Microbiology I. - D1104339

• Title: Mikrobiologie I.
• Guaranteed by: Department of Medical Microbiology (13-323)
• Faculty: Second Faculty of Medicine
• Actual: from 2024
• Semester: summer
• Points: 5
• E-Credits: 5
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:28/42, C [HS]
• Extent per academic year: 14 [weeks]
• Capacity: unlimited / unlimited (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Guarantor: prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
• Teacher(s): prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.; MUDr. Sergii Romanov
• Co-requisite : D1103040
• Pre-requisite : D1101001, D1101333, D1101338, D1102332, D1102338
• Is co-requisite for: D1103040
• Is pre-requisite for: D1105439, D1105038

Annotation

Jde o povinný studijní předmět, který patří mezi základní teoretické předměty profilujícího základu. Jeho absolvováním student získá znalosti a dovednosti v oblasti lékařské mikrobiologie – v popisu jednotlivých mikroorganismů a jejich vlastností, v zásadách odběru, transportu a zpracování biologického materiálu, v mechanismu účinku a působení antimikrobních látek, v obecných principech antiinfekční terapie a v poznání interakcí infekčních agens s makroorganismem, které jsou nezbytným předpokladem pro další úspěšné studium ve vyšších ročnících. V rámci předmětu si student osvojí například následující znalosti, dovednosti a kompetence: - zhodnotit laboratorní nálezy, které by mohly mít spojitost s onemocněním způsobeným mikroorganismy - abnormální počet leukocytů, abnormální výsledky analýzy stolice, okultní krvácení, nález parazitů, abnormální močový sediment, zvýšené markery zánětu - pochopit základní patologické stavy, které mohou mít přímou souvislost s působením mikroorganismu v lidském těle - např. lymfadenopatie, horečka, zimnice, svědění, otoky, edémy, hubnutí, akutní těžká bolest hlavy či meningismus - porozumět problematice nozokomiálních infekcí a jejich rizik – ATB rezistence, možnosti diagnostiky a terapie, spolupráce s epidemiologem, bariérová opatření - vnímat mechanismy šíření agens v populaci, zamezení cest přenosu, prevence - otázky týkající se imunizace jedince – očkovací plán; povinná, nepovinná očkování, doporučená očkování - použít základní klinickou rozvahu při získávání informací významných pro pacientovu léčbu. Zahrnout vědecké poznatky teoretických lékařských věd včetně epidemiologických informací (incidence, prevalence) do klinické rozvahy za účelem sestavit diferenciální diagnózu - zhodnotit závažnost obtíží pacienta, symptomů nemoci nebo situace, ve které se pacient nachází. Konzultovat s dalšími lékaři a členy týmu, aby došlo k potvrzení a schválení pracovní diagnózy, vysvětlit a zdokumentovat klinickou rozvahu, jež vedla k pracovní diagnóze; prokázat kritické myšlení vedoucí ke stanovení diferenciální diagnózy. - doporučit vstupní, nákladově efektivní diagnostickou metodu pro pacienta s akutním nebo chronickým onemocněním, nebo jako součást preventivní zdravotní prohlídky. Vyhodnotit výsledky testů a zahrnout je do diferenciální diagnózy. Pochopit důsledky a naléhavost v případě abnormálních výsledků vyšetření a v případě nutnosti požádat o pomoc s jejich výkladem.

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (16.02.2023)

Course completion requirements

Lékařská mikrobiologie I /LS/

Podmínka zakončení semestru: Podmínkou zakončení předmětu je udělení zápočtu.

