Práce bude realizována ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i. (RNDr. Josef Cvačka, Ph.D.), který garantuje jeho finanční zabezpečení. Projekt může být rozvinut do diplomové či doktorské práce.
Preliminary scope of work
Lipidy patří mezi velmi důležité látky v živých organismech. Mají celou řadu funkcí - jsou základními prvky buněčných membrán, zásobárnou energie i přenašeči signálů. Celá řada chorob, např. kardiovaskulární nemoci, obesita, vrozené metabolické poruchy nebo rakovina je přímo či nepřímo s lipidy spojena. Je zřejmé, že biologické vlastnosti lipidů určuje jejich struktura. Lipidy a jejich vzájemné vztahy studuje vědní obor lipidomika. Základním předpokladem všech lipidomických studií jsou spolehlivé analytické metody, které identifikují a kvantifikují lipidy, obvykle v komplikovaných směsích a matricích. Pod souhrnným označením lipidy se skrývá celá řada tříd sloučenin s různou strukturou. Většina z nich však obsahuje dlouhé uhlovodíkové řetězce - zbytky mastných kyselin, které představují nepolární, hydrofobní část molekuly. Tyto řetězce mohou obsahovat až několik dvojných vazeb. Identifikace polohy dvojné vazby (dvojných vazeb) je velmi důležitý a zajímavý analytický problém. Dosud byla poloha dvojné vazby určována pomocí plynové chromatografie (GC nebo GC/MS). Velkou nevýhodou tohoto přístupu je však nutnost destrukce původního lipidu tak, aby byla získána volná mastné kyselina, resp. její methylester. Tím se však ztrácí informace o tom, v jakém lipidu byla daná mastná kyselina vázána. Mnohem výhodnějším přístupem je určení polohy dvojné vazby přímo, bez nutnosti rozbití struktury lipidu. To je možné chemickou derivatizací dvojné vazby vhodným činidlem a následnou analýzou produktů pomocí HPLC/MS.
Cílem tohoto projektu bude přispět k vypracování obecně použitelných metod pro určování poloh dvojných vazeb u lipidů. Vlastní práce bude spočívat v hledání optimálních podmínek pro derivatizaci nenasycených lipidů, v optimalizaci HPLC separace produktů reakce a ve vyhodnocování hmotnostních spekter produktů.
- applied