SubjectsSubjects(version: 964)
Course, academic year 2024/2025
   Login via CAS
Biophysics - GF389
Title: Biofyzika
Guaranteed by: Department of Biophysics and Physical Chemistry (16-16110)
Faculty: Faculty of Pharmacy in Hradec Králové
Actual: from 2024
Semester: winter
Points: 0
E-Credits: 4
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:28/0, Ex [HS]
Capacity: unknown / unknown (unknown)
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
Is provided by: GB057
Note: course can be enrolled in outside the study plan
enabled for web enrollment
Guarantor: Mgr. Monika Kuchařová, Ph.D.
Interchangeability : GF174
Is interchangeable with: GF174
Annotation -
Biophysics provides students with a basic view of the structure of matter and its properties from a physical point of view. The aim of the course is to equip students with the necessary theoretical knowledge, which is also important for describing the behaviour of various dosage forms in the body, and also introduces them to the biophysical principles of physiological processes of the human body. The knowledge obtained is in accordance with the requirements of follow-up courses and pharmaceutical practice. The topics are selected so that students can use the knowledge gained here in other subjects of study, especially in physical chemistry, pharmaceutical technology or analytical chemistry. Biophysics as a preparatory subject provides an optimal theoretical basis for the education of students at the Faculty of Pharmacy of Charles University across all areas of their studies. Topics: structure of matter, states of matter and intermolecular forces, radioactivity, dosimetry – biological effects of ionizing radiation, radiation risks, free radicals, introduction to thermodynamics - gases, thermodynamics I - thermodynamic laws, phase equilibrium, one-, two- and multicomponent systems, thermodynamics II - chemical equilibrium, fluid mechanics, hydrodynamics, mechanics of solids, basics of rheology
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (20.09.2024)
Course completion requirements -

The subject Biophysics is finished by the final exam. The examination is performed in the written form. The examination consists of 50 questions selected from the topics of individual lectures. The condition for successful examination is to gain the minimal 30 points from all questions. 

Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (20.09.2024)
Literature - Czech

Doporučená:

  • Moodle_kurz biofyzika [online]. Dostupné z: https://dl1.cuni.cz/
  • Studijní materiály [online]. Dostupné z: https://intranet.faf.cuni.cz/Studijni-materialy/KBFCH/
  • Navrátil L., Rosina J. a kol.. Medicínská biofyzika. Praha: Grada, 2005, s. ISBN 80-247-1152-4.
  • Glaser Roland. Biophysics. New York: Springer, 2012, s. ISBN 978-3-662-49596-4.
  • Kuchařová, Monika, Bárta, Pavel, Nováková, Veronika. Praktická cvičení z biofyziky. Praha: Karolinum, 2021, 50 s. ISBN 978-80-246-4987-0.
  • Breviář z fyzikální chemie [online]. Dostupné z: https://ufch.vscht.cz/files/uzel/0013876/BREVALL.pdf?redirected
  • Vacík, Jiří. Obecná chemie. Praha: Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy, 2017, 283 s. ISBN 978-80-7444-050-2.
  • Atkins Peter, de Paula Julio.. Fyzikální chemie. : Vysoká škola chemicko - technologická, , s. ISBN 9788070808306..

Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (20.09.2024)
Syllabus -

 Structure of matter

Forms of matter, force interactions, particles of matter, structure of atom, physico - chemical properties of molecules and their structure, biopolymers and their structure, dispersion systems and their properties

State of matter and intermolecular forces

Description of gases, liquids and solids from the point of view of the atomic hypothesis, properties of gases, liquids and solids, influence of intermolecular interactions on states of matter

 Radioactivity

Definition, characterization, radioactive decay process, activity, physical half-life, proton/nucleon number, isotope, isobar, isotone, isomer, radioactive decay, types of radioactive radiation, interaction of ionizing radiation with nuclei and shells of atoms, nuclear reactions

Dosimetry – biological effects of ionizing radiation

Characterization of the response of living systems to radiation, direct and indirect effects of radiation, radiosensitivity, deterministic and stochastic effects of radiation, dosimetric definitions

Free radicals

Definition, formation and radical chemistry, reactive oxygen species, reactive nitrogen species, oxidative stress

Dosimetry – radiation risks

Strategies of protection against ionizing radiation, dose limits, personal dosimeters and detectors of ionizing radiation, possibilities of using radionuclides in therapy and diagnostics, methods of obtaining radionuclides

Introduction to Thermodynamics – gases

Temperature, properties of gases (ideal gas, real gases), pressure, Boyle's law, Charles' law, ideal gas equation of state, heat, work, compression/expansion of ideal gas-isothermal reversible, against constant pressure, adiabatic, Carnot cycle

Thermodynamics I – thermodynamic laws

Types of thermodynamic systems, energy transfer, 0. thermodynamic law, temperature, state functions, 1. thermodynamic law, concept of internal energy and enthalpy, heat capacity, Hess's law, standard state, 2. thermodynamic law, concept of entropy, reversible and irreversible processes, general equilibrium conditions, Gibbs and Helmholtz energy, combined formulations of 1st and 2nd law of thermodynamics, 3. law of thermodynamics

Phase equilibria, one-component systems

Gibbs' law of phases, one-component systems, phase diagram, Clausius-Clapeyron equation

