|
|
|
||
|
The course will provide students with a detailed introduction to mass spectrometry, which is now an essential method in many analytical laboratories, including those involved in the identification of natural substances. Lectures will address theoretical aspects of ionization methods, analyzers, coupling mass spectrometry with separation techniques, and interpretation of recordings. Work with records will also be practiced in the form of seminars accompanied by practical examples for solutions. In practical exercises, students will then experience working with different types of mass spectrometers.
Last update: Nováková Lucie, prof. PharmDr., Ph.D. (04.02.2025)
|
|
||
|
Practical training
1. Completion of all practical trainings. 2. Basic theoretical knowledge of the tasks to be performed, which will be tested by the teacher at the beginning or during the practical exercise. 3. Observance of safety rules when working in the laboratory. 4. Handing in the reports of all practical exercises.
Seminars 1. Completion of all seminars. 2. Completion of the tasks defined in the seminars.
Exam 1. Examination in the subject takes place on the dates announced in the Study System, the start and venue are always specified. 2. Credit for practical exercises is required for the examination. 3. The examination is written, the examination topics are available in Study Materials. Last update: Nováková Lucie, prof. PharmDr., Ph.D. (04.02.2025)
|
|
||
|
Přednáškové okruhy:
1) Úvod do předmětu, definice základních pojmů Hmotnostní spektrometrie, důležité historické milníky, základní součásti hmotnostního spektrometru, specifika laboratoře pro provoz hmotnostní spektrometrie, hmotnostní spektrum, izotopové zastoupení prvků v přírodě
2) Ionizační techniky v hmotnostní spektrometrii Teorie, historie a vývoj spojení separačních technik s hmotnostní spektrometrií Typy ionizačních technik – měkké, tvrdé, další rozdělování ionizačních technik. EI, CI – podrobný princip a možnosti využití.
3) Ionizační techniky za atmosférického tlaku ESI, APCI, APPI – podrobný princip a možnosti využití.
4) Ambientní ionizační techniky Trendy ve vývoji ionizačních technik. DESI, DART, REIMS - podrobný princip a možnosti využití, imaging, MALDI.
5) Analyzátory v hmotnostní spektrometrii I. Definice parametrů pro hmotnostní analyzátory - citlivost, rozlišení a správnost hmoty. Různé typy dělení hmotnostních analyzátorů. Průletové analyzátory – kvadrupól, TOF, magnetický analyzátor Pasťové analyzátory: iontové pasti, orbitální past, ICR Tandemová hmotnostní spektrometrie. Hybridní hmotnostní analyzátory (Q-TOF, Q-IT….)
6) Typy záznamů v hmotnostní spektrometrii MS mód: MS sken, SIM, MS/MS mód: SRM, sken produktových a prekurzorových iontů, sken neutrálních ztrát, separace pomocí iontové mobility
7) Spojení hmotnostní spektrometrie se separačními technikami I. HPLC-MS, SFC-MS – typy ionizačních technik, typy interface, praktická realizace
8) Spojení hmotnostní spektrometrie se separačními technikami II. GC-MS, CZE-MS – typy ionizačních technik, typy interface, praktická realizace
9) Přístupy pro kvantifikaci látek s využitím hmotnostní spektrometrie Metoda vnějšího a vnitřního standardu z hlediska hmotnostní spektrometrie. Metoda přídavku standardu. Správná volba vnitřního standardu. Matricové efekty. Cílená a necílená analýza.
10) Interpretace hmotnostních spekter – tvrdé ionizační techniky Pravidla pro interpretaci EI spekter. Praktické ukázky.
11) Přístupy pro identifikaci látek s využitím hmotnostní spektrometrie Identifikace látek v MS a HRMS. Databáze, objasňování struktur látek. Kalibrace hmot, měření spekter v HRMS. Interpretace hmotnostních spekter – měkké ionizační techniky
12) Aplikace hmotnostní spektrometrie – malé molekuly Příklady využití MS z oblasti farmaceutické analýzy, bioanalýzy, dopingové kontroly
13) Aplikace hmotnostní spektrometrie – proteomika Specifika využití MS v analýze biomolekul ze skupiny proteinů
14) Aplikace hmotnostní spektrometrie v omics sciences Specifika využití MS v metabolomice, s důrazem na rostlinnou metabolomiku Last update: Nováková Lucie, prof. PharmDr., Ph.D. (04.02.2025)
|
|
||
|
Předmět Hmotnostní spektrometrie navazuje na znalosti a dovednosti získané v předmětech Organická chemie a Instrumentální metody. Studující po absolvování předmětu umí použít následující termíny (včetně jejich běžně užívaných zkratek) ve správném kontextu směrem k hmotnostní spektrometrii a jejím aplikacím: hmotnostní spektrometr a jeho komponenty, interní a externí kalibrace hmotnostního spektrometru, hmotnostní spektrum, izotopové zastoupení, ionizační techniky (EI, CI, ESI, APCI, APPI, DESI, DART, MALDI), hmotnostní analyzátory (kvadrupól, TOF, magnetický analyzátor, iontová past, orbitrap, ICR), tandemová hmotnostní spektrometrie (MS/MS), hybridní hmotnostní spektrometry (Q-TOF, Q-IT), HPLC-MS, GC-MS, CE-MS, metoda vnějšího a vnitřního standardu, metabolomika, proteomika, HRMS, kalibrace hmot, databázové vyhledávání struktur, cílená a necílená analýza. Výsledky učení: Studující na základě získaných znalostí a dovedností:
Last update: Nováková Lucie, prof. PharmDr., Ph.D. (10.03.2025)
|