I'm not buying you! Food selectivity of freshwater zooplankton species
| Thesis title in Czech: | Tebe nežeru! Potravní selektivita sladkovodních zooplanktonních druhů |
|---|---|
| Thesis title in English: