On Saturday 19th October 2024 there will be a shutdown of some components of the information system. Especially the work with files in Thesis modules will be particularly unavailable. Please postpone your requests for a later time.
The course Biophysics provides students with a basic view of the structure of matter and its properties from a physical point of view. The aim of the course is to equip students with the necessary theoretical knowledge, which is also important for describing the behaviour of various dosage forms in the body, and also introduces them to the biophysical principles of physiological processes of the human body. The content of the course also aims to teach students the basics of laboratory technology, including the correct habits for conducting experiments, to familiarize them with instruments for measuring fundamental physical properties and to teach them the basics of scientific work. The topics are selected so that students can use the knowledge gained here in other subjects of study. Biophysics as a preparatory subject provides an optimal theoretical and experimental basis for the education of students at the Faculty of Pharmacy of Charles University across all areas of their studies.
Topics: Structure of matter, states of matter and intermolecular forces, radioactivity, dosimetry - biological effects of ionizing radiation, risks of radiation, free radicals, introduction to thermodynamics, gases, thermodynamics I – thermodynamic laws, phase equilibrium, one-, two- and multi-component systems, thermodynamics II – chemical equilibrium, fluid mechanics, hydrodynamics, solid mechanics, basics of rheology
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (18.09.2024)
Předmět biofyzika poskytuje studentům základní pohled na strukturu hmoty a její vlastnosti z fyzikálního hlediska. Cílem předmětu je vybavit posluchače potřebnými teoretickými znalostmi, které jsou důležité i pro popis chování různých lékových forem v organismu, a dále je seznamuje s biofyzikálními principy fyziologických procesů lidského těla. Náplň předmětu si také klade za cíl naučit posluchače základům laboratorní techniky včetně správných návyků pro vedení experimentů, seznámit je s přístroji pro měření fundamentálních fyzikálních vlastností a naučit je základům vědecké práce Obdržené znalosti jsou v souladu s požadavky navazujících předmětů a laboratorní praxe. Témata jsou vybírána tak, aby znalosti zde získané mohli studenti využít v dalších předmětech studia. Biofyzika jako přípravný předmět poskytuje optimální teoretický i experimentální základ pro vzdělávání studentů na Farmaceutické fakultě Univerzity Karlovy napříč všemi úseky jejich studia.
Témata: struktura hmoty, stavy hmoty a mezimolekulové síly, radioaktivita, dozimetrie -biologické účinky ionizujícího záření, rizika záření, volné radikály, úvod do termodynamiky- plyny, termodynamika I- termodynamické zákony, fázové rovnováhy, jedno-, dvou- a vícesložkové soustavy, termodynamika II- chemické rovnováhy, mechanika kapalin, hydrodynamika, mechanika pevných látek, základy reologie
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (18.09.2024)
Course completion requirements -
The conditions for the credit granted is fulfillment of following duties:
1. Completion of all tasks in the practical exercises that the students are assigned according to the schedule. Tasks missed for any reason must be made up by the specified deadlines.
2. Successful submission of the protocols from completed tasks.
The subject Biophysics is finished by the final exam. The examination is performed in the written form. The examination consists of 50 questions selected from the topics of individual lectures.The condition for successful examination is to gain the minimal 30 points from all questions.
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (18.09.2024)
Podmínkou udělení zápočtu je splnění následujících podmínek:
1. Absolvování všech úloh v praktických cvičeních, které posluchači přísluší podle rozvrhu. Úlohy zameškané z jakéhokoli důvodu je třeba nahradit ve zvlášť určených termínech.
2. Úspěšné odevzdání protokolů z absolvovaných úloh.
Podmínkou úspěšného zakončení předmětu je složení zkoušky. Ta se skládá z 50 otázek, které jsou vybírány z témat jednotlivých přednášek. Na tyto otázky studenti odpovídají písemně. K úspěšnému složení zkoušky je potřeba získat alespoň 30 bodů z celkového počtu 50 bodů.
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (18.09.2024)
Literature -
Recommended:
Glaser Roland. Biophysics. New York: Spriger, 2012, s. ISBN 978-3-662-49596-4.
Atkins Peter, de Paula Julio. Fyzikální chemie. Praha: Vysoká škola chemicko - technologická , 2013, s. ISBN 9788070808306.
Vacík Jiří. Obecná chemie. : , , s. ISBN 9788074440502.
