Statistics in biology and design of ecological experiments - MB120P147

• Title: Biostatistika a plánování ekologických pokusů
• Guaranteed by: Department of Botany (31-120)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2017
• Semester: winter
• E-Credits: 5
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:2/2, C+Ex [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: cancelled
• Language: Czech
• Additional information: http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=106
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc.
• Incompatibility : MB120P31
• Pre-requisite : MS710P09
• Is incompatible with: MB120P163

Annotation

English

Last update: Mgr. Michal Štefánek (26.06.2014)

Please note, the lectures are given in Czech language only.

Introduction to data analysis and experimental design for ecologists. Principles of parameter estimation and inference in statistics. Analysis of variance, simple one-way analysis, two-way analysis, multiple comparisons. Repeated measurements, nested designs, variance components. Linear regression analysis, parameter estimation, analysis of residuals, data transformation. Regression and correlation. Analysis of frequencies: contingency tables, log-linear models. Data in space and time - autocorrelation. Principles of design of ecological experiments. Guide to software available for statistical analysis.

Czech

Last update: Mgr. Jana Duchoslavová (02.10.2016)

Přednáška chce poskytnout přehled běžných statistických technik pro zpracování ekologických dat pro uživatele. Snaží se intuitivně vysvětlit smysl, povahu a možnosti používaných metod a ilustrovat je příklady. Součástí přednášky jsou praktika na zpracování dat. Absolvování praktik a splnění zápočtu je podmínkou pro konání zkoušky.

V letošním roce přednášejí Tomáš Herben a Zdeněk Janovský, praktika vedou Zdeněk Janovský (úterý) a Jana Duchoslavová (středa). První přednáška i první cvičení jsou v týdnu od 3. 10.

Podrobné informace o praktikách (a perspektivně i dalších věcech) naleznete na Moodlu (http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=106).

Literature

Last update: Mgr. Michal Štefánek (26.06.2014)

Doporučená základní literatura:

Lepš J. Biostatistika. Skripta BF JčU.

Sokal a Rohlf: Biometry. W.H. Freeman, San Francisco.

Crawley M.J. (2013): The R book. 2nd ed. John Wiley & Sons, Chichester.

Dalgaard P. Introductory Statistics with R. Springer.

Requirements to the exam

Last update: prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. (16.09.2014)

Písemný doplňovací test teoretických znalostí.

Podmínkou pro zkoušku je absolvování zápočtu z praktik, jež sestává z vyřešení dílčích příkladů z jednotlivých okruhů.

Syllabus

Last update: prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. (19.10.2015)

Podrobný syllabus (zejména s důrazem na praktika) je na Moodlu (Zatím pro starý kód přednášky, ale je to totéž.) 

http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=106

 

Praktika jsou dvouhodinova (nikoli dve vyucovaci, ale 120 minut), cili v utery i ve stredu pobezi jen jeden blok praktik.

 

Sylabus je v přiloženém souboru.

 

Přehled pojednávaných témat:

 

Úvod, typy biologických veličin, zásady odběru vzorků, typy statistických problémů

Odhady průměru, střední chyba, interval spolehlivosti

Zásady statistického rozhodování: formulace a testování hypotéz, chyba I a II druhu, hladina signifikance

Analýza variance: úvod, jednofaktorová ANOVA, dvoufaktorová ANOVA, interakce

Analýza variance: pokračování (pevné a náhodné efekty, opakovaná měření, split-plot designs)

Regrese a korelace: úvod, typy problémů, způsoby odhadu parametrů modelu, analýza residuálů, regresní modely

Regrese a korelace: pokračování. korelační problém, mnohonásobná regrese, korelace, analýza kovariance

Analýza frekvencí: kontingenční tabulky, logistická regrese.

Úvod do zobecnělých lineárních modelů.

Přehled testů na různé typy ekologických problémů. Jaké další problémy jsou časté a nejsou pokryté touto přednáškou

Základy plánování ekologických pokusů

Úvod do analýzy dat v čase a prostoru: pojem autokorelace

 

 

Další informace: www.natur.cuni.cz/~herben/biostat.html