OS - Data analysis in R and selected topics in statistics - DV01056

• Title: VP - Analýza dat v R a vybrané kapitoly ze statistiky
• Guaranteed by: Department of Paediatric Haematology and Oncology (13-462)
• Faculty: Second Faculty of Medicine
• Actual: from 2023
• Semester: summer
• Points: 3
• E-Credits: 3
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:0/20, C [HS]
• Capacity: unknown / unknown (10)
• Min. number of students: 3
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Note: course can be enrolled in outside the study plan; enabled for web enrollment
• Guarantor: doc. MUDr. Lucie Šrámková, Ph.D.

Annotation

Předmět je určen doktorandům a všem studentům pregraduálního studia, kteří uvažují, že by část své kariéry strávili vědeckou prací. Kurz navazuje na seminář “Uvedení do R a analýzy dat”. Tento předmět není formální prerekvizitou a studenti si mohou kurz zapsat samostatně, předpokládají se nicméně základní znalosti prostředí a jazyka R. Cílem kurzu je vyložit některé analytické metody často používané v moderním biomedicínském výzkumu a naučit je prakticky aplikovat. Témata a hloubka do jaké se jim věnujeme je volena do značné míry podle odborného zájmu posluchačů. Základní témata: 1) pravděpodobnost, 2) moderní regresní metody (lineární a zobecněné lineární modely, analýza přežívání), 3) transformace a zobrazení dat. Rozšiřující témata (podle zájmu posluchačů): analýza dat v průtokové cytometrii, sekvenovaní nové generace, expresní profilování, analýza časových řad, metody se smíšenými efekty, dimenzionální redukce, grafické modely, Simpsonův paradox a kausalita,... Po domluvě lze zařadit další témata podle zájmu.

Last update: Procházka Zdeněk (16.09.2021)

Course completion requirements

vyřešení alespoň 2 domácích úkolů + absolvování alespoň jednoho opakovacího semináře (aktivně, kus funkčního kódu)

Last update: Procházka Zdeněk (16.09.2021)

Requirements to the exam

žádné požadavky, předmět zakončen zápočtem

Last update: Palowska Stanislava (14.09.2021)

Syllabus

Název studijního předmětu: Analýza dat v R a vybrané kapitoly ze statistiky

Název studijního předmětu - anglicky: Data analysis in R and selected topics in statistics

Předmět je určen doktorandům a všem studentům pregraduálního studia, kteří uvažují, že by část své

kariéry strávili vědeckou prací. Kurz navazuje na seminář “Uvedení do R a analýzy dat”. Tento předmět není

formální prerekvizitou a studenti si mohou kurz zapsat samostatně, předpokládají se nicméně základní

znalosti prostředí a jazyka R. Cílem kurzu je vyložit některé analytické metody často používané v moderním

biomedicínském výzkumu a naučit je prakticky aplikovat. Témata a hloubka do jaké se jim věnujeme je

volena do značné míry podle odborného zájmu posluchačů. Základní témata: 1) pravděpodobnost, 2)

moderní regresní metody (lineární a zobecněné lineární modely, analýza přežívání), 3) transformace a

zobrazení dat.

Rozšiřující témata (podle zájmu posluchačů): analýza dat v průtokové cytometrii, sekvenovaní nové

generace, expresní profilování, analýza časových řad, metody se smíšenými efekty, dimenzionální redukce,

umělé neuronové sítě, ... Po domluvě lze zařadit další témata podle zájmu.

Garant: prof.Starý

Odpovědná osoba: doc. Šrámková

Typ předmětu: volitelný

Rozsah studijního předmětu: 2 hodiny týdně, 10 týdnů

Začátek: 21.2. - 22.5.2024 každý týden ve středu (nebo dle dohody), 14:00 - 15:30

Určeno pro ročníky: PGS a 1.-6. pregraduální

Počet studentů: 3-10

Způsob zakončení: Zápočet

Místo konání: budova "nová onkologie"

Last update: Růžičková Iva (27.07.2023)