SubjectsSubjects(version: 964)
Course, academic year 2024/2025
   Login via CAS
Clinical Genetics - D1108325
Title: Klinická genetika
Guaranteed by: Department of Biology and Medical Genetics (13-716)
Faculty: Second Faculty of Medicine
Actual: from 2024
Semester: winter
Points: 2
E-Credits: 2
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:0/30, C+Ex [HT]
Extent per academic year: 1 [weeks]
Capacity: unknown / unlimited (unknown)
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
Guarantor: prof. MUDr. Milan Macek, DrSc.
Teacher(s): MUDr. Markéta Havlovicová
MUDr. Radka Kremlíková Pourová, Ph.D.
prof. MUDr. Milan Macek, DrSc.
MUDr. Pavel Tesner, Ph.D.
doc. MUDr. Markéta Vlčková, Ph.D.
Pre-requisite : D1105439
Annotation - Czech
Klinická (lékařská) genetika je velmi dynamicky se rozvíjející lékařský obor. Jeho cílem je aplikace výsledků výzkumu z oblasti obecné i experimentální genetiky v medicíně, zejména zkoumání vlivu genetických a epigenetických vlivů na vznik lidských chorob a vad, včetně rozvoje hereditárních nádorových syndromů. Dalším důležitým cílem oboru je zajistit genetickou prevenci v rodině nemocných (tj. u osob se zvýšeným genetickým rizikem) a zajistit rovněž možnost reprodukční volby pro pacienty nebo jejich rodiny. V současné době tento obor se stále více stává partnerem všech ostatních medicínských oborů z hlediska diagnostiky a léčby všech dědičných (hereditárních) onemocnění, a to jak vzácných (monogenních) onemocnění tak i polygenně podmíněných „častých“ onemocnění nebo vrozených vad, jež postihují všechny orgánové systémy. V tomto ohledu má klinická genetika „koordinační roli“ s ohledem na mezigenerační dopady genetických onemocnění a významně se podílí na rozvoji např. farmakogenetiky, imunogenetiky, kardiogenetiky, neurogenetiky a onkogenetiky. Významným způsobem rovněž doplňuje problematiku molekulární patologie vzhledem k tomu, že kombinuje dopady zárodečné a somatické variace v lidském genomu. Aplikace výzkumu lidského genomu, bioinformatických postupů a umělé inteligence, studium korelací genotypu s fenotypem (tj. prezentací a klinickým průběhem onemocnění), vlivu negenetických faktorů na manifestaci chorob a farmakogenetických přístupů v terapii, přispěly zásadní měrou k pokroku v medicíně. Klinická genetika hraje klíčovou roli v přivedení těchto poznatků do praxe, v jejich správné interpretaci a neposlední řadě v managementu interdisciplinární spolupráce a péče o rodiny s výskytem genetických chorob. Předmět je koncipován k pochopení těchto komplexních souvislostí. Jedná se o týdenní blok přednášek a praktických cvičení, které zahrnují i spolupráci při praktických demonstracích zdravotně sociální problematiky ve spolupráci s Českou asociací pro vzácná onemocnění. Součastí bloku jsou i genetické vyšetřovací metody, interpretace výsledků, metody výpočtu genetických rizik nebo práce s genetickými databázemi.
Last update: Dimitriou Alena, Bc. (03.10.2024)
Aim of the course - Czech

Studenti 4. ročníku si v předmětu klinické genetiky osvojí základní znalosti z oblasti klinické a molekulární genetiky. Výuka je koncipována do těchto tematických okruhů:

1. Cíle genetického vyšetření - Genetické poradenství - stanovení přesné genetické diagnózy, určení etiologie, podílu genetických a negenetických faktorů, vytipování rizikových členů v rodině, výpočty genetických rizik, návrh preventivních opatření

2. Genetické vyšetřovací metody - cytogenetické - karyotyp, FISH,, array CGH, molekulárně genetické vyšetřovací metody- PCR, sekvenování dle Sangera a sekvenování nové generace (masivně paralelní sekvenování).

