Last update: doc. RNDr. Jovana Sádlová, Ph.D. (29.08.2023)
The course consists of five parts.
1. Light microscopy (Sádlová, Vojtková, Majer, Bečvář, Jelínková, Hammerbauerová, Vajs) Introduction to the basic theory of light microscopy and handling the light microscope. Students will prepare native and stained microscopic slides (Giemsa-Romanowski staining, aniline blue and native alizarin staining). The techniques will be demonstrated on protozoa with various taxonomic affiliation and helminths.
2. Special light and fluorescence microscopy (Sádlová, Vojtková, Majer, Bečvář, Jelínková, Hammerbauerová, Vajs) Students will be introduced into the basics of the theory of contrasts in the light microscopy (dark field, phase contrast, DIC, Hoffman contrast), fluorescence and confocal microscopy. They will practically learn the work with dark field, phase contrast and fluorescence microscope.
3. Electron microscopy (Sacherová, Juračka, Hyliš) Students will be introduced into the theory of electron microscopy and preparation of specimens. They will have chance to work practically with scanning and transmission electron microscope and prepare simple specimens.
4. Introduction to the image analysis (Albrechtová, Soukup et al.) In this section, students learn the basics of digitization and image processing and basic operations of image analysis. Practical exercises are conducted in the program ImageJ (National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA, URL: http://imagej.nih.gov). More on the website of Block 4.
5. Advanced fluorescence and electron microscopy - excursion to the Service Laboratory of Imaging Methods BIOCEV (Aleš Benda et al.)
Students will be introduced into assets and basic principles of advanced microscopical methods (Super-Resolution, Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy (FLIM), Correlative Light Electron Microscopy) with excursion to the service laboratory and presentation of individual microscopes (STED microscope, STORM and SIM microscope, MP microscope, FLIM microscope, SEM microscope).
Last update: doc. RNDr. Jovana Sádlová, Ph.D. (29.08.2023)
Praktikum je rozděleno na pět částí:
1. Světelná mikroskopie (Sádlová, Vojtková, Majer, Bečvář, Jelínková, Hammerbauerová, Vajs) Student se seznámí s teorií týkající se světelné mikroskopie, základy práce se světelným mikroskopem a s přípravou nativních a barvených preparátů (barvení Giemsa-Romanowski, anilinovou modří a nativní barvení alizarinem). Pozorovanými objekty jsou prvoci z různých skupin a cerkárie motolic.
2. Speciální světelná a fluorescenční mikroskopie (Sádlová, Vojtková, Majer, Bečvář, Jelínková, Hammerbauerová, Vajs) Student se seznámí s teorií týkající se kontrastů ve světelné mikroskopii (temné pole, fázový kontrast, Nomarského diferenciální interferenční kontrast, Hoffmanův kontrast), fluorescence a principu fluorescenčního a konfokálního mikroskopu. Prakticky si vyzkouší práci s temným polem, fázovým kontrastem a fluorescenčním mikroskopem.
3. Elektronová mikroskopie (Juračka, Sacherová, Hyliš) Student se seznámí s teorií elektronové mikroskopie a se základními postupy při přípravě preparátů. Bude si moci vyzkoušet práci se skenovacím a transmisním elektronovým mikroskopem ve specializované laboratoři elektronové mikroskopie včetně přípravy jednoduchého preparátu.
4. Zpracování a analýza obrazu v mikroskopii (Albrechtová, Soukup a kol.) V této části se student seznámí se základy digitalizace a zpracování obrazu, prezentace obrazu a základními fázemi a operacemi analýzy obrazu. Praktická cvičení jsou prováděna v programu Image J (National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA; URL: http://imagej.nih.gov). Více na webových stránkách Bloku 4.
5. Pokročilá fluorescenční a elektronová mikroskopie - exkurze do servisní laboratoře zobrazovacích metod BIOCEV (Benda a kol.)
Studentům budou vysvětleny formou přednášky přínosy a stručné principy pokročilých mikroskopických metod (super-resoluce, funkční zobrazování (FLIM), korelativní světelná a elektronová mikroskopie (CLEM)) s následnou exkurzí do servisní laboratoře a představením jednotlivých přístrojů (STED mikroskop, STORM and SIM mikroskop, MP mikroskop, FLIM mikroskop, SEM mikroskop). |