The course is intended for students of "Clinical and toxicological analysis", it is the first half of a two-semester course.
Introduction, basic terms and principles of biochemistry. Biomolecules (proteins, saccharides, lipids and nucleic acids) - their structure and biochemical properties. Enzymes - properties, structure, coenzymes and cofactors. Bioenergetics - thermodynamic principles, macroergic compounds.
Basic methodology of biochemistry (isolation and purification of biomolecules, laboratory animals, immunochemical methods, microscopy
Lectures - in Czech (English possible).
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)
Tato přednáška je určena pro studenty KATA. Jedná se o první polovinu dvousemestrálního kursu.
Probíraná témata: Vymezení oboru biochemie, základní pojmy, struktura buňky, typy organismů dle trofiky. Základní složky živé hmoty (proteiny, sacharidy, lipidy a nukleové kyseliny) jejich struktura a funkce. Bioenergetika - termodynamika v organismech, makroergické sloučeniny. Enzymy - pojem koenzymu, vlastnosti enzymů, enzymová kinetika.
Základy práce v biochemické laboratoři, izolace biomolekul z biochemického materiálu. Práce s laboratorními zvířaty, imunochemické metody analýzy, základy mikroskopie optické a elektronové.
(Ve druhé části kursu jsou pak probírány základní principy metabolismu a základní metody charakterizace biomolekul.)
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)
Literature -
J. M.Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry, 6th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2007; D. Voet, J.G. Voet: Biochemistry, Wiley, N.Y. 1995; R.H. Garrett, C.M. Grisham: Biochemistry, Saunders Col. Publ., N.Y. 1995, D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2008.
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)
Literatura:
M. Kodíček, O. Valentová, R. Hynek: Biochemie. Chemický pohled na biologický svět. VŠCHT Praha 2015
Kolektiv: Biochemie- základní kurz, UK, Praha 2009;
Z. Šípal a kol.: Biochemie, SPN, Praha, 1992;
J. M.Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry, 6th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2007;
D. Voet, J.G. Voet: Biochemistry, Wiley, N.Y. 1995 (český překlad Grada Praha, 1996);
D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2008.
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (08.02.2021)
Requirements to the exam -
Credit: active participation in seminars, tests. For English-speaking students (Erasmus), specific conditions might be negotiated (because of their frequent later arrival).
Last update: Svášková Dagmar, RNDr., Ph.D. (22.02.2024)
K získání zápočtu ze cvičení musí být splněny obě následující podmínky:
1. Domácí úkoly≥ 60 %
V ZS 2024 je potřeba včas odevzdat alespoň 6 vypracovaných domácích úkolů (celkem 8), Google Classroom: https://classroom.google.com/c/NjI4ODAwOTg1MDA5?cjc=6x4hon2
2. Zvládnutí tří průběžných testů ≥ 60 % (souhrnem) nebo závěrečného zápočtového testu ≥ 60 % (možnost max. tří termínů).
Last update: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (10.04.2024)
Syllabus -
Structure of living cell and biochemical function of organelles. Molecular components of cell (amino acids, peptides, proteins, carbohydrates, lipids, nucleic acids), their structure, chemical and biochemical properties. Enzymes - structure of enzyme molecule, enzyme properties, kinetics of enzyme reaction, regulatory enzymes. Basic biochemical methodology: arrangement of the work in biochemical laboratories, organization of chemical literature, evaluation of results. Isolation and purification of biomolecules, seperation methods, electromigration. Laboratory animals. Immmunochemical methods, microscopy.
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)
Biochemie - definice vědního oboru, typy organismů, morfologie buňky živočišné, rostlinné a mikrobiální, buněčné organely a jejich biochemická funkce. Základní složky živé hmoty. Proteiny - kodové aminokyseliny, jejich chemické a fysikálně-chemické vlastnosti, peptidy. Primární, sekundární, terciární a kvarterní struktura proteinů, proteiny fibrilární a globulární. Nepeptidové složky proteinů. Vlastnosti proteinů, rozpustnost, elektrochemické vlastnosti, denaturace. Sacharidy - mono-, oligo- a polysacharidy, struktura a chemické vlastnosti. Deriváty sacharidů a jejich role v organismu. Lipidy - definice a biologická funkce, lipidy jednoduché, složené a isoprenoidní, stavba biologických membrán. Enzymy. Klasifikace a názvosloví, struktura molekuly enzymu. Koenzymy. Kinetika enzymové reakce, metody určování kinetických parametrů, jednotka enzymové aktivity. Vlastnosti enzymů, inhibice a aktivace enzymů, vícesubstrátové reakce a regulační enzymy. Základní biochemické metody: práce s biochemickou literaturou, vyhodnocování výsledků, zvláštnosti práce v biochemické laboratoři, voda a pomocné látky, pufry. Izolace biomolekul: desintegrace a homogenizace, extrakce, srážení. Separace podle velikosti částic (ultrafiltrace, dialýza). Chromatografické separační metody (přehled, rozdělení). Elektromigrační separační metody. Práce s laboratorními zvířaty. izolovanými orgány a tkáněmi, imunochemické metody (RIA, ELISA). Základy mikroskopie (základní pojmy, rozlišení, zvětšení, kontrastú. Optická mikroskopie (příprava preparátů, zvyšování kontrastu). Elektronová mikroskopie (transmisní a skanovací).
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)
Entry requirements - Czech
Základní znalosti obecné, anorganické a fyzikální chemie a základní matematické dovednosti (na úrovni kvalitního absolventa střední školy).
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (17.02.2014)
