Methods for Identifying Natural Compounds II - GAPL009

• Title: Metody identifikace přírodních látek II.
• Guaranteed by: Department of Organic And Bioorganic Chemistry (16-16120)
• Faculty: Faculty of Pharmacy in Hradec Králové
• Actual: from 2024
• Semester: summer
• Points: 0
• E-Credits: 5
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:14/28, C+Ex [HS]
• Capacity: unknown / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: cancelled
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Guarantor: doc. PharmDr. Mgr. Martin Krátký, Ph.D.

Annotation

Předmět Metody identifikace přírodních látek II. je koncipován jak teoreticky (prohloubení znalostí spektrálních metod, zejm. nukleární magnetické rezonance, dále MS, IR a dalších metod používaných v komplexní analýze chemických struktur); tak prakticky (vyhodnocování NMR, IR, MS, … dat s důrazem na identifikaci neznámých sloučenin přírodních látek, správnou interpretaci a zápis charakterizace dle vědeckých standardů). Studenti absolvující tento předmět získají průpravu pro následující vědeckou činnost (zpracování diplomové práce, postgraduální studium, …) i budoucí kariéru.

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (14.01.2025)

Course completion requirements

Podmínky pro udělení zápočtu

aktivní účast na seminářích (max. 2 omluvené absence; na určených seminářích, které budou specifikovány před začátkem semestru, účast 100%)

vypracování zadaných úkolů v průběhu seminářů

identifikace neznámé sloučeniny ze zadaných spektrálních dat v rámci závěrečného kolokvia

Podmínky pro udělení zkoušky

Zkouška se skládá z písemné a ústní části. Podmínkou připuštění k ústní zkoušce je zisk 70 % bodů z písemného testu (kvízové otázky, vždy jedna odpověď správná). Ústní část zkoušky je založena na rozboru spektrálních dat neznámé sloučeniny a identifikace její struktury.

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (07.01.2025)

Literature

Povinná:

• Waisser, Karel, Pour, Milan. Fyzikální metody organické chemie. Praha: Karolinum, 2016, s. ISBN 978-80-246-3097-7.

Doporučená:

• Robert M. Silverstein, Francis X. Webster, David J. Kiemle. Spectrometric Identification of Organic Compounds. : , , s. ISBN 978-0471393.
• Dračinský Martin. NMR spektroskopie pro chemiky. Praha: Nakladatelství Karolinum, 2021, s. ISBN 9788074440854.
• Christine K. F. Hermann, Terence C. Morrill, Ralph L. Shriner, Reynold C. Fuson. The systematic identification of organic compounds. New York: John Wiley & Sons, 2023, 704 s. ISBN 492140427.

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (17.01.2025)

Teaching methods

Přednášky:

• teoretická příprava k seminářům, vybraná témata zajištěna externími přednášejícími (X-Ray)

Semínáře:

• teoretická část
• praktická část - identifikace a zápis spekter; využití studijních opor, charakterizace neznámých sloučenin s využitím spetrálních metod

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (14.01.2025)

Requirements to the exam

Zkouška se skládá z písemné a ústní části. Podmínkou připuštění k ústní zkoušce je zisk 70 % bodů z písemného testu (kvízové otázky z probrané tematiky, vždy jedna odpověď správná). Ústní část zkoušky je založena na rozboru spektrálních dat neznámé sloučeniny a identifikace její struktury.

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (14.01.2025)

Syllabus

Teoretická část:

• Základní vlastnosti látek, separace a izolace
• Nukleární magnetická rezonance
• Další metody – IR, MS, HR-MS, CHN-analýza, polarimetrie, teplota tání, …
• X-Ray krystalografie, difrakce
• EMS, cirkulární dichroismus
• Identifikace chirálních sloučenin

Praktická část:

• Interpretace 1D NMR dat, 2D NMR dat
• Interpretace IR dat. Interpretace CHN dat, MS, HR-MS dat
• Interpretace dalších dat (chirální látky, výpočet otáčivosti, dr, de, er, ee, apod.)
• Využití spektrálních metod pro identifikaci neznámých sloučenin
• Charakterizace sloučenin – zápis spektrálních dat

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (14.01.2025)

Learning resources

Studijní materiály dostupné na intranetu fakulty.

Interaktivní webová aplikace NMR Challange dostupná zde: NMR Challenge

Last update: Matouš Petr, PharmDr., Ph.D. (07.01.2025)

Learning outcomes

Studující na základě získaných znalostí a dovedností

• definují význam NMR v analýze přírodních látek

• definují význam dalších technik (IR, MS, X-Ray, polarimetrie) v analýze přírodních látek

• vyhodnotí spektrální data a na jejich základě určí strukturu jednoduché sloučeniny

• aplikují základní principy na identifikaci opticky aktivních látek

• zapíší plnou charakterizaci sloučeniny podle vědeckých standardů

• orientují se v lineárním (textovém) zápisu spektrálních dat, dokáží tento zápis analyzovat a získat potřebné informace

Last update: Krátký Martin, doc. PharmDr. Mgr., Ph.D. (21.03.2025)