Charakterizace vibračních módů složek nukleových kyselin pomocí variabilní proton-deuteriové výměny
| Thesis title in Czech: | Charakterizace vibračních módů složek nukleových kyselin pomocí variabilní proton-deuteriové výměny |
|---|---|
| Thesis title in English: | Vibrational modes of nucleic acids components characterized by means of variable proton-deuterium exchange |
| Key words: | Raman, spektrometr, spektroskopie, deuterium, deuteron, nukleová kyselina |
| English key words: | Raman, spectrometer, spectroscopy, deuterium, deuteron, nucleic acid |
| Academic year of topic announcement: | 2007/2008 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 12.11.2007 |
| Date of assignment: | 12.11.2007 |
| Date and time of defence: | 13.09.2010 00:00 |
| Date of electronic submission: | 13.09.2010 |
| Date of submission of printed version: | 13.09.2010 |
| Date of proceeded defence: | 13.09.2010 |
| Opponents: | doc. RNDr. Ivana Šloufová, Ph.D. |
| Guidelines |
| 1. Prostudovat určenou literaturu a sepsat krátký přehled o dosud publikovaných Ramanových spektrech složek nukleových kyselin se záměnou protonu za deuterium.
2. Seznámit se s technikou měření Ramanových spekter a jejich zpracováním pomocí faktorové analýzy. Připravit postup injekcí rozpouštědla do teplotně stabilizované kyvety. 3. Provést sérii měření časových vývojů spekter Ramanova rozptylu po injekci rozpouštědla s izotopově odlišným složením. 4. Na základě analýzy těchto spekter izolovat a identifikovat spektra jednotlivých izotopových forem, provést jejich vzájemné srovnání a konfrontaci s dosavadními publikovanými interpretacemi vibračních módů. |
| References |
| W. Saenger, Principles of nucleic acid structure, Springer, Berlin 1988
V.Prosser a kol., Experimentální metody biofyziky, Academia, Praha 1989 (vybrané části) E.R.Malinowski, Factor analysis in chemistry, Wiley-Interscience, New York 2002 Vybrané původní práce. |
| Preliminary scope of work |
| Přes dlouhé období, kdy se studují vibrační spektra nukleových kyselin, není ještě uspokojivě interpretovaná řada vibračních módů a jejich citlivosti na geometrii a slabé vazby. Jednou z možností, jak rozšířit experimentální data sloužící k těmto interpretacím, je srovnání vibračních spekter molekul s určitou izotopovou záměnou. Zdánlivě nejjednodušší je záměna proton-deuterium. Při rozpuštění molekul v těžké vodě dochází sice k rychlé výměně na heteroatomech, ale ta je téměř současná pro řadu poloh a výsledkem je dynamická rovnováha mezi řadou různých izotopových forem. Metody statistické analýzy časového vývoje Ramanových spekter dávají však nyní principiální možnost analyzovat spektra jednotlivých forem a tím získat unikátní experimentální data. U složitějších úseků nukleových kyselin je pak tato technika perspektivní pro rozšíření strukturních informací. |