The course is an optional extension of the basic lecture course "Fundamentals of Virology" MB140P75. Based on clinical examples, students will practice the subject matter and learn more. During the exercise students will also be able to look behind the scenes of the virology laboratory and try some basic laboratory approaches used in virology. The course will also provide information on the basics of work in the laboratory with a biosafety level of protection 2, which also allows work with human pathogens. Course participants will be able to test such work in a non-pathogenic virus - mouse polyomavirus and BK virus.
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
Cvičení je nepovinným rozšířením a zpestřením základního přednáškového kurzu "Základy virologie" MB140P75. Na příkladech ze života a klinické praxe si studenti procvičí probíranou látku a dozví se i něco navíc. V průběhu cvičení budou studenti moci také sami nahlédnout do zákulisí virologické laboratoře a vyzkoušet si některé základní laboratorní přístupy k virologii. Součástí kurzu bude i poučení o základech práce v laboratoři s technickou úrovní ochrany 2, která umožňuje i práci s lidskými patogeny. Účastníci kurzu si takovou práci budou moci vyzkoušet na nepatogenním modelu myšího polyomaviru lidského BK viru.
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
Literature -
Cann, A. Principles of Molecular virology 4th edition, Elsevier, 2005 for advanced readers: Knipe, Howley, Fields Virology 5th edition
Last update: Schierová Michaela, RNDr., Ph.D. (24.10.2019)
Pro všechny: Cann, A. Principles of Molecular virology 4th edition, Elsevier, 2005 (Základní a stručný přehled virologie; K dispozici v knihovně Viničná 7, stejně jako starší, ale stále platné 3. vydání) Pro zvídavé: Knipe, Howley, Fields Virology 5th edition (Rozsáhlá dvoudílná příručka pokrývající všechny virové čeledi; k dispozici v knihovně Viničná 7)
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
Requirements to the exam -
The course-unit credit is awarded for participation, completion of the task and completion of protocols. PROTOCOLS ARE SUBMITTED BY EVERY PRACTICAL PARTICIPANT
Last update: Schierová Michaela, RNDr., Ph.D. (24.10.2019)
Zápočet je udělován za účast, vykonání úlohy a vyplnění protokolů. PROTOKOLY ODEVZDÁVÁ KAŽDÝ ÚČASTNÍK PRAKTIKA.
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
Syllabus -
The lectures are given in Czech language only.
During the one-day exercise, all students will try to determine the number of viral particles by hemagglutination, PCR determination of viral DNA, immunodetection on the membrane
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
V průběhu jednodenního cvičení si všichni studenti vyzkouší určení počtu virových částic pomocí hemaglutinace, PCR k určení virové DNA, imunodetekce na membráně.
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
Learning outcomes - Czech
Po úspěšném absolvování předmětu student …
Definuje základní pojmy obecné a klinické virologie související s laboratorní diagnostikou (hemaglutinace, virový titr, PCR, imunofluorescence, imunodetekce na membráně) a popíše jejich princip.
Vyjmenuje základní součásti virologické laboratoře se stupněm biologické bezpečnosti 2 a popíše zásady bezpečné práce s lidskými patogeny na nepatogenním modelu.
Identifikuje vhodný typ laboratorní metody (hemaglutinační test, PCR, imunofluorescence, imunodetekce) pro daný typ vzorku a virové onemocnění a uvede konkrétní příklad použití z klinické praxe.
Popíše krok za krokem postup hemaglutinačního testu pro stanovení počtu virových částic a seřadí jednotlivé fáze experimentu do logické posloupnosti.
Aplikuje zvolenou metodu (PCR, imunofluorescenci nebo imunodetekci na membráně) při zpracování modelového virologického vzorku (např. myší polyomavirus / BK virus) podle daného laboratorního protokolu.
Interpretuje výsledky hemaglutinačního testu a vybrané doplňkové metody (PCR, imunofluorescence, imunodetekce) ve vztahu k přítomnosti viru a odvodí z nich orientační virovou nálož.
Porovná principy, citlivost a specifitu hemaglutinačního testu, PCR, imunofluorescence a imunodetekce na membráně a rozliší situace, ve kterých je jednotlivé metody vhodné použít.
Provede rozbor příčin a následků chyb při provádění virologických experimentů (např. kontaminace, špatné ředění, nesprávná interpretace aglutinace/fluorescenčního signálu) a navrhne způsoby jejich minimalizace.
Kategorizuje vyšetřované metody podle typu detekovaného cíle (antigen, nukleová kyselina, funkční aktivita viru) a uvede vztahy mezi typem metody, rychlostí vyšetření a informační hodnotou pro klinickou praxi.
Zváží výhody a nevýhody použitých laboratorních metod v kontextu rutinní diagnostiky (časová náročnost, materiálové náklady, potřeba vybavení, nároky na obsluhu) a zhodnotí a zdůvodní, kterou metodu by preferoval v konkrétním modelovém případě.
Provede shrnutí průběhu a výsledků dvoudenního cvičení formou stručného laboratorního protokolu a propojí experimentální zjištění s teoretickými poznatky z kurzu „Základy virologie“.
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (23.01.2026)
Entry requirements -
TO WORK IN course lab, IT IS NECESSARY TO HAVE laboratory clothes and shoes WITH YOU;
Last update: Schierová Michaela, RNDr., Ph.D. (24.10.2019)
PRO PRÁCI V PRAKTIKU JE NUTNÉ MÍT S SEBOU PLÁŠŤ A PŘEZUVKY, BEZ TĚCHTO PROPRIETN NEBUDETE DO PRAKTIKA VPUŠTĚNI.
Last update: Fraiberk Martin, Mgr., Ph.D. (21.02.2023)