3. Metody genetické prevence - prekoncepční, prenatální a perinatální péče (včetně reprodukční genetiky), prenatální a preimplatační genetické testování, primární prevence vrozených vývojových vad, laboratorní metody v perikoncepční péči.

4. Syndromologie, dysmorfologie, reverzní fenotypování, využívání nejmodernějších metod v syndromologii (3D skenování) a genetických databází v praxi.

5. Onkogenetika.

6. Kardiogenetika včetně problematiky náhlé smrti a genetiky poruch dalších orgánů, jako je např. nefrogenetika, genetika smyslových poruch nebo vrozené poruchy metabolismu.

7. Neurovývojová onemocnění včetně neurodegenerativních onemocnění, syndromových a nesyndromových poruch intelektu a poruch autistického spektra (PAS).

8. Farmakogenetika.

Last update: Dimitriou Alena, Bc. (03.10.2024)
Course completion requirements - Czech

Podmínkou udělení zápočtu je absolvování výuky předmětu s maximální omluvenou absencí 20 % z celkového počtu hodin výuky; v praxi se jedná o jeden omluvený den.

Jednu další absenci lze akceptovat na základě lékařského či jiného relevantního potvrzení.

Podmínkou přístupu ke zkoušce je zápočet a znalost učiva, shrnutého ve zkušebních otázkách.

Last update: Dimitriou Alena, Bc. (03.10.2024)
Literature - Czech

Povinná literatura:

Maříková T.: Klinická genetika : praktické aplikace (A) (dostupné také jako e-kniha)

Pritchard D. J.: Základy lékařské genetiky

Bory P., Matthijs G.: Všichni jsme GENiální: Lidská genetika slovem a obrazem

Doporučená literatura:

Žižka, J.: Diagnostika syndromů a malformací

Lebl, J.: Kazuistiky z molekulární genetiky

Passarge, E.: Color atlas of genetics, 2013 (E), 2007

Collins, F.: Řeč života

Jorde, L.B., John, C.C., Bamshad, M.J. : Medical Genetics: With STUDENT CONSULT Online Access

Read, A. , Donnai, D. : New Clinical Genetics

Sermon. K., Viville, S.: Textbook of Human Reproductive Genetics

Strachan, T., Goodship, J., Chinnery, P.: Gennetics and genomics in medicine

Harper, P.S.: Practical genetic counselling: 6th ed. Oxford University Press, 2004

Kočárek, E.: Klinická cytogenetika I.

MOODLE:

https://dl1.cuni.cz/course/index.php?categoryid=147

Last update: Dimitriou Alena, Bc. (03.10.2024)
Requirements to the exam - Czech

Obsahovou náplní zkoušky je vylosování tří zkouškových otázek (kombinace jsou předem určeny) a jejich následné zodpovězení.

Otázky ke zkoušce z Klinické genetiky 2024/2025:

