Ramanova mikrospektroskopie kapkově nanášených povlaků (DCDR) cukrů
| Thesis title in Czech: | Ramanova mikrospektroskopie kapkově nanášených povlaků (DCDR) cukrů |
|---|---|
| Thesis title in English: | Drop coating deposition Raman microspectroscopy (DCDR) of carbohydrates |
| Key words: | DCDR|Ramanova spektroskopie|cukry |
| English key words: | DCDR|Raman spectroscopy|carbohydrates |
| Academic year of topic announcement: | 2019/2020 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
| Supervisor: | RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 24.11.2019 |
| Date of assignment: | 26.11.2019 |
| Confirmed by Study dept. on: | 13.12.2019 |
| Date and time of defence: | 03.02.2022 09:00 |
| Date of electronic submission: | 06.01.2022 |
| Date of submission of printed version: | 06.01.2022 |
| Date of proceeded defence: | 03.02.2022 |
| Opponents: | RNDr. Eva Kočišová, Ph.D. |
| Advisors: | RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D. |
| Guidelines |
| 1. Seznámit se s principy Ramanovy mikroskopie a Ramanovy spektroskopie kapkově nanášených povlaků (drop coating deposition Raman spectroscopy - DCDR).
2. Vypracovat rešerši na téma studium biomolekul pomocí DCDR a studium cukrů pomocí Ramanovy a obecněji vibrační spektroskopie (se zvláštním zřetelem na cukry přítomné v glykoproteinech). 3. Prakticky zvládnout měření na Ramanově mikrospektrometru. 4. Změřit DCDR spektra vybrané série cukrů (se zvláštním důrazem na cukry přítomné v glykoproteinech). 5. Provést analýzu dat se zaměření na reprodukovatelnost DCDR měření a vztah Ramanova spektra vs. struktura cukru. |
| References |
| M. F. Mrozek, D. Zhang, D. Ben-Amotz: Oligosaccharide identification and mixtue quantification using Raman spectroscopy and chemometric analysis. Carbohydrate Research 339 (2004) 141-145.
D. Zhang, Y. Xie, M. F. Mrozek, C. Ortiz, V. J. Davisson, D. Ben-Amotz: Raman detection of proteomic analytes. Analytical Chemistry 75 (2003) 5703-5709. M. E. Taylor, K. Drickamer: Introduction to glycobiology. Oxford University Press, Oxford - New York 2003, 2006. |
| Preliminary scope of work |
| Ramanova spektroskopie kapkově nanášených povlaků (drop coating deposition Raman spectroscopy - DCDR) je novou, pouze několik let starou techniku měření biomolekul, jež je založena na interakci molekul a speciálně k tomu připraveného hydrofobního povrchu. Měření tak lze provádět za až o dva řády nižších koncentrací biomolekul než je tomu obvyklé u standardní Ramanovy spektroskopie. Náplní bakalářské práce by mělo být otestování použitelnosti DCDR techniky pro měření vzorků cukrů a vytvoření referenční databáze DCDR spekter pro účely studia glykoproteinů. Měření budou prováděna na novém Ramanově mikrospektrometru LabRam HR800 (Horiba Jobin Yvon), tj. na Ramanově spektrometru kombinovaném s mikroskopem. |