Evolutionary and ecological consequences of polyploidization in Arabidopsis arenosa complex in Western Carpathians
| Thesis title in Czech: | Evoluční a ekologické důsledky polyploidizace komplexu Arabidopsis arenosa v západních Karpatech |
|---|---|
| Thesis title in English: | Evolutionary and ecological consequences of polyploidization in Arabidopsis arenosa complex in Western Carpathians |
| Key words: | alpinská ekologie, Arabidopsis, fenotypická plasticita, polyploidizace |
| English key words: | alpine ecology, Arabidopsis, phenotypic plasticity, polyploidisation |
| Academic year of topic announcement: | 2014/2015 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Botany (31-120) |
| Supervisor: | RNDr. Filip Kolář, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor |
| Date of registration: | 10.10.2014 |
| Date of assignment: | 10.10.2014 |
| Date of electronic submission: | 15.08.2016 |
| Date of proceeded defence: | 14.09.2016 |
| Opponents: | Mgr. Marek Slovák, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Polyploidizace je klíčový mechanismus rychlé speciace rostlin, který má řadu fenotypických projevů, jejichž rozsah je stále nedostatečně prozkoumán. Hlubšímu porozumění evolučním důsledkům genomové duplikace brání především nedostatečná znalost souvislostí mezi změnami na úrovni genotypu, fenotypu i ekologických vazeb. Diplomová práce se zaměří na slibný dosud přehlížený di-polyploidní systém v rámci rostlinného modelového rodu Arabidopsis z vysokých západníchKarpatech. Zde se vyskytují morfologicky odlišné populace diploidních i tetraploidních rostlin komplexu Arabidopsis arenosa rostoucí podle výrazného výškového gradientu. Pomocí již dostupných jaderných mikrosatelitů a sekvenování plastidové DNA se práce pokusí poodhalit hlavní směry genetické variability a evoluční historii populací v Tatrách a okolí. Pomocí morfometrického studia přírodních i experimentálně transplantovaných populací (pokus založen 2014) zároveň testuje hypotézu, zda výrazná morfologická odlišnost horských a nížinných populací představuje geneticky či ploidně podmíněnou odlišnost nebo projev fenotypické plasticity jedné linie se širokou nikou. klíčová slova: alpinská ekologie, Arabidopsis, fenotypická plasticita, polyploidizace |
| Preliminary scope of work in English |
| Polyploidization is a key mechanism of rapid speciation, with many phenotypic consequences which extent, however,is poorly understood. A deeper understanding of the evolutionary implications of genome duplication is restricted by lack of knowledge of the links between changes at the genotype, phenotype and environmental constraints. The thesis focuses on highly promising yet overlooked di-polyploid system within Arabidopsis genus from western Carpathians. In this area, morphologically distinct populations of diploid and tetraploid plants of Arabidopsis arenosa complex grow along a marked altitudinal gradient. Using already available microsatellite markers and plastid DNA sequencing the thesis aims at revealing evolutionary history of populations in the Tatra Mountains and surrounding areas. In addition, using a morphometric study of natural and experimentally transplanted populations the thesis will test the hypothesis whether morphological divergence of mountain and lowland populations has a genetic/ ploidy basis or is driven by phenotypic plasticity. keywords: alpine ecology, Arabidopsis, phenotypic plasticity, polyploidisation |