SubjectsSubjects(version: 964)
Course, academic year 2024/2025
   Login via CAS
DNA/RNA Sequencing Technology and Bioinformatics - EDPLM002
Title: Technologie DNA a RNA sekvenace a bioinformatika
Guaranteed by: Department of science and research (14-260)
Faculty: Faculty of Medicine in Pilsen
Actual: from 2023
Semester: winter
Points: 0
E-Credits: 0
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:6/3, C [HS]
Capacity: unknown / unknown (unknown)
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
For type:  
Guarantor: prof. Ing. Jaroslav Hrabák, Ph.D.
Annotation - Czech
Kurz povede k rozvoji znalostí v oblasti moderních sekvenačních technik, tj. celogenomové sekvenaci na různých
platformách (2., 3. generace). Rovněž se bude věnovat sekvenaci RNA s cílem stanovení exprese proteinů.
Nedílnou součástí analýzy dat jsou i bioinformatické přístupy. Kurz se uskutečňuje jedenkrát za rok v anglickém
jazyce. Zápočet je udělen za účast.
Last update: Vyzrálová Daniela, Ing. (06.11.2018)
Literature - Czech

Patrick Murray Ken Rosenthal Michael Pfaller: Medical Microbiology, 2016, ISBN: 9780323299565

Fournier PE, Drancourt M, Colson P, Rolain JM, La Scola B, Raoult D. Modern clinical microbiology: new challenges and solutions. Nat Rev Microbiol. 2013 Aug;11(8):574-85.

Last update: Vyzrálová Daniela, Ing. (06.11.2018)
Syllabus - Czech

Sekvenační techniky nukleových kyselin ovlivňují řadu medicínských oborů, mikrobiologii nevyjímaje. V rámci předmětu budou shrnuty možnosti sekvenace DNA a RNA, počínaje sekvenováním první generace až po sekvenace dlouhých fragmentů DNA. Studenti budou mít možnost se s těmito technikami seznámit i prakticky. Důraz bude věnován především celogenomové sekvenaci mikrobiálního genomu (bakterie, viry, mikromycety), včetně analýz mobilních genetických elementů (především plazmidů). Posluchači budou seznámeni s možnostmi bioinformatické analýzy dat, včetně různých softwarových nástrojů.

Last update: Vyzrálová Daniela, Ing. (06.11.2018)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html