SubjectsSubjects(version: 964)
Course, academic year 2024/2025
   Login via CAS
Practical course in biochemistry laboratory techniques - MC250C01
Title: Praktikum z laboratorní techniky biochemie
Czech title: Praktikum z laboratorní techniky biochemie
Guaranteed by: Department of Biochemistry (31-250)
Faculty: Faculty of Science
Actual: from 2024
Semester: winter
E-Credits: 6
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:0/4, C [HT]
Capacity: 89
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: Czech
Note: enabled for web enrollment
priority enrollment if the course is part of the study plan
Guarantor: RNDr. Helena Dračínská, Ph.D.
RNDr. Věra Černá, Ph.D.
Teacher(s): RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D.
RNDr. Věra Černá, Ph.D.
RNDr. Helena Dračínská, Ph.D.
doc. RNDr. Olga Heidingsfeld, CSc.
Mgr. Božena Kubíčková, Ph.D.
Mgr. Michaela Lichvárová
Ing. Adriana Osičková, Ph.D.
RNDr. Dagmar Svášková, Ph.D.
Incompatibility : MC240C22, MC240C22E, MC240C23, MC240C24, MC240C39, MC240C40, MC240C40E, MC240C86, MC250C01N
Is incompatible with: MC240C39, MC240C22E, MC250C01N, MC240C86, MC240C96
Is pre-requisite for: MC240C11M
In complex pre-requisite: MC250C09E, MC250C09N
Annotation -
The aim of the practical course is to familiarize students with the basic laboratory techniques used in the biochemical laboratory. Groundwork in weighing, work with automatical pipetts, preparation of solutions, measurement of pH, UV/VIS spectrophotometry, chromatography, centrifugation, organisation of the work in the biochemical laboratory.

Last update: Dračínská Helena, RNDr., Ph.D. (14.09.2015)
Literature -

Tutorials for the lab tasks with principles of the methods (in Czech). Available on SIS.

Last update: Dračínská Helena, RNDr., Ph.D. (29.10.2019)
Requirements to the exam - Czech

Podmínky získání zápočtu:

1.    vypracování a uznání všech úloh 

Vzhledem k časové náročnosti úloh je nutno do praktika přicházet včas a s řádnou přípravou v pracovním deníku. V případě pozdního příchodu nebo nedostatečné přípravy bude student z praktika vyloučen a úlohu vykoná v náhradním termínu (možno tolerovat maximálně dvakrát; při třetím vyloučení ztrácí student nárok na získání zápočtu). Daná úloha Vám bude uznána dle zpracování pracovního deníku a přístupu k práci s důrazem na dodržování laboratorního řádu a bezpečnosti práce. Závažné prohřešky proti laboratornímu řádu nebo bezpečnosti práce a další porušení pravidel bude řešeno vyloučením z praktik a neudělením zápočtu již v průběhu semestru.

2.    vypracování protokolů ze všech úloh a jejich schválení 

Protokoly ze všech úloh je nutno odevzdat vždy hned na další hodině, před vypracováním následující úlohy. Bez odevzdání protokolu z předchozí úlohy nelze v praktiku pokračovat. 

Vypracovaný protokol bude po kontrole vrácen studentovi k opravě. Opravy uvádějte pokud možno do stávajícího protokolu. Protokol doplněný o opravy (tedy včetně kompletní původní verze) je nutno odevzdat do dvou týdnů od navrácení. Ke každému kontrolovanému protokolu je možná pouze jedna oprava.

Opsaný protokol nebude uznán, a to i při pozdějším odhalení.

Pro udělení zápočtu musí student opravit všechny vrácené protokoly a mít na závěr uznaných alespoň 7 protokolů.

3.    absolvování zápočtového testu s úspěšností ≥ 60 % (max. 3 pokusy)

Test je možné absolvovat pouze po odevzdání protokolů ze všech úloh (není nutno, aby již byly zkontrolované).

 

Last update: Černá Věra, RNDr., Ph.D. (01.10.2024)
Syllabus -

Volume measuring, samples weighing

Solutions, dissolution, extraction

Chemical composition of biological material

Interaction of electromagnetic radiation with a matter

Spectrophotometry

Chromatography

pH and buffers

Protein assay

Isolation of plant DNA

Reversible and irreversible precipitation of proteins

Last update: Poljaková Jitka, RNDr., Ph.D. (07.02.2011)
Learning outcomes - Czech

Student dodržuje zásady bezpečnosti práce v biochemické laboratoři a laboratorní řád praktika.

Student samostatně provádí výpočty potřebné pro realizaci a vyhodnocení všech experimentů zahrnující základní techniky a postupy prováděné v praktiku (viz Sylabus, Návody a dále).

Student ovládá základní laboratorní dovednosti jako odměřování objemů a vážení, včetně práce s automatickými pipetami.

Student připravuje roztoky a provádí ředění podle stanovených zadání, přičemž chápe principy ředění a směšovacích rovnic.

Student vykonává spektrofotometrická měření v UV-VIS oblasti záření za dodržení všech náležitých podmínek.

Student aplikuje Lambert-Beerův zákon při spektrofotometrických měřeních pro stanovení koncentrace látek.

Student stanoví hmotnostní koncentraci bílkovin pomocí spektrofotometrie a vysvětlí souvislost mezi spektrálními vlastnostmi proteinů a jejich strukturou.

Student měří pH pomocí pH-metru, který kalibruje, a dbá na opatrnou manipulaci se skleněnou elektrodou.

Student připraví pufr o požadované koncentraci a pH, vysvětlí princip fungování pufrů a popíše význam pufrů v biochemických reakcích.

Student provádí separaci bílkovin a rozlišuje mezi reverzibilními a ireverzibilními procesy precipitace, včetně teoretického porozumění těchto metod.

Student využívá extrakční a chromatografické metody k separaci a analýze vzorků, vysvětlí princip dělení látek dle polarity a na základě výsledků posoudí účinnost použitých metod.

Student pracuje s centrifugou a rozumí principům separace na základě hustoty.

Student popíše a používá charakteristické reakce pro stanovení přírodních látek a jejich vlastností.

Student izoluje rostlinnou DNA jednoduchými postupy a aplikuje techniky pro její analýzu, přičemž rozumí teoretickým základům izolace nukleových kyselin. Ze spektrofotometrických dat zhodnotí kvalitu izolované DNA.

Student vede důkladnou laboratorní dokumentaci do pracovního deníku.

Student interpretuje výsledky experimentů a vypracovává protokoly o provedených pokusech.

Student vyhodnocuje výsledky všech úloh včetně statistického zpracování dat, analyzuje odchylky od očekávaných hodnot a diskutuje možné příčiny těchto odchylek na základě teoretických znalostí.

Student zpracovává naměřená data do grafů při dodržení zásad pro jejich sestrojování, data prokládá křivkami funkčních závislostí a používá je k vyhodnocení výsledků.

 

Last update: Dračínská Helena, RNDr., Ph.D. (23.01.2025)
Entry requirements - Czech

V ZS 2024 proběhnou úvodní hodiny 3. října 2024.

Úvodní hodiny se  konají v místnosti č. 201 - laboratoř Pokročilé praktikum BPP. Potrvají přibližně jednu vyučovací hodinu.

Studenti budou seznámeni s laboratorním řádem, bezpečností práce, organizací praktika a požadavky k úspěšnému splnění předmětu a rozdělí se do pracovních skupin. Účast na úvodní hodině je povinná, bez jejího absolvování nemohou studenti do praktika nastoupit.

Last update: Černá Věra, RNDr., Ph.D. (23.09.2024)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html