SubjectsSubjects(version: 964)
Course, academic year 2024/2025
   Login via CAS
Microbiology II. - D1105038
Title: Mikrobiologie II.
Guaranteed by: Department of Medical Microbiology (13-323)
Faculty: Second Faculty of Medicine
Actual: from 2024
Semester: winter
Points: 4
E-Credits: 4
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:56/0, C+Ex [HT]
Extent per academic year: 14 [weeks]
Capacity: unlimited / unknown (unknown)
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
Guarantor: prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Teacher(s): prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Co-requisite : D1106089
Pre-requisite : D1103040, D1104339
Is co-requisite for: D1106089
Is pre-requisite for: D1108368, D1108038, D1108369, D1108004
Annotation - Czech
Jde o povinný studijní předmět, který patří mezi základní teoretické předměty profilujícího základu. Jeho absolvováním student získá znalosti a dovednosti v oblasti lékařské mikrobiologie – v popisu jednotlivých mikroorganismů a jejich vlastností, v zásadách odběru, transportu a zpracování biologického materiálu, v mechanismu účinku a působení antimikrobních látek, v obecných principech antiinfekční terapie a v poznání interakcí infekčních agens s makroorganismem, které jsou nezbytným předpokladem pro další úspěšné studium ve vyšších ročnících. V rámci předmětu si student osvojí například následující znalosti, dovednosti a kompetence: - zhodnotit laboratorní nálezy, které by mohly mít spojitost s onemocněním způsobeným mikroorganismy - abnormální počet leukocytů, abnormální výsledky analýzy stolice, okultní krvácení, nález parazitů, abnormální močový sediment, zvýšené markery zánětu - pochopit základní patologické stavy, které mohou mít přímou souvislost s působením mikroorganismu v lidském těle - např. lymfadenopatie, horečka, zimnice, svědění, otoky, edémy, hubnutí, akutní těžká bolest hlavy či meningismus - porozumět problematice nozokomiálních infekcí a jejich rizik – ATB rezistence, možnosti diagnostiky a terapie, spolupráce s epidemiologem, bariérová opatření - vnímat mechanismy šíření agens v populaci, zamezení cest přenosu, prevence - otázky týkající se imunizace jedince – očkovací plán; povinná, nepovinná očkování, doporučená očkování - použít základní klinickou rozvahu při získávání informací významných pro pacientovu léčbu. Zahrnout vědecké poznatky teoretických lékařských věd včetně epidemiologických informací (incidence, prevalence) do klinické rozvahy za účelem sestavit diferenciální diagnózu - zhodnotit závažnost obtíží pacienta, symptomů nemoci nebo situace, ve které se pacient nachází. Konzultovat s dalšími lékaři a členy týmu, aby došlo k potvrzení a schválení pracovní diagnózy, vysvětlit a zdokumentovat klinickou rozvahu, jež vedla k pracovní diagnóze; prokázat kritické myšlení vedoucí ke stanovení diferenciální diagnózy. - doporučit vstupní, nákladově efektivní diagnostickou metodu pro pacienta s akutním nebo chronickým onemocněním, nebo jako součást preventivní zdravotní prohlídky. Vyhodnotit výsledky testů a zahrnout je do diferenciální diagnózy. Pochopit důsledky a naléhavost v případě abnormálních výsledků vyšetření a v případě nutnosti požádat o pomoc s jejich výkladem.
Last update: Procházka Zdeněk (04.09.2020)
Course completion requirements - Czech

Zakončení předmětu M II je podmíněno úspěšně složenou ústní zkouškou. K té lze přistoupit po udělení zápočtu za zimní semestr.

1) Úspěšné absolvování písemných testů, tedy zisk minimálně 20 bodů v součtu všech tří průběžných testů. Jednotlivé testy mohou absolvovat studenti před začátkem přednášky (termíny viz dále). Náhradní termíny pro průběžné testy nejsou vypisovány. Každý z jednotlivých testů obsahuje 10 otázek, každá správně zodpovězená otázka je ohodnocena 1 bodem. Doba trvání každého jednotlivého testu je 10 minut. Pokud student nedosáhne na minimální bodové ohodnocení 20 bodů, má možnost uspět v souhrnném opravném testu v zápočtovém týdnu. Test obsahuje 30 otázek, minimum je získání 24 bodů.

