Please note that the course runs in the Czech language only. There is a parallel course in English (MB120P188 Introduction to data analysis in ecology) - if you are interested in the English version of the course, please consider enroling into that.
Last update: Herben Tomáš, prof. RNDr., CSc. (08.09.2023)
Přednáška chce poskytnout přehled základních statistických technik pro zpracování ekologických dat na uživatelské úrovni. Snaží se intuitivně vysvětlit smysl, povahu a možnosti používaných metod a ilustrovat je příklady. (Viz. syllabus níže.) Klade si v zásadě tři cíle:
(*) naučit základy statistického uvažování (modelování, odhadu parametrů a testování)
(*) ilustrovat to na příkladech lineárních modelů jako statistických přístupů první volby, jednoduchých a obecně používaných
(*) pojmenovat, jaké problémy se jednoduchými lineárními modely řešit nedají, a odkázat na specializované přednášky/materiály
Přednáška běží v pondělí od 12,20 v posluchárně B14. Rozpis přednášek je na Moodlu přednášky pod starým kódem MB120P31. Každá přednáška je věnována jednomu okruhu v analýze dat a jejich zpracování; snažíme se, aby na začátku každé přednášky bylo krátké shrnutí obsahu přednášky předcházející, jednak pro zopakování, a pak pro snazší navázání nového tématu. Na přednáškách se střídáme dva přednášející, Tomáš Herben a Jiří Hadrava, nicméně budeme se snažit co nejvíc o jednotnost podání i stylu. Přednášky nepoužívají prezentace, ale přednášíme s křídou a tabulí (resp. fixem a bílou tabulí), nicméně ke všem přednáškám prezentace existují. Budeme je zveřejňovat vždycky před přednáškou, (nejpozději) v pondělí ráno; bude velmi praktické, pokud je budete mít na přednášce k disposici (ať už elektronicky nebo vytištěné) – občas na ně budeme činit odkazy.
Součástí přednášky jsou praktika na zpracování dat v prostředí R. Ta koncipujeme tak, aby účastníkům stačila zcela minimální úroveň znalosti "Rka", a současně k tomu nabízíme dvě procvičovací lekce tohto prostředí, takže po absolvování kurzu s praktiky účastníci získají nejen znalost základů statistického uvažování a analýzy dat, ale i základní dovednosti s jazykem R.
Všechna cvičení jsou dvě plné hodiny (nikoliv dvě vyučovací hodiny). Materiály jsou stejné pro všechny paralelky a budou postupně zveřejňovány na Moodlu přednášky, zpravidla opět v pondělí příslušného týdne ráno. Praktika koncipujeme především jako pomůcku pro Vás, která Vás má provést ilustrací materiálu probíraného na přednáškách a řešením praktických příkladů z přednášky vycházejících (proto se snažíme o maximální možnou návaznost praktik na přednášky). Účast na nich proto není podmínkou k udělení zápočtu (ale je velmi silně doporučená!).
V akad. roce 2024/25 přednášejí Tomáš Herben a Jiří Hadrava, praktika vedou Tomáš Herben, Vojtěch Abraham, Jana Duchoslavová, Jiří Hadrava a Tomáš Jor. První přednáška je již 30.9.! První cvičení jsou také v týdnu od 30.9.
Podrobnější informace o předmětu naleznete (až v posledním týdnu v září - zatím tam jsou loňské materiály, které se mohou trochu změnit) na Moodlu (http://dl2.cuni.cz/) pod starým kódem MB120P31. V tom týdnu též rozešleme podrobnější informační email. (Další organizační informace budou na první přednášce, čili podle možnosti na ni prosím přijďte.)
Last update: Herben Tomáš, prof. RNDr., CSc. (17.10.2024)
Literature -
Recommended textbooks:
Lepš J.: Biostatistika. - Skripta BF JčU.
Sokal a Rohlf: Biometry. - W.H. Freeman, San Francisco.
Crawley M.J. (2013): The R book. - 2nd ed. John Wiley & Sons, Chichester.
Dalgaard P. Introductory Statistics with R. - Springer.
Last update: Janovský Zdeněk, RNDr., Ph.D. (25.10.2019)
Doporučená základní literatura:
Lepš J.: Biostatistika. - Skripta BF JčU.
Sokal a Rohlf: Biometry. - W.H. Freeman, San Francisco.
Crawley M.J. (2013): The R book. - 2nd ed. John Wiley & Sons, Chichester.
Dalgaard P. Introductory Statistics with R. - Springer.
Last update: Janovský Zdeněk, RNDr., Ph.D. (17.09.2020)
Requirements to the exam -
Last update: Herben Tomáš, prof. RNDr., CSc. (08.09.2023)
Zkouška - písemný doplňovací test teoretických znalostí (8 otevřených otázek za každou je možno získat až 4 body, tedy celkem lze získat max. 32 b.). Ke složení zkoušky je poteba získat alespoň 50 % bodů. Podmínkou pro zkoušku je absolvování zápočtu z praktik.
Zápočet - sestává z vyřešení dílčích příkladů z jednotlivých okruhů. Ty jsou řešeny formou dvou průběžných testů. Z průběžných testů je potřeba získat alespoň 65 % bodů. Více informací na Moodle předmětu (pod starým kódem MB120P31).
Last update: Herben Tomáš, prof. RNDr., CSc. (31.08.2024)
Syllabus -
See Introduction to data analysis in ecology, MB120P188
Last update: Herben Tomáš, prof. RNDr., CSc. (08.09.2023)
Rozvržení témat přednášky z Biostatistiky a plánování ekologických pokusů
(pro aktuální rozvržení přednášek s daty prosím zkoumejte stránku přednášky na Moodlu (pod starým kódem MB120P31). Tam jsou rovněž prezentace k jednotlivým přednáškám.
(1) Vlastnosti proměnných, deskriptivní statistika
(2) Vztahy dvou proměnných, základy teorie pravděpodobnosti (parametry rozdělení apod.)
(3) Základy statistické inference, pojem stupňů volnosti, t-test
(4) Základy statistického modelování, lineární regrese
(5) Formulace a testování hypotéz, analýza variance
