This course is designed to develop a working knowledge of reading and undertanding the scientific literature that
relates to various aspects of infection agents and relate them to human health. Students will read, understand,
interpret and critique primary scientific literature relating to the human pathogenic viruses, bacteria, fungi and
parasitc agenst in general. Students will deliver presentations, and answer questions
about the paper. They are expected to attend all Journal Club meetings on weekly basis, participate in discussion
and engage in critical questioning and scientific exchange.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Tento kurz je navržen tak, aby u studentů rozvinul praktické dovednosti v četbě a porozumění vědecké literatuře, která se týká různých aspektů infekčních agens a jejich souvislosti s lidským zdravím.
Studenti budou číst, interpretovat a kriticky hodnotit primární vědeckou literaturu zaměřenou obecně na lidské patogenní viry, bakterie, houby a parazitární agens.
Studenti budou prezentovat vybrané práce a odpovídat na otázky týkající se těchto článků. Očekává se, že se budou každý týden účastnit všech setkání v rámci „Journal Clubu“, zapojovat se do diskuzí, kritického dotazování a vědecké výměny poznatků.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Literature -
Current work published in prestigious scientific journals: http://www.ncbi.nlm.nih.gov
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Aktuální vydané práce v prestižních vědeckých časopisech.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Requirements to the exam -
Requirements for Completion
Mandatory attendance: A minimum attendance rate of 80% (at least 10 classes) is strictly required-- only specific, well-documented exceptions will be considered upon formal justification.
Evaluation of Assigned Tasks: The lead teacher will design specific tasks for each student (e.g presentaiton of figures results section 1 from the article) Failure to achieve the assigned objectives will result in a negative point. At the end of each session, a final point will be awarded to every student based on their performance and participationtudent in every class.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Povinná docházka: Je striktně vyžadována minimální účast 80 % (alespoň 10 lekcí). Pouze specifické a řádně doložené výjimky budou zohledněny na základě formálního zdůvodnění.
Hodnocení zadaných úkolů: Vedoucí učitel stanoví pro každou lekci konkrétní úkoly pro každého studenta (např. prezentace výsledků z obrázků v 1. sekci článku). Nesplnění zadaných cílů bude hodnoceno negativním bodem. Na konci každé hodiny bude každému studentovi přidělen výsledný bod na základě jeho výkonu a zapojení v dané lekci.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Syllabus -
This course consists of 13 sessions covering several specialties: virology, bacteriology, parasitology, and mycology. The entire curriculum is based on the critical discussion of high-impact research articles. The course is overseen by a Lead Teacher and supported by nine additional instructors/moderators with expertise in the aforementioned fields. Moderators are responsible for selecting the specific research articles for their respective sessions and defining the tasks for each student during their assigned 'Journal Club' day.
The Lead Teacher coordinates the entire course and will deliver the introductory lesson. This first session includes: 1) a course overview (where the article titles for the whole course will be provided to the students in an Excel table); 2) an explanation of the principal considerations for evaluating and critiquing scientific literature; and 3) a discussion of the first virology article, serving as a model for how students should analyze and present subsequent papers. Following this introduction, there will be two further sessions on virology, three on parasitology, three on bacteriology, and two on mycology. Furthermore, the final two classes will be dedicated to student-led presentations, where students will provide a full analysis of an article of their own selection under the supervision of the Lead Teacher.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Tento kurz se skládá ze 13 lekcí pokrývajících několik specializací: virologii, bakteriologii, parazitologii a mykologii. Celé kurikulum je založeno na kritické diskuzi nad vědeckými články s vysokým impaktem. Kurz je veden hlavním vyučujícím a podporován devíti dalšími instruktory/moderátory s odborností ve výše zmíněných oborech. Moderátoři jsou zodpovědní za výběr konkrétních výzkumných článků pro své příslušné lekce a za stanovení úkolů pro každého studenta během jimi určeného dne v rámci „Journal Clubu“.
Vedoucí výuky koordinuje celý kurz a povede úvodní lekci. Tato první hodina zahrnuje: 1) přehled kurzu (v rámci kterého studenti obdrží seznam titulů odborných článků pro celý semestr ve formě Excel tabulky); 2) vysvětlení hlavních zásad pro hodnocení a kritickou analýzu vědecké literatury; a 3) diskuzi nad prvním virologickým článkem, který poslouží jako vzor toho, jak by studenti měli analyzovat a prezentovat následné texty. Po tomto úvodu budou následovat dvě další lekce věnované virologii, tři parazitologii, tři bakteriologii a dvě mykologii. Závěrečné dvě hodiny budou věnovány prezentacím vedeným studenty, v nichž pod dohledem vedoucího výuky vypracují kompletní analýzu článku dle vlastního výběru.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
Learning outcomes -
After successful completion of the course, the student will be able to:
1. Critical Analysis of Scientific Literature
Deconstruct primary research articles to identify the core hypothesis, experimental design, and key findings.
Evaluate the validity of data and the strength of the conclusions drawn by the authors.
Identify limitations and potential biases in studies related to human pathogenic viruses, bacteria, fungi, and parasites.
2. Specialized Knowledge in Infectious Agents
Relate molecular and cellular mechanisms of infection to broader impacts on human health.
3. Scientific Communication and Presentation
Synthesize complex data from primary sources into a coherent and professional oral presentation.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (16.01.2026)
Po úspěšném absolvování kurzu bude student schopen:
1. Kritické analýzy vědecké literatury
Dekomponovat primární výzkumné články za účelem identifikace hlavní hypotézy, experimentálního designu a klíčových zjištění.
Vyhodnotit validitu dat a sílu závěrů vyvozených autory.
Identifikovat omezení a potenciální zkreslení (biases) ve studiích týkajících se lidských patogenních virů, bakterií, hub a parazitů.
2. Odborných znalostí v oblasti infekčních agens
Dát do souvislosti molekulární a celulární mechanismy infekce s jejich širšími dopady na lidské zdraví.
3. Vědecké komunikace a prezentace
Syntetizovat komplexní data z primárních zdrojů do koherentní a profesionální ústní prezentace.
Last update: Huerfano Meneses Sandra, Ph.D. (09.03.2026)