Podmínky udělení zápočtu v letním semestru: Zápočet bude udělen za:

1) účast na praktikách (povoleny 2 absence mimo povinná témata - viz níže) a

2) získání minimálně 14/20 bodů ze zápočtových testů (píší se v týdnech 6. a 14. na přednášce ve Velké posluchárně):

• Zápočtový test I (týden 6): Obecná bakteriologie a antimikrobiální látky

• Zápočtový test II (týden 14): Speciální bakteriologie (vyjma témat přednášky v týdnu 14)

3) Úspěšné složení praktické zkoušky

Výsledek testu bude co nejdříve k dispozici na internetu. Při nepřítomnosti nebo nedostatečném počtu bodů bude student přezkoušen ústně v zápočtovém týdnu příslušným vyučujícím.

Povinná témata - praktická cvičení "Mikroskopie v bakteriologii" a "Kultivace bakterií a postupy vedoucí k identifikaci bakterií". Tato cvičení nelze nahradit samostudiem (viz Opatření děkana č.4/2022) a absenci je nutné nahradit účastí na praktickém cvičení s jiným kruhem, případně dojde k přezkoušení kroužkovým asistentem. V případě nenahrazení absence na těchto cvičení nemůže být udělen zápočet.

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (14.05.2025)

Literature

Základní studijní literatura :
Hurych, Štícha et al: Lékařská mikrobiologie - Repetitorium, 3. vydání Triton, 2021

Melter et al: The MicroBook, 1. vydání, Karolinum, 2019

Goering, Dockrell et al: Mimsova lékařská mikrobiologie, 5. vydání, Triton, 2016

Doporučená literatura :
Murray a kol.: Medical Microbiology, 9th Edition, Elsevier, 2020

Schindler: Mikrobiologie pro studenty zdravotnických oborů, Grada, 2010

Votava: Lékařská mikrobiologie obecná, Neptun, 2001

Votava: Lékařská mikrobiologie speciální, Neptun, 2006

MOODLE:https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=614

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (16.02.2023)

Syllabus

Témata přednášek:
1 Širší úvod do oboru lékařské mikrobiologie, základy genetiky bakteriálních buněk

2 Bakteriální buňka. Patogenita bakterií.

3 Úvod od antibiotik. Systematika antimikrobiálních látek I.

4 Systematika antimikrobiálních látek II.

5 Významné G+ koky I (stafylokoky)

6 Významné G+ koky II (streptokoky a enterokoky) - ZÁPOČTOVÝ TEST I

7 Významné G+ tyčinky (korynebakterie, listerie, klostridia)

8 VELIKONOČNÍ PONDĚLÍ - odpadá

9 G- bakterie I (nefermentující tyčinky, enterobakterie).

10 G- bakterie II (kultivačně náročné: bordetelly, Legionella, hemofily, meningokoky)

11 G- bakterie III (kampylobaktery, helikobaktery). G+ i G- anaerobní bakterie (mimo klostridií). - ze záznamu

12 "Atypické bakterie" I (rickettsie,coxiely, bartonely, chlamydie, mykoplasmata) - ze záznamu

13 Lékařská mykologie. ZÁPOČTOVÝ TEST II

14 "Atypické bakterie" II (mykobakterie, spirochety)

Témata praktických cvičení:
1. Preanalytická fáze mikrobiologické diagnostiky

2. Mikroskopie v bakteriologii

3. Kultivace bakterií a postupy vedoucí k identifikaci bakterií

4. Stanovení citlivosti k ATB

5. Diagnostika významných G+ koků I (stafylokoky)

6. Diagnostika významných G+ koků II (streptokoky a enterokoky)

7. Diagnostika významných G+ tyčinek (korynebakterie, listerie, klostridia a bacily)

8. Serologické metody

9. Diagnostika G- bakterií I. (nefermentující tyčinky, enterobakterie).

10. Diagnostika G- bakterií II - kultivačně náročné (bordetelly, Legionella, hemofily, meningokoky)

11. Diagnostika G- bakterií III - kultivačně náročné (kampylobaktery, helikobaktery) a anerobní bakterie

12. Diagnostické metody v parazitologii

13. Diagnostické metody v mykologii

14. ZÁPOČTOVÝ TÝDEN

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (16.02.2023)