Last update: prepocet_literatura.php (19.09.2024)
Syllabus -
Structure of matter
Forms of matter, force interactions, particles of matter, structure of atom, physico - chemical properties of molecules and their structure, biopolymers and their structure, dispersion systems and their properties
State of matter and intermolecular forces
Description of gases, liquids and solids from the point of view of the atomic hypothesis, properties of gases, liquids and solids, influence of intermolecular interactions on states of matter
Radioactivity
Definition, characterization, radioactive decay process, activity, physical half-life, proton/nucleon number, isotope, isobar, isotone, isomer, radioactive decay, types of radioactive radiation, interaction of ionizing radiation with nuclei and shells of atoms, nuclear reactions
Dosimetry – biological effects of ionizing radiation
Characterization of the response of living systems to radiation, direct and indirect effects of radiation, radiosensitivity, deterministic and stochastic effects of radiation, dosimetric definitions
Strategies of protection against ionizing radiation, dose limits, personal dosimeters and detectors of ionizing radiation, possibilities of using radionuclides in therapy and diagnostics, methods of obtaining radionuclides
Introduction to Thermodynamics – gases
Temperature, properties of gases (ideal gas, real gases), pressure, Boyle's law, Charles' law, ideal gas equation of state, heat, work, compression/expansion of ideal gas-isothermal reversible, against constant pressure, adiabatic, Carnot cycle
Thermodynamics I – thermodynamic laws
Types of thermodynamic systems, energy transfer, 0. thermodynamic law, temperature, state functions, 1. thermodynamic law, concept of internal energy and enthalpy, heat capacity, Hess's law, standard state, 2. thermodynamic law, concept of entropy, reversible and irreversible processes, general equilibrium conditions, Gibbs and Helmholtz energy, combined formulations of 1st and 2nd law of thermodynamics, 3. law of thermodynamics
Phase equilibria, one-component systems
Gibbs' law of phases, one-component systems, phase diagram, Clausius-Clapeyron equation
Phase equilibria, two- and more-component systems
Two-component systems, Dalton's law, Henry's law, solid-solvent solubility, Raoult's law and its applications, colligative properties, cryoscopy and ebulioscopy, osmotic pressure, three-component systems, Nernst's partition law, extraction, thermal analysis - differential scanning calorimetry
Thermodynamics II – chemical equilibria
Gibbs energy reaction, chemical equilibrium, reaction isotherm, activity, equilibrium constant, dependence of equilibrium constant on temperature, van ́t Hoff's equation
Mechanics of fluids, hydrodynamics
Physical properties of fluids, classification of fluids, flow of ideal and real fluids, equations for ideal and Newtonian fluids, viscosity, equation describing the flow of real liquids
Mechanics of solids, basics of rheology
Physical properties and structure of solids, classification of solid bodies, deformation and mechanical stress, load curve, importance of rheology, rheological division of solids, rheological elementary bodies and rheological models, creep curves
Practical trainings
Measurement of density
Measurement of viscosity
Measurement of heat
Determination of the relative molecular weight by Rast method
Phase equilibria
Spectrophotometry
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (24.09.2024)
Struktura hmoty
Formy hmoty, silové interakce, částice hmoty, stavba atomu, fyzikálně-chemické vlastnosti molekul a jejich struktura, biopolymery a jejich struktura, disperzní soustavy a jejich vlastnosti
Stav hmoty a mezimolekulové síly
popis plynů, kapalin a pevných látek z pohledu atomové hypotézy, vlastnosti plynů, kapalin a pevných látek, vliv mezimolekulových interakcí na stavy hmoty
Radioaktivita
Definice, charakterizace, proces radioaktivní přeměny, aktivita, fyzický poločas, protonové/nukleonové číslo, izotop, izobar, izoton, izomer, radioaktivní přeměna, typy radioaktivního záření, interakce ionizujícího záření s jádry a obaly atomů, jaderné reakce
Dozimetrie – biologické účinky ionizujícího záření
Charakterizace odpovědi živých systémů na záření, přímé a nepřímé efekty záření, radiosensitivita, deterministické a stochastické účinky záření, dozimetrické definice
Volné radikály
Definice, tvorba a radikálová chemie, reactive oxygen species, reactive nitrogen species, oxidativní stres
Dozimetrie – rizika záření
Strategie ochrany před ionizujícím zářením, dávkové limity, osobní dozimetry a detektory ionizujícího záření, možnosti využití radionuklidů v terapii a diagnostice, způsoby získávání radionuklidů
Úvod do termodynamiky – plyny
Teplota, vlastnosti plynů (ideální plyn, reálné plyny), tlak, Boyleův zákon, Charlesův zákon, stavová rovnice ideálního plynu, teplo, práce, komprese/expanse ideálního plynu-izotermická reverzibilní, proti konstantnímu tlaku, adiabatická, Carnotův cyklus
Termodynamika 1 – termodynamické zákony
Typy termodynamických systémů, transfer energie, 0. termodynamický zákon, teplota, stavové funkce, 1. termodynamický zákon, pojem vnitřní energie a entalpie, tepelné kapacity, Hessův zákon, standardní stav, 2. termodynamický zákon, pojem entropie, vratné a nevratné děje, obecná podmínky rovnováhy, Gibbsova a Helmholtzova energie, spojené formulace 1. a 2. věty termodynamické, 3. termodynamický zákon
Fázové rovnováhy, jednosložkové soustavy
Gibbsův zákon fází, jednosložkové soustavy, fázový diagram, Clausiova-Clapeyronova rovnice
Fázové rovnováhy, dvou a vícesložkové soustavy
Dvousložkové soustavy, Daltonův zákon, Henryho zákon, rozpustnost tuhých látek, soustava tuhá látka – rozpouštědlo, Raoultův zákon a jeho využití, koligativní vlastnosti, kryoskopie a ebulioskopie, osmotický tlak, třísložkové soustavy, Nernstův rozdělovací zákon, extrakce, termická analýza- diferenční skenovací kalorimetrie
Termodynamika 2 - chemické rovnováhy
Gibbsova energie reakce, chemická rovnováha, reakční izoterma, aktivita, rovnovážná konstanta, závislost rovnovážné konstanty na teplotě, van´t Hoffova rovnice
Mechanika kapalin, hydrodynamika
Fyzikální vlastnosti kapalin, klasifikace kapalin, proudění ideálních a reálných kapalin, rovnice pro ideální a newtonovské kapaliny, viskozita, rovnice popisující proudění reálných kapalin
Mechanika pevných látek, základy reologie
Fyzikální vlastnosti a struktura pevných látek, klasifikace pevných těles, deformace a mechanická namáhání, zatěžovací křivka, význam reologie, reologické rozdělení těles, reologická elementární tělesa a reologické modely, křivky toku
Praktická cvičení z biofyziky
Měření hustoty
Měření viskozity
Kalorimetrická měření
Kryoskopie
Fázové rovnováhy
Spektrofotometrická měření
Last update: Kuchařová Monika, Mgr., Ph.D. (24.09.2024)
