DNA damage-inducible protein: interakce s proteinovými partnery a potenciální role v proteasomální degradaci proteinů

• Thesis title in Czech: DNA damage-inducible protein: interakce s proteinovými partnery a potenciální role v proteasomální degradaci proteinů
• Thesis title in English: DNA damage-inducible protein: interaction partners and potential role in proteasomal degradation
• Key words: poruchy DNA, protein-proteinové interakce, proteasomální degradace
• English key words: DNA-damage, protein-protein interactions, proteasomal degradation
• Academic year of topic announcement: 2013/2014
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 17.10.2013
• Date of assignment: 29.11.2013
• Date of electronic submission: 15.08.2016
• Date of proceeded defence: 05.09.2016
• Opponents: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D.

Preliminary scope of work

Student se v práci bude zabývat lidským proteinem "DNA-damage inducible protein homologue 2" a jeho možným proteinovým partnerem Rad23B. Překlonuje gen kódující Rad23B do savčího expresního vektoru, následně jej vyexprimuje a vyčistí, přičemž sám zvolí jak expresní, tak i čistící strategii. Následně ověří možnou protein-proteinovou interakci vhodnou kombinací metod. Součástí práce bude aktuální rešerše na dané téma.

Preliminary scope of work in English

In this project the student will study the human DNA-damage inducible protein homolgue 2 and its putative protein partner Rad23B. He will clone Rad23B gene into the mammalian expression vector, overexpress it and subsequently purify. The student will choose the expression and purification strategy on his own. Afterwords, he will prove or disprove the possible protein-protein interaction between both proteins via ideally a combination of methods. Part of the thesis will be up to date review concerning this topic.