Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 385)
Thesis details
   Login via CAS
Characterizing DDI2 protein interaction by solution NMR
Thesis title in Czech: Charakterizace interakce proteinu DDI2 pomocí NMR spektroskopie
Thesis title in English: Characterizing DDI2 protein interaction by solution NMR
Key words: ubikvitin-proteasomový systém, ubikvitin, interakční partneři,poškození DNA
English key words: ubiquitin-proteasome pathway, ubiquitin, interactome, DNA damage
Academic year of topic announcement: 2016/2017
Thesis type: diploma thesis
Thesis language: angličtina
Department: Department of Physical and Macromolecular Chemistry (31-260)
Supervisor: Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D.
Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
Date of registration: 14.10.2016
Date of assignment: 14.10.2016
Date of electronic submission:18.08.2019
Date of proceeded defence: 05.09.2019
Opponents: prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.
 
 
 
Preliminary scope of work
Student vypracuje rešerši na téma funkční charakterizace lidského Ddi2 proteinu ve vztahu k několika interakčním partnerům. Experimentálně se zaměří na hledání interakčních partnerů lidského Ddi2 a jeho jednotlivých domén pomocí metod afinitní chramatografie spojené s hmotnostní spektrometrií. Rekombinantně připraví případné interakční partnery a bude ověřovat a charakterizovat jejich vazbu s Ddi2. Naučí se metodám jako je afinitní chromatografie, hmotnostní spektrometrie, SPR (z angl. Surface plasmon resonance) či NMR.
Preliminary scope of work in English
Student will focus on functional characterization of human Ddi2 protein with respect to its interating partners. He will search Ddi2 and its individual domains interactome via affinity pull-down/MS/MS method. He will recombinantly prepare several of them and characterize their interaction with Ddi2. He will learn methods such as affinity chromatography, mass spectrometry, SPR (surface plasmon resonance) or NMR.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html