Practical courses of bacterial physiology - MB140C34
Title: Praktikum z fyziologie bakterií
Czech title: Praktikum z fyziologie bakterií
Guaranteed by: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
Faculty: Faculty of Science
Actual: from 2023
Semester: winter
E-Credits: 3
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:0/1, C [TS]
Capacity: 20
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: Czech
Level: basic
Explanation: jednotýdenní turnusové praktikum (celkem 2 turnusy po 10 lidech),termín bude určen v průběhu semestru, zápis do turnusů proběhne přes SIS
Note: enabled for web enrollment
Guarantor: doc. RNDr. Radovan Fišer, Ph.D.
Teacher(s): RNDr. Tereza Dolejšová, Ph.D.
doc. RNDr. Radovan Fišer, Ph.D.
RNDr. Petra Lišková, Ph.D.
Mgr. Irena Vopálenská, Ph.D.
Co-requisite : MB140P34
Opinion survey results   Examination dates   WS schedule    E-learning course
Annotation -
The laboratory course consists of the spectrum of basic and  advanced  methods used in physiology of bacteria  to
characterize  bacterial growth, metabolic variability and regulation of gene expression in response to the environmental
condition. The course is held in Czech.
Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)
Literature -

Mikrobiologické praktikum, František Kaprálek, 1999, Karolinum

Practical course manuals (updated version will be available in advance, before the course start). (in Czech language)

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (03.10.2012)
Requirements to the exam -

To obtain credits for this course, the requirements are following: 100% presence during the course run, correctly elaborated protocols (electronic version, handover in the last day of the course run).

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (05.04.2012)
Syllabus -

Within the one week course four experiments will be performed:
1. Growth yield and metabolic rate measurement in growing bacterial culture; effect of energy metabolism type on growth rate, growth yield and metabolic rate of bacterial culture.
2. Induction of enzyme synthesis in growing bacteria and catabolic repression.
3. Measurement of protein and RNA level in a bacterial cell

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (18.05.2015)
Entry requirements - Czech

Kurz je rozšířením předmětu Fyziologie bakterií (MB140P34; korekvizita), nicméně není k této přednášce povinný. Je určen pro studenty se zájmem o mikrobiologii. Podmínkou je dřívejší absolvování předmětu Mikrobiologie MB140P33I! Kapacita předmětu je 20 osob a nemůže být z technických důvodů navýšena.

Pro účast v praktiku je podmínkou složení vstupního testu - termín bude s předstihem oznámen.

Protokoly se odevzdávají v elektronické podobě ve formátech *.doc, *.odt nebo *rtf. Předpokládá se tedy nejméně slušná uživatelská znalost příslušného textového editoru. Rovněž je nutná znalost tvorby grafů (MS Excel, OpenOffice). Některými daty se prokládá přímka pomocí funkce lineární regrese. K tomu lze použít následující programy: MS Excel, Gnumeric, Origin, Qtiplot, Fityk, Gnuplot nebo R (OpenOffice nemusí vyhovět).
Odkazy na dostupný software: http://projects.gnome.org/gnumeric/, http://soft.proindependent.com/qtiplot.html, http://fityk.nieto.pl/, http://www.gnuplot.info/, http://www.r-project.org/

Během praktika lze s výhodou používat vlastní notebook pro průběžné zpracování dat. (Vlastní notebook není podmínkou. Studenti bez vlastní výpočetní techniky mohou protokoly zpracovávat v počítačových účebnách PřF.)

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)