Kolektiv: Biochemie- základní kurz, UK, Praha 2009;

Z. Šípal a kol.: Biochemie, SPN, Praha, 1992;

J. M.Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry, 6th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2007;

D. Voet, J.G. Voet: Biochemistry, Wiley, N.Y. 1995 (český překlad Grada Praha, 1996);

R.H. Garrett, C.M. Grisham: Biochemistry, Saunders Col. Publ., N.Y. 1995,

D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed.,  W. H. Freeman and Co., N.Y. 2008.

 

 

 

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (08.02.2021)

Requirements to the exam

English

Credit: active participation in seminars, tests. For English-speaking students (Erasmus), specific conditions might be negotiated (because of their frequent later arrival).

Last update: Svášková Dagmar, RNDr., Ph.D. (22.02.2024)

Czech

K získání zápočtu ze cvičení musí být splněny obě následující podmínky:

1.   Domácí úkoly ≥ 60 % (Google Classroom).

2.   Zvládnutí průběžných testů (≥ 60 % souhrnem) nebo závěrečného zápočtového testu (≥ 60 %, možnost max. tří termínů).

Last update: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (28.04.2025)

Syllabus

English

Structure of living cell and biochemical function of organelles. Molecular components of cell (amino acids, peptides, proteins, carbohydrates, lipids, nucleic acids), their structure, chemical and biochemical properties. Enzymes - structure of enzyme molecule, enzyme properties, kinetics of enzyme reaction, regulatory enzymes. Basic biochemical methodology: arrangement of the work in biochemical laboratories, organization of chemical literature, evaluation of results. Isolation and purification of biomolecules, seperation methods, electromigration. Laboratory animals. Immmunochemical methods, microscopy.

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)

Czech

Biochemie - definice vědního oboru, typy organismů, morfologie buňky živočišné, rostlinné a mikrobiální, buněčné organely a jejich biochemická funkce.
Základní složky živé hmoty. Proteiny - kodové aminokyseliny, jejich chemické a fysikálně-chemické vlastnosti, peptidy. Primární, sekundární, terciární a kvarterní struktura proteinů, proteiny fibrilární a globulární. Nepeptidové složky proteinů. Vlastnosti proteinů, rozpustnost, elektrochemické vlastnosti, denaturace. Sacharidy - mono-, oligo- a polysacharidy, struktura a chemické vlastnosti. Deriváty sacharidů a jejich role v organismu. Lipidy - definice a biologická funkce, lipidy jednoduché, složené a isoprenoidní, stavba biologických membrán.
Enzymy. Klasifikace a názvosloví, struktura molekuly enzymu. Koenzymy. Kinetika enzymové reakce, metody určování kinetických parametrů, jednotka enzymové aktivity. Vlastnosti enzymů, inhibice a aktivace enzymů, vícesubstrátové reakce a regulační enzymy.
Základní biochemické metody: práce s biochemickou literaturou, vyhodnocování výsledků, zvláštnosti práce v biochemické laboratoři, voda a pomocné látky, pufry. Izolace biomolekul: desintegrace a homogenizace, extrakce, srážení. Separace podle velikosti částic (ultrafiltrace, dialýza). Chromatografické separační metody (přehled, rozdělení). Elektromigrační separační metody. Práce s laboratorními zvířaty. izolovanými orgány a tkáněmi, imunochemické metody (RIA, ELISA). Základy mikroskopie (základní pojmy, rozlišení, zvětšení, kontrastú. Optická mikroskopie (příprava preparátů, zvyšování kontrastu). Elektronová mikroskopie (transmisní a skanovací).

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)

Entry requirements

Základní znalosti obecné, anorganické a fyzikální chemie a základní matematické dovednosti (na úrovni kvalitního absolventa střední školy). 

Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)