Introduction to applied bioinformatics - GDPX09

• Title: Základy praktické bioinformatiky
• Guaranteed by: Department of Biochemical Sciences (16-16160)
• Faculty: Faculty of Pharmacy in Hradec Králové
• Actual: from 2019
• Semester: both
• Points: 0
• E-Credits: 0
• Examination process: oral
• Hours per week, examination: 0/0, Ex [HT]
• Capacity: winter:unknown / unknown (unknown); summer:unknown / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: not taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Note: course is intended for doctoral students only; you can enroll for the course in winter and in summer semester
• Guarantor: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D.
• Interchangeability : GDXP09
• Is interchangeable with: GDXP09

Annotation

English

Bioinformatics is interdisciplinary field of science dealing with storage, classification, analysis and interpretation of biological data. In the subject Introduction to Applied Bioinformatics students learn about possibilities how to find and use bioinformatic databases and tools. This subject is focused mainly on practical usage and training of various web based programs and software tools. Topics include scientific literature search, databases of protein and nucleotide sequences, sequences comparison and their feature analysis, restriction analysis, primer design, specialized databases, etc.

Last update: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)

Czech

Bioinformatika je mezioborová disciplína zabývající se ukládáním, tříděním, analýzou a interpretací souborů biologických dat. V rámci předmětu Základy praktické bioinformatiky se studenti dozvědí o možnostech využití dostupných bioinformatických databází a programů. Prakticky se studenti naučí vyhledávat informace a sekvenční data a seznámí se s možnostmi jejich využití. Tento předmět je založen hlavně na praktické práci u počítače a samostatném vyzkoušení různých webových aplikací. Probíraná témata zahrnují: vyhledávání literatury, databáze proteinových a nukleotidových sekvencí, porovnávání sekvencí a analýza jejich vlastností, hledání podobných sekvencí, restrikční analýza, návrh primerů, specializované databáze atd.

Last update: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)

Literature

English

Recommended:

• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..
• null. . In Claverie, Jean-Michel Notredame, Cedric. Bioinformatics for dummies . Hoboken: Wiley Publishing, 2007, s. -. ISBN 0-470-08985-7..
• null. . In Zvelebil, Marketa J. Baum, Jeremy O.. Understanding bioinformatics . New York: Garland Science, Group, 2008, s. -. ISBN 978-0-8153-4024-9..

Last update: prepocet_literatura.php (14.08.2025)

Czech

Doporučená:

• null. . In Cvrčková, Fatima. Úvod do praktické bioinformatiky . Praha: Academia, 2006, s. -. ISBN 80-200-1360-1..
• null. . In Claverie, Jean-Michel Notredame, Cedric. Bioinformatics for dummies . Hoboken: Wiley Publishing, 2007, s. -. ISBN 0-470-08985-7..
• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..
• null. . In Zvelebil, Marketa J. Baum, Jeremy O.. Understanding bioinformatics . New York: Garland Science, Group, 2008, s. -. ISBN 978-0-8153-4024-9..

Last update: prepocet_literatura.php (14.08.2025)

Requirements to the exam

English

Practical test by computer of practical knowledge of the subject with the possibility to use gained materials.

Last update: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)

Czech

"Písemná" zkouška u počítače. Praktické splnění zadaných úkolů.

Last update: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)