Software pro 2D korelační analýzu ve spektroskopii biomolekul
| Thesis title in Czech: | Software pro 2D korelační analýzu ve spektroskopii biomolekul |
|---|---|
| Thesis title in English: | Software for 2D correlation analysis in the spectroscopy of biomolecules |
| Academic year of topic announcement: | 2006/2007 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
| Supervisor: | RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D. |
| Author: |
| Guidelines |
| 1. Seznámit se s principy 2D korelační spektroskopie a s jejím použitím ve spektroskopii biomolekul.
2. Na výše zmíněné téma vypracovat rešerši. 3. Otestovat stávající rutiny vytvořené v MATLABu pro 2D korelační spektroskopii. 4. Navrhnout uživatelsky příjemné grafické rozhraní pro 2D korelační spektroskopii. 5. Naprogramovat 2D korelační spektroskopii s grafickým uživatelským rozhraním v MATLABu a též vytvořit verzi nezávislou na platformě, funkčně ji otestovat a vybavit dokumentací. |
| References |
| [1] I. Noda, Appl. Spectrosc. 47 (1993), 550.
[2] I. Noda, Appl. Spectrosc. 54 (2000), 994. [3] I. Noda, in: Handbook of Vibrational Spectroscopy, J. M. Chalmers and P. R. Griffiths, eds, Vol. 3, Wiley, Chichester, 2001, p. 2123. [4] Y. Ozaki, in: Handbook of Vibrational Spectroscopy, J. M. Chalmers and P. R. Griffiths, eds, Vol. 3, Wiley, Chichester, 2001, p. 2135. [5] Y. Ozaki, K. Murayama, Y. Wu, B Czarnik-Matusewicz, Spectrosc. Int. J. 17 (2003) 79. |
| Preliminary scope of work |
| 2D korelační spektroskopie představuje relativně novou techniku multidimenzionální analýzy spektroskopických dat, která, především v případě složitých biomolekul, umožňuje stanovit jinak obtížně postřehnutelné korelace spektrálních změn vzorku indukovaných fyzikálně-chemickou perturbací. V tuto chvíli jsou k dispozici pouze základní rutiny pro 2D korelační spektroskopii. Náplní bakalářské práce bude, kromě základního seznámení se s problematikou, vytvoření uživatelsky přátelského softwaru pro analýzu libovolných spektroskopických dat pomocí 2D korelační spektroskopie. Předpokládá se, že software bude veřejně dostupný vědecké komunitě a že výsledky práce budou prezentovány na vědecké konferenci. |