Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 385)
Thesis details
   Login via CAS
Optimalizace kultivačních podmínek a modulace genové exprese u komenzálních streptomycet pro navýšení produkce antimykotických metabolitů
Thesis title in Czech: Optimalizace kultivačních podmínek a modulace genové exprese u komenzálních streptomycet pro navýšení produkce antimykotických metabolitů
Thesis title in English: Optimization of Culture Conditions and Modulation of Gene Expression in Commensal Streptomycetes to Increase the Production of Antifungal Metabolites
Key words: streptomycety, komenzální mikrobiota, antimykotika, kultivační podmínky, bioaktivní metabolity, sRNA
English key words: streptomycetes, commensal microbiota, antifungals, cultivation conditions, bioactive metabolites, sRNAs
Academic year of topic announcement: 2025/2026
Thesis type: dissertation
Thesis language:
Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
Supervisor: doc. RNDr. Jan Bobek, Ph.D.
Author:
References
Bobek, J., Filipova, E., Bergman, N., Cihak, M., Petricek, M., Lara, A.C., Kristufek, V., Megyes, M., Wurzer, T., Chronakova, A., and Petrickova, K. (2022). Polyenic Antibiotics and Other Antifungal Compounds Produced by Hemolytic Streptomyces Species. Int J Mol Sci 23.
Bobek, J., Mikulova, A., Setinova, D., Elliot, M., and Cihak, M. (2021). 6S-Like scr3559 RNA Affects Development and Antibiotic Production in Streptomyces coelicolor. Microorganisms 9.
Herbrik, A., Corretto, E., Chronakova, A., Langhansova, H., Petraskova, P., Hrdy, J., Cihak, M., Kristufek, V., Bobek, J., Petricek, M., and Petrickova, K. (2019). A Human Lung-Associated Streptomyces sp. TR1341 Produces Various Secondary Metabolites Responsible for Virulence, Cytotoxicity and Modulation of Immune Response. Front Microbiol 10, 3028.
Preliminary scope of work
Projekt se zaměří na antimykotický potenciál metabolitů produkovaných komenzálními streptomycetami a na možnosti navýšení jejich produkce. Pro dosažení tohoto cíle budou optimalizovány kultivační podmínky a provedena mutageneze důležitých regulátorů genové exprese, především malých regulačních RNA. Produkované látky budou identifikovány pomocí moderních analytických metod ve spolupráci s Laboratoří antibiotické rezistence a mikrobiální metabolomiky AV ČR.
Preliminary scope of work in English
The project will focus on the antifungal potential of metabolites produced by commensal Streptomyces and on the possibilities of increasing their production. To achieve this goal, cultivation conditions will be optimized, and mutagenesis of key gene expression regulators, particularly small regulatory RNAs, will be performed. The produced compounds will be identified using modern analytical methods in collaboration with the Laboratory of Antibiotic Resistance and Microbial Metabolomics of the Czech Academy of Sciences.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html