Mikrokalorimetrické stanovení termodynamické stability triplexu RNA
| Thesis title in Czech: | Mikrokalorimetrické stanovení termodynamické stability triplexu RNA |
|---|---|
| Thesis title in English: | Microcalorimetric determination of RNA triplex thermodynamic stability |
| Academic year of topic announcement: | 2007/2008 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 05.10.2007 |
| Date of assignment: | 05.10.2007 |
| Date and time of defence: | 17.09.2008 00:00 |
| Date of electronic submission: | 17.09.2008 |
| Date of submission of printed version: | 17.09.2008 |
| Date of proceeded defence: | 17.09.2008 |
| Opponents: | RNDr. Eva Kočišová, Ph.D. |
| Guidelines |
| 1. Seznámit se s problematikou strukturního uspořádání dvojité a trojité šroubovice nukleových kyselin.
2. Seznámit se s obsluhou mikrokalorimetru (DSC). 3. Na modelovém systému syntetických polynukleotidů proměřit teplotně indukovaný rozpad komplexu při různém stechiometrickém složení vzorku a určit termodynamické parametry 1:1 a 1:2 stechiometrických forem komplexů. |
| References |
| 1. W. Saenger: Principles of nucleic acid structure. Springer, New York 1988 (vybrané části)
2. J. Palacký: Spektroskopické studium nových modifikovaných oligonukleotidů. Diplomová práce. MFF UK, Praha 2005 3. Vybraný soubor původních prací. |
| Preliminary scope of work |
| Kromě známé dvojšroubovice jsou nukleové kyseliny schopné vytvářet i jiné typy vícemolekulárních komplexů.
Jedním z nich je trojitá šroubovice tvořená jedním vláknem s purinovými a dvěma vlákny s pyrimidinovýmí bázemi. Umělé vytvoření této struktury je jedním z uvažovaných mechanismů oligonukleotidové terapie. Na rozdíl od dvojšroubovice je však známo poměrně málo o termodynamické stabilitě triplexu a jejímu ovlivnění podmínkami prostředí. Cílem bakalářské práce je provedení mikrokalorimetrických měření na sadě směsných polynukleotidových roztoků a určení termodynamických parametrů spojených s připojením třetího řetězce k dvojšroubovici. |