SubjectsSubjects(version: 978)
Course, academic year 2025/2026
   
Biochemistry and biotechnology of algae - MB120P55
Title: Biochemie a biotechnologie řas
Czech title: Biochemie a biotechnologie řas
Guaranteed by: Department of Botany (31-120)
Faculty: Faculty of Science
Actual: from 2025 to 2025
Semester: winter
E-Credits: 3
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:2/0, Ex [HT]
Capacity: unlimited
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: Czech
Note: enabled for web enrollment
the course is taught as cyclical
Guarantor: doc. RNDr. Yvonne Němcová, Ph.D.
Teacher(s): doc. RNDr. Yvonne Němcová, Ph.D.
RNDr. Martina Pichrtová, Ph.D.
Class: Vzduchotěsné komory pro izotopové značení
Annotation -
Please note, the lectures are given in Czech language only. Basic metabolic processes and their specificity in cyanobacteria and algae, the use of metabolic products, cultivation under laboratory conditions and large-scale cultivation, bioremedition and environmental biotechnology.
Last update: Kubátová Gabriela, PhDr., Ph.D. (14.04.2006)
Literature - Czech

Becker, E. W. (1994): Microalgae: biotechnology and microbiology, Cambridge University Press, 293 pp.

Cresswell, R. C.; Rees, T.A.W.; Shah, N. (1989): Algal and Cyanobacterial Biotechnology, Longman Scientific and Technical, Harlow, 341 pp.

Cohen, Z. (1999): Chemicals from microalgae, London, 419 pp.

Richmond, A. (2004): Handbook of Microalgal Culture. Biotechnology and Applied Phycology, Blackwell Publishing, 566pp.

Last update: YNEMCOVA (08.03.2007)
Requirements to the exam - Czech

Zkouška probíhá ústní formou.

Last update: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (01.12.2011)
Syllabus - Czech

1.      Úvod - využití komerčně pěstovaných řas, systémy produkující řasy, kultivační média, biologické principy velkoplošné kultivace, výběr kmenů, růstová kinetika, odhad řasové biomasy.  Velkoplošné kultivace mikrořas - uzavřené tubulární systémy, bioreaktory a fermentory, kultivační nádrže a jejich typy, evaporace, míchání, přísun CO2, vliv pH, kontaminace, sklízení, sušení, výtěžek.

2.      Marikultury - kultivace makrořas (seaweed industry) - agarofyty, karagenofyty, alginofyty; metody sběru přírodních populací, kultivace. Agar, karagen, alginát - chemická struktura, výroba, využití. Makrořasy jako potravina (např. Porphyra, Ulva, Laminaria, Saccharina). Další využití makrořas.

3.      Fotosyntéza - zopakování základních procesů, zvláštnosti u různých skupin sinic a řas, fotosyntetické pigmenty, fotorespirace, chlororespirace, mechanismy zvyšování koncentrace dostupného CO2, fluorescence chlorofylu a její využití pro studium fotosyntetické aktivity.

4.      Praktická část: I. část - výroba alginátu (alginát sodný a alginát vápenatý, imobilizace řasových buněk do alginátu); II. část soutěž o nejlepší jídlo (nápoj) z makrořas, prezentace přinesených pokrmů, hodnocení porotou (tvořenou všemi přítomnými).

5.      Transport, fixace a asimilace dusíkatých látek - příjem N látek, transport a redukce nitrátů, fixace atmosférického dusíku u některých sinic, fotoprodukce dusíkatých látek, N2 fixující sinice jako biohnojiva rýžových polí; polysacharidy - polysacharidy buněčné stěny, zásobní polysacharidy; polyhydroxyalkanoáty, degradovatelné plasty.

6.      Lipidy a mastné kyseliny (PUFAs) z řas. Biopaliva - řasy jako obnovitelný zdroj energie, produkce vodíku a metanu, algenany.

7.      Biotechnologicky významné mikroorganismy: Botryococcus, Dunaliella, Haematococcus, Arthrospira (Spirulina), Porphyridium, Nostoc, Chlorella, produkce mikrořas pro akvakultury (např. Nannochloropsis) - morfologie, biologicky aktivní látky a jejich (potencionální) využití, velkoplošné kultivace, produkty z řas, výživná hodnota, stravitelnost, toxikologické studie.

8.      Prezentace článků. 

9.      Toxiny sinic a řas: alkaloidní neurotoxiny sinic, alkaloidní hepatotoxiny sinic, peptidické hepatotoxiny sinic, paralytic shellfish poisoning (PSP), diarrhetic shellfish poisoning (DSP), neurotoxic shellfish poisoning (NSP), amnestic shellfish poisons, Ciguatera (CSP), fylogeneze obrněnek a produkce toxinů, toxiny makrořas.

10.  Chemická obrana řas ve vztahu k predaci a kompetici, invazní potenciál chemicky bránících se tropických makrořas, chemická komunikace, sexuální hormony řas, živiny jako chemoatraktanty, ovlivnění morfogeneze, thallusin produkovaný bakteriemi

11.  Chemická obrana temperátních a polárních řas, dimethylsulfopropionát, obranné strategie zahrnující bromidy (bromoform)

12.  Hormony, bioluminiscence u obrněnek

Last update: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2023)
Learning outcomes -

Upon successful completion of the course, the student is able to:

Knowledge

  • Explain the basic biology, ecology and evolutionary significance of algae and cyanobacteria (microalgae and macroalgae), including their role in global biogeochemical cycles.
  • Describe key metabolic processes in algae and cyanobacteria (photosynthesis, nitrogen metabolism, synthesis of lipids, polysaccharides and secondary metabolites).
  • Characterize the main classes of biomolecules produced by algae (polysaccharides, lipids, fatty acids, PHAs, pigments, toxins) and their biological functions.
  • Distinguish major groups of cyanobacterial and algal toxins, their producers, mechanisms of action, and associated health and environmental risks.
  • Explain the principles of chemical defence, chemical communication and chemical ecology of algae, including the role of DMSP and its breakdown products.

Skills

  • Apply knowledge of algal physiology and biochemistry to interpret growth, biomass production and accumulation of target compounds under different environmental conditions.
  • Compare different algal cultivation strategies (open vs. closed systems) and evaluate their advantages and limitations.
  • Analyse the effects of environmental factors (light, nutrients, temperature, salinity) on biomass composition, metabolite production and toxin formation.
  • Interpret experimental and field data related to herbivory, chemical defence, toxicity and ecological interactions.
  • Assign specific algal species or groups to appropriate biotechnological applications (food, feed, bioactive compounds, biofuels, materials).

Competences

  • Evaluate the importance of algae and cyanobacteria for biotechnology, nutrition, environmental protection and sustainable development.
  • Assess ecological, health, technological and legislative risks associated with the use of algal products.
  • Integrate biological, chemical and ecological knowledge when addressing problems related to algal production and utilisation.
  • Critically assess the potential of algal technologies in the context of current environmental and climate challenges.
Last update: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (16.12.2025)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html