Phase equilibria, two- and more-component systems

Two-component systems, Dalton's law, Henry's law, solid-solvent solubility, Raoult's law and its applications, colligative properties, cryoscopy and ebulioscopy, osmotic pressure, three-component systems, Nernst's partition law, extraction, thermal analysis - differential scanning calorimetry

Thermodynamics II – chemical equilibria

Gibbs energy reaction, chemical equilibrium, reaction isotherm, activity, equilibrium constant, dependence of equilibrium constant on temperature, van ́t Hoff's equation

Mechanics of fluids, hydrodynamics

Physical properties of fluids, classification of fluids, flow of ideal and real fluids, equations for ideal and Newtonian fluids, viscosity, equation describing the flow of real liquids

Mechanics of solids, basics of rheology

Physical properties and structure of solids, classification of solid bodies, deformation and mechanical stress, load curve, importance of rheology, rheological division of solids, rheological elementary bodies and rheological models, creep curves

 

Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (24.09.2024)
Learning resources - Czech

https://intranet.faf.cuni.cz/Studijni-materialy/KBFCH/?path=biofyzika

E-learning Moodle: Biofyzika

https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=3609

Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (20.09.2024)
Learning outcomes - Czech

  

Studující se po absolvování předmětu Biofyzika orientuje a rozumí problematice struktury hmoty na atomární úrovni, pochopí rozdíly ve struktuře a vlastnostech jednotlivých stavů hmoty a vliv těchto rozdílů na molekulové vlastnosti. Má přehled o typech silových interakcí mezi atomy a chápe strukturu a z ní vyplývající vlastnosti biologických sloučenin. Ví co jsou volné radikály, zná jejich nejvýznamnější představitele a odvodí jejich negativní vliv na živé organismy. Rozumí a umí vysvětlit pojmy související s radioaktivitou, umí popsat principy všech typů radioaktivních přeměn a interakcí radioaktivního záření s atomovými obaly, vysvětlí jakým způsobem dochází ke tvorbě brzdného a charakteristického RTG záření. Orientuje se v problematice radiačních rizik, ví jakým způsobem lze odstínit záření α, β a γ včetně volby materiálu. Zná možnosti vstupu zdroje ionizujícího záření do organismu a možnosti ochrany organismu. Popíše smysl dávkových limitů, zná zásady radiační ochrany pracovníků. Definuje pojem radiofarmaka a odvodí jejich využití v praxi. Popíše princip radionuklidového generátoru, urychlovače částic a jaderného reaktoru. Chápe princip biologických účinků záření, popíše pojmy deterministické a stochastické účinky záření, ví co je absorbovaná, ekvivalentní a efektivní dávka. Chápe základní pojmy v termodynamiky. Na základě chování velkého souboru částic hmoty dokáže predikovat některé makroskopické aspekty chování systému. Porozumí základním termodynamickým zákonům, kterými se řídí veškeré chemické, biologické a fyzikální děje. Chápe v souvislostech veličiny vnitřní energie, entalpie, entropie, Gibbsova energie. Rozumí pojmu Helmholtzova energie, pochopí princip fázových přeměn z pohledu termodynamiky. Má přehled o fázových rovnováhách nejjednodušších soustav. Získá základní vědomosti o termodynamických fázových rovnováhách a chování vícesložkových anebo vícefázových systémů významných pro farmacii. Získá základní vědomosti o chemické rovnováze a spontánnosti chemických reakcí. Pochopí souvislosti chemické rovnováhy a hodnoty standardní reakční Gibbsovy energie. Porozumí rovnovážné konstantě a její závislosti na teplotě. Umí definovat kapalinu, rozumí základním zákonům hydrostatiky a chápe jejich aplikaci v měření hustoty látek. Popíše proudění ideálních a reálných kapalin a zná zákony popisující proudící kapaliny. Chápe rozdíl mezi vlastnostmi a chováním ideální, newtonovské a nenewtonovské kapaliny. Chápe co je viskozita kapalin a rozumí principům jejího měření pomocí různých typů viskozimetrů a odvodí její význam pro farmaceutickou technologii. Umí definovat pevná tělesa a jejich vnitřní strukturu. Rozumí pojmům mechanické napětí, deformace. Rozumí pojmům elastická, plastická, viskózní a viskoelastická látka. Umí načrtnout zatěžovací křivku a popsat její typické úseky. Ví co je reologie, jaké jsou její postupy a význam pro popis mechanického chování materiálů, zejména biologických.

 

Výsledky učení:

Studující na základě získaných znalostí a dovedností:

Ø  definují základní pojmy témat stavy hmoty, volné radikály, radioaktivita, radiační rizika, biologické účinky záření, termodynamika, mechanika kapalin, mechanika pevných těles

Ø  pochopí rozdíly ve struktuře a vlastnostech jednotlivých stavů hmoty a vliv těchto rozdílů na molekulové vlastnosti.

Ø  orientují se v termodynamických zákonech, chápou přeměny energie a vlastnosti látek při různých teplotách a tlacích

Ø  vypočítají v příkladech po zadání hodnot potřebných veličin hustotu pevné látky a kapaliny, dynamickou viskozitu kapaliny

Ø  vysvětlí principy metod pro měření hustoty pevných látek a kapalin a viskozity kapalin

Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (04.04.2025)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html