Genetic methods in anthropology - MB110P98

• Title: Genetické metody v antropologii
• Czech title: Genetické metody v antropologii
• Guaranteed by: Department of Anthropology and Human Genetics (31-110)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2019
• Semester: winter
• E-Credits: 2
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:0/4, C [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: not taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Pavlína Daňková, Ph.D.

Annotation

Last update: doc. RNDr. Petr Sedlak, Ph.D. (15.05.2012)

Výběrový kurz je určen zájemcům o speciální přístupy aplikované v molekulární antropologii, která se často potýká s nedostatkem a nízkou kvalitou vstupního materiálu zpracovávaného pro genetickou analýzu, zejména při analýze aDNA nebo forenzních aplikacích. Studenti se naučí používat genetické analýzy a porozumí jejich významu v rámci dalších multidisciplinárních odvětví, jako jsou archeozoologie, palaeopatologie, archeologie, forenzní vědy, palaeobotanika a palaeontologie.

Literature

Last update: doc. RNDr. Petr Sedlak, Ph.D. (15.05.2012)

PÄÄBO, S. 1985b. Preservation of DNA in ancienit Egyptian mummies. Journal of Archaeological Science. 12:411-417.

PÄÄBO, S. 1985a. Molecular cloning of ancient Egyptian mummy DNA. Nature. 314:644-45

PÄÄBO, S. 1986. Molecular genetic investigations of ancient human remains. Cold Spring Haarbor Symposium on Quantum Biology. 51:441-46

KING, C., DEBRUYNE, R., KUCH, M., SCHWARZ, C., POINAR, H. 2009. A quantitative approach to detect and overcome PCR inhibition in ancient DNA extracts. Biotechniques. Nov;47(5):941-9.

Syllabus

Last update: doc. RNDr. Petr Sedlak, Ph.D. (15.05.2012)

1. Zdroje lidské DNA - buňky/tkáně. Základy správné manipulace se vzorkem a dobrá laboratorní praxe při práci s antropologickým materiálem

2. Extrakce a purifikace DNA z různých tkání (krev/bukální stěr/krevní skvrna/vlasová cibulka/zub/kost/konzervovaná tkáň) - srovnání více typů extrakcí

3. PCR (klasická, nested, multiplex)

4. gDNA a mtDNA analýzy (restrikční analýza DNA; separace DNA fragmentů na agarózových a polyakrylamidových gelech; fragmentační analýza; sekvenování; kvantitativní PCR; …), detekce DNA patogenů

5. Analýza dat