One-week practical course aims at introduction to basic methods of molecular biology and provides both practical
and theoretical training in laboratory. The selected experiments allow students to practice basic methods of
molecular biology used in the field of DNA and protein research.
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (17.05.2021)
Týdenní praktický kurz molekulární biologie je zaměřen na představení základních metod molekulární biologie.
Vybrané úlohy umožní studentům procvičit si základní metody používané při výzkumu DNA a proteinů.
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (17.05.2021)
Learning outcomes -
1. Practical Skills (Hands-on)
Objectives for your laboratory work:
Demonstrate manual dexterity: Work with micropipettes with high precision, even when pipetting viscous solutions and sensitive enzymes.
Prepare gels: Independently assemble the apparatus and pour both agarose and polyacrylamide gels without bubbles.
Maintain sterility: Apply the principles of aseptic technique.
Isolate nucleic acids:
Perform the isolation of genomic DNA from biological material.
Obtain plasmid DNA using the alkaline lysis method.
Master the instrumentation: Correctly set up and safely operate the thermocycler, electrophoresis power supplies, and electroporator.
2. Understanding
Understand what you are doing:
Distinguish separation principles: Explain the difference between DNA and protein separation.
Justify reaction conditions: Describe the function of individual components in the PCR mixture and the significance of temperatures.
Clarify transformation: Explain the principle of electroporation and the necessity of selection pressure for plasmid maintenance.
3. Analytical and Interpretative Outcomes
Evaluate your results:
Analyze the electrophoretogram:
Determine the size of DNA and protein fragments by comparison with a marker.
Identify plasmid forms on the gel.
Control quality:
Diagnose the PCR result.
Critically evaluate DNA purity.
Calculate: Calculate transformation efficiency based on electroporation results.
4. Organizational and Safety Outcomes
Manage your work:
Coordinate experiments: Plan your time effectively to complete all steps within the given timeframe.
Maintain a laboratory notebook: Record all steps accurately and legibly.
Last update: Čáp Michal, RNDr., Ph.D. (08.01.2026)
1. Praktické dovednosti (Hands-on)
Cíle pro vaši práci v laboratoři:
Prokažte manuální zručnost: Pracujte s mikropipetami s vysokou přesností a to i při pipetování viskózních roztoků a citlivých enzymů.
Připravte gely: Samostatně sestavte aparaturu a bez bublin nalijte agarózový i polyakrylamidový gel.
Dodržujte sterilitu: Aplikujte zásady aseptické práce
Izolujte nukleové kyseliny:
Proveďte izolaci genomové DNA z biologického materiálu.
Získejte plazmidovou DNA metodou alkalické lýze
Ovládněte přístroje: Správně nastavte a bezpečně obsluhujte termocykler, zdroje napětí pro elektroforézu a elektroporátor.
2. Porozumění
Pochopte, co děláte:
Rozlište principy separace: Vysvětlete rozdíl mezi separací DNA a proteinů.
Zdůvodněte reakční podmínky: Popište funkci jednotlivých složek v PCR směsi a význam teplot.
Objasněte transformaci: Vysvětlete princip elektroporace a nutnost selekčního tlaku pro udržení plazmidu.
3. Analytické a interpretační výstupy
Vyhodnoťte své výsledky:
Analyzujte elektroforetogram:
Určete velikost fragmentů DNA a proteinů porovnáním s markerem.
Identifikujte na gelu formy plazmidu.
Kontrolujte kvalitu:
Diagnostikujte výsledek PCR
Kriticky zhodnoťte čistotu DNA
Počítejte: Vypočtěte transformační účinnost na základě výsledků elektroporace.
4. Organizační a bezpečnostní výstupy
Řiďte svou práci:
Koordinujte experimenty: Efektivně plánujte čas, abyste stihli všechny kroky v daném čase.
Veďte si laboratorní deník: Zapisujte přesně a čitelně všechny kroky.
Last update: Čáp Michal, RNDr., Ph.D. (08.01.2026)