1. Specifické aspekty genetického poradenství

2. Role klinického genetika v multidisciplinární péči

3. Etiologie vrozených vad a genetických onemocnění

4. Farmakogenetika, „Direct to consumer“ (DTC) testování

5. Vzácná onemocnění, pacientské organizace

6. Genealogická analýza

7. Konsanguinita, rizika, opatření

8. Charakteristika AD dědičnosti, příklady onemocnění

9. Charakteristika AR dědičnosti, příklady onemocnění

10. Charakteristika X-vázané dědičnosti, příklady onemocnění

11. Mitochondriální dědičnost, příklady onemocnění

12. Multifaktoriální dědičnost, příklady, rizika

13. Nejčastější genetická onemocnění

14. Nejčastější dědičné poruchy metabolismu

15. Mikrodeleční syndromy

16. Chromozomální instabilita a její klinický význam

17. Nejčastější vrozené vývojové vady - diagnostika, etiologie, prevence

18. Novorozenecký screening

19. Genetická rizika věku matky a otce

20. Stanovení genetických rizik (monogenní a multifaktoriální choroby)

21. Využití databází v klinické genetice

22. Prenatální screening I. a II. trimestru

23. Primární prevence genetických onemocnění

24. Prenatální genetická péče

25. Preimplantační genetické testování

26. Neinvazivní metody prenatální diagnostiky

27. Invazivní metody prenatální diagnostiky

28. Ukončení gravidity z genetické indikace

29. Základní syndromy podmíněné aberacemi chromozomů

30. Klinicko-genetické vyšetření dysmorfického pacienta

31. Využití cytogenetického vyšetření v klinické genetice

32. Využití molekulární a genomické diagnostiky v klinické genetice

33. Nové laboratorní genetické metody a jejich dopad na klinickou genetiku a další medicínské

obory

34. Syndromy dědičné nádorové predispozice

35. Geny predisponující k nádorům

36. Nefrogenetika

37. Genetika mentální retardace a autismu

38. Neurogenetika

39. Onemocnění s expanzí repetitivních sekvencí

40. Genetika smyslových poruch

41. Nejčastější syndromy s vrozenou srdeční vadou

42. Genetika kardiomyopatií a arytmogenních syndromů

43. Možnosti léčby dědičných chorob

44. Genová terapie

45. Spolupráce genetika s patologem

46. Spolupráce genetika a odborníka v oboru zobrazovacích metod

47. Spolupráce genetika a infektologa, pneumologa

48. Indikace genetického vyšetření v praxi ortopeda a anesteziologa

49. Indikace genetického vyšetření v praxi PLDD

50. Indikace genetického vyšetření v praxi PL

51. Indikace genetického vyšetření v praxi gynekologa

52. Indikace genetického vyšetření v praxi dětského neurologa

53. Indikace genetického vyšetření v praxi neurologa pro dospělé

54. Indikace genetického vyšetření v praxi psychiatra

55. Indikace genetického vyšetření v praxi neurochirurga a anesteziologa

56. Indikace genetického vyšetření v praxi kardiologa

57. Indikace genetického vyšetření v praxi dermatologa

58. Indikace genetického vyšetření v praxi imunologa a revmatologa

59. Indikace genetického vyšetření v praxi stomatologa

60. Indikace genetického vyšetření v praxi očního lékaře

61. Indikace genetického vyšetření v praxi ORL lékaře a foniatra

62. Indikace genetického vyšetření v praxi endokrinologa

63. Indikace genetického vyšetření v praxi neonatologa

64. Indikace genetického vyšetření v praxi nefrologa a urologa

65. Indikace genetického vyšetření v praxi onkologa

66. Indikace genetického vyšetření v praxi chirurga

Last update: Dimitriou Alena, Bc. (03.10.2024)
Syllabus - Czech

Úvod do klinické genetiky

Význam genetického poradenství

Multidisciplinární genetická péče

Základy klinické dysmorfologie: aneb co je ještě norma

Moderní přístupy měnící klinickou genetiku (3D morfometrie, NGS)

Genetické databáze

Praktická cvičení z dysmorfologie

Role genetika v perikoncepční, prenatální a perinatální péči, laboratorní metody v perikoncepční péči, teratologie

Dědičné poruchy metabolismu a novorozenecký screening

Kardiogenetika a diagnostické situace

Onkogenetika a diagnostické situace

Genetika pediatrické neurologie, mitochondriální poruchy, neurogenetika

Genetika smyslových poruch

Genetika v imunologii

Geneticky podmíněné nefropatie

Genetika mentálních retardací a poruch autistického spektra

Genová terapie

Genetika v medicíně, genetika multifaktoriálních chorob, epigenetika, farmakogenetika, personalizovaná medicína

Akutní genetika: Vyšetření post mortem po náhlé smrti

Last update: Dimitriou Alena, Bc. (03.10.2024)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html