Detekce zlomů DNA
| Thesis title in Czech: | Detekce zlomů DNA |
|---|---|
| Thesis title in English: | DNA break detection |
| Key words: | DNA, opravy DNA, detekce, in vivo, in vitro |
| English key words: | DNA, DNA repair, detection, in vivo, in vitro |
| Academic year of topic announcement: | 2025/2026 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | Mgr. Adéla Přibylová, Ph.D. |
| Author: | |
| Advisors: | RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. |
| References |
| Bennett, Eric Paul, Bent Larsen Petersen, Ida Elisabeth Johansen, Yiyuan Niu, Zhang Yang, Christopher Aled Chamberlain, Özcan Met, Hans H. Wandall, and Morten Frödin. 2020. ‘INDEL Detection, the “Achilles Heel” of Precise Genome Editing: A Survey of Methods for Accurate Profiling of Gene Editing Induced Indels’. Nucleic Acids Research 48(21):11958–81. doi: 10.1093/nar/gkaa975. Spampinato, Claudia P. 2017. ‘Protecting DNA from Errors and Damage: An Overview of DNA Repair Mechanisms in Plants Compared to Mammals’. Cellular and Molecular Life Sciences 74(9):1693–1709. doi: 10.1007/s00018-016-2436-2. |
| Preliminary scope of work |
| Rostlinná i živočišná buňka se denně potýká s přirozeným poškozením DNA. Jedním z nich jsou i zlomy v DNA a opravy DNA jsou klíčovým procesem, který zajišťuje stabilitu genomu. Bakalářská práce si klade za cíl literární rešerši na téma “Detekce zlomů DNA”. V rámci této práce je zkoumána podtémata jako jaký je mechanismy vzniků DNA zlomů, jak je buňka detekuje a jak lze takovéto zlomy detekovat v laboratorních podmínkách. Na tuto bakalářskou práci je k dispozici i navazující magisterské téma. Práci lze lze psát v českém/slovenském či anglickém jazyce. Téma je možné upravit po konzultaci se studentem. Stránka týmu -> https://natur.cuni.cz/biologie/katedry-a-pracoviste/katedra-experimentalni-biologie-rostlin/veda-a-vyzkum/skupina-molekularni-biologie-rostlin-lukase-fischera |
| Preliminary scope of work in English |
| Both plant and animal cells deal with natural DNA damage on a daily basis. DNA breaks are one of them, and DNA repair is a key process that ensures the stability of the genome. This bachelor thesis aims to conduct a literature search on "DNA break detection". Subtopics such as the mechanism of DNA breaks, how the cell detects them, and how such breaks can be detected under laboratory conditions are explored in this thesis. A follow-up Master's thesis is available for this Bachelor's thesis. The thesis can be written in Czech/Slovak or English. The topic can be modified after consultation with the student. Team page -> https://natur.cuni.cz/en/biology/departments-and-work-places/department-of-experimental-plant-biology/research/plant-molecular-biology-group-of-lukas-fischer |