Bez splnění uvedené podmínky udělení zápočtu nebude student připuštěn ke zkoušce. Zápočet má platnost jeden kalendářní rok. Neplatí pro studenty, kteří v rámci individuálního studijního plánu mají rozložený ročník.

Termíny zápočtových testů

1. test Obecná mikrobiologie 3. týden zimního semestru (Obecná bakteriologie, virologie, mykologie, parazitologie – základní pojmy, Antimikrobiální látky – přehled, mechanismy účinku i rezistence k ATB, spektrum účinku Vyšetřovací metody – přehled a rozdělení, význam, výhody a nevýhody jednotlivých metod)

2. test Speciální mikrobiologie 7. týden zimního semestru (Bakterie (G+, G- i ostatní), houby, paraziti, viry – znalosti o jednotlivých agens - klasifikace, nejvýznamnější faktory virulence, patogenita, možnosti diagnostiky a terapie)

3. test Klinická mikrobiologie 11. týden zimního semestru (Infekce nosokomiální, močové, respirační, alimentární, nervového systému, krevního řečiště – nejvýznamnější původci, metody diagnostiky, léčby i prevence)

Last update: Laušerová Romana (02.10.2024)
Literature - Czech

Základní studijní literatura :

•Hurych J, Štícha R a kol.: Lékařská mikrobiologie - repetitorium, 3. vydání, Triton, 2021, ISBN 978-80-7553-976-2.

•Melter O et al.: The MicroBook - Clinical Microbiology for Medical Students, 1. vydání, Karolinum, 2019, ISBN 978-80-246-3871-3.

MOODLE:

https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=6510

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (01.10.2024)
Requirements to the exam - Czech

Mikrobiologie II :

Pravidla:

Kombinace tří otázek ze tří okruhů:

1. Obecná mikrobiologie (okruh I.)

2. Speciální mikrobiologie (okruhy II.-IV)

3. Klinická mikrobiologie (okruh V.) a Vyšetřovací metody (okruh VI.)

I. Obecná mikrobiologie (26 otázek)

1. Složení buněčné stěny G+ a G- bakterií. Klasifikace bakterií.

2. Stavba bakteriální buňky a povrchové struktury, bakteriální spora.

3. Exotoxiny a jejich rozdělení podle mechanismu a místa účinku.

4. Bakteriální genom a jeho plasticita. Mobilní genetické elementy.

5. Stavba virových částic. Klasifikace virů.

6. Patogeneze virových infekcí.

7. Obecná mykologie. Klasifikace mikromycet.

8. Obecná parazitologie. Klasifikace parazitů.

9. Mechanismy účinku antibiotik.

10. Mechanismy rezistence k antibiotikům.

11. Rezervní antibiotika

12. Zásady racionální antibiotické terapie.

13. Penicilinová antibiotika.

14. Cefalosporiny I. až V. generace, karbapenemy

15. Glykopeptidy. Oxazolidinony (linezolid)

16. Přípravky s inhibitory betalaktamáz

17. Makrolidová a linkosamidová antibiotika.

18. Tetracykliny včetně tigecyklinu. Chloramfenikol.

19. Aminoglykosidy. Polypeptidová antibiotika (polymyxin).

20. Chinolononová antibiotika.

21. Kotrimoxazol. Metronidazol. Nitrofurantoin.

22. Antituberkulotika.

23. Virostatika včetně léčby covid-19.

24. Antimykotika.

25. Antiparazitika (s důrazem na antimalarika) vč. antiinfektiv využívaných k léčbě parazitárních infekcí.

26. Nežádoucí účinky antibiotik.

II. Speciální virologie a mykologie (19 otázek)

27. Herpesviry - HSV1, HSV2 a VZV.

28. Herpesviry - EBV, CMV a HHV-6.

29. Viry influenzy.

30. Virus parotitidy. Virus spalniček.

31. Virus zarděnek a parvovirus B19.

32. Virus vztekliny.

33. Adenoviry.

34. Rotaviry. Caliciviry.

35. Polioviry a jiné enteroviry.

36. Flaviviry způsobující encefalitidy

37. Virové hemoragické horečky.

38. Papilomaviry. Lidské patogenní poxviry.

39. RSV, viry parainfluenzy, rhinoviry.

40. SARS-CoV-2 a další koronaviry

41. Původci virových hepatitid.

42. Virus HIV a jiné retroviry.

43. Kvasinky (kandidy)

44. Vláknité mikromycety (aspergily, mukormycety, dermatofyty).

45. Cryptococcus. Pneumocystis.

III. Speciální bakteriologie (33 otázek)

46. Staphylococcus aureus.

47. Koaguláza negativní stafylokoky.

48. Streptococcus pyogenes.

49. Beta hemolytické streptokoky jiné než S. pyogenes.

50. Streptococcus pneumoniae a ústní streptokoky.

51. Enterokoky.

52. Neurotoxická klostridia.

53. Histotoxická klostridia.

54. Clostridioides difficile.

55. Bacillus anthracis a ostatní bacily.

56. Listeria monocytogenes.

57. Korynebakteria.

58. Aktinomycety a nokardie.

59. Pseudomonas aeruginosa a další G- nefermentující tyčinky.

60. Bordetelly.

61. Brucely a Francisella tularensis. Legionella pneumophila.

62. Campylobacter. Helicobacter pylori.

63. Haemophilus influenzae a ostatní hemofily.

64. Vibrio cholerae a ostatní vibria.

65. Escherichia coli. Shigely.

66. Yersinie.

67. Salmonely (Typhi, Enteritidis a další sérotypy).

68. Klebsiella. Enterobacter.

69. Citrobacter, Serratia, Proteus a Providencia.

70. Neisseria meningitidis.

71. Neisseria gonorrhoeae.

72. Anaerobní bakterie jiné než klostridia a aktinomycety).

73. Treponema pallidum.

74. Borrelie a leptospiry.

75. Rickettsie, coxielly, bartonely.

76. Chlamydie.

77. Mykoplasmata a ureaplasmata.

78. Mykobakteria.

IV. Parazitologie (11 otázek)

79. Trypanosomy a leishmanie.

80. Giardia. Cryptosporidium. Trichomonas.

81. Entamoeba a další améboidní prvoci.

82. Původci malárie.

83. Toxoplasma gondii.

84. Schistosomy.

85. Taeniae a ostatní původci střevních cestodóz.

86. Echinokoky a ostatní původci tkáňových cestodóz.

87. Enterobius a Ascaris. Ostatní původci střevních nematodóz.

88. Trichinella a další původci tkáňových nematodóz (včetně filarióz).

89. Ektoparazité.

V. Klinická mikrobiologie (18 otázek)

90. Lidský mikrobiom. Fyziologická mikrobiota.

91. Infekce horních cest dýchacích.

92. Infekce dolních cest dýchacích.

93. Průjmová onemocnění.

94. Infekce močových cest.

95. Sexuálně přenosné infekce.

96. Nehnisavé (aseptické) neuroinfekce.

97. Hnisavé meningitidy.

98. Infekce krevního řečiště. Pojem sepse.

99. Infekce spojené se zdravotní péčí (healthcare-associated infections).

100. Multirezistentní kmeny a možnosti léčby.

101. Exantémová onemocnění.

102. Infekce kůže a měkkých tkání.

103. Infekce kostí a kloubů.

104. Infekce způsobené anaerobními bakteriemi.

105. Infekce plodu a novorozence.

106. Typy očkovacích látek. Povinné očkování.

107. Doporučené očkování a očkování na žádost jedince.

VI. Vyšetřovací postupy a diagnostika (12 otázek)

108. Mikrobiologická diagnostika bakteriálních infekcí

109. Mikrobiologická diagnostika virových infekcí

110. Mikrobiologická diagnostika mykotických infekcí

111. Mikrobiologická diagnostika parazitárních infekcí

112. Mikroskopie v diagnostice infekčních onemocnění.

113. Kultivace bakterií.

114. Postupy vedoucí k identifikaci bakterií.

115. Testy citlivosti k antibiotikům. Interpretace výsledků

116. Serologické reakce (aglutinace, ELISA, WB, imunochromatografie).

117. Metody molekulární biologie a jejich výhody a nevýhody v diagnostice infekčních onemocnění.

118. PCR a jeho využití v diagnostice infekčních onemocnění (včetně režimu POCT).

119. Sekvenování a jeho využití v mikrobiologické laboratoři.

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (01.10.2024)
 
Schedule scheduled
Schedule ticket Date From - To Education type Theme Teacher Files Note
24aD1105038p1

Groups of students
M3.VL
Wed 02.10.2024 14:25 - 16:05 lecture Obecná virologie, metody diagnostiky ve virologii MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 03.10.2024 13:30 - 15:10 lecture Virová exantémová onemocnění MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Wed 09.10.2024 14:25 - 16:05 lecture Sekvenační techniky v mikrobiologii. Lidský mikrobiom, fyziologická mikrobiota. MUDr. Jakub Hurych, Ph.D.
Thu 10.10.2024 13:30 - 15:10 lecture Lékařská mykologie MUDr. Daniela Lžičařová
Wed 16.10.2024 14:25 - 16:05 lecture Protozoa I prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Thu 17.10.2024 13:30 - 15:10 lecture Herpesviry + ZÁPOČTOVÝ TEST I MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Wed 23.10.2024 14:25 - 16:05 lecture Protoza II, Trematoda prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Thu 24.10.2024 13:30 - 15:10 lecture Cestoda, Nematoda prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Wed 30.10.2024 14:25 - 16:05 lecture Úvod do nosokomiálních infekcí, katetrové infekce, ranné infekce, nosokomiální a ventilátorové pneumonie MUDr. Václav Vaniš
Thu 31.10.2024 13:30 - 15:10 lecture Infekce močových cest MUDr. Eliška Bébrová
Wed 13.11.2024 14:25 - 16:05 lecture VK 2.LF UK - PŘEDNÁŠKA NEBUDE
Thu 14.11.2024 13:30 - 15:10 lecture VK 2.LF UK - PŘEDNÁŠKA NEBUDE
Wed 20.11.2024 14:25 - 16:05 lecture Arbovirózy; hemoragické horečky MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 21.11.2024 13:30 - 15:10 lecture "Neuroinfekce
ZÁPOČTOVÝ TEST II"
MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Wed 27.11.2024 14:25 - 16:05 lecture Intestinální sérotypy E. coli a shigelly doc. MUDr. Martina Bielaszewska, CSc.
Thu 28.11.2024 13:30 - 15:10 lecture Infekce vyvolané Clostridioides difficile (CDI) Mgr. Marcela Krůtová, Ph.D.
Wed 04.12.2024 14:25 - 16:05 lecture Infekce gastrointestinálního traktu prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 05.12.2024 13:30 - 15:10 lecture Respirační infekce prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Wed 11.12.2024 14:25 - 16:05 lecture Respirační viry MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 12.12.2024 13:30 - 15:10 lecture Infekce krevního řečiště prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Wed 18.12.2024 14:25 - 16:05 lecture MDR bakterie a rezervní antibiotika MUDr. Otakar Nyč, Ph.D.
Thu 19.12.2024 13:30 - 15:10 lecture "Infekce kostí a kloubů +
ZÁPOČTOVÝ TEST III"
MUDr. Václav Vaniš
Wed 08.01.2025 14:25 - 16:05 lecture Infekce kůže a měkkých tkání MUDr. Anežka Gryndlerová
Thu 09.01.2025 13:30 - 15:10 lecture Pohlavně přenosné infekce (STI) prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Wed 15.01.2025 14:25 - 16:05 lecture Virus HIV a viry hepatitid (HBV a HCV) MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 16.01.2025 13:30 - 15:10 lecture Infekce v těhotenství a infekce u novorozenců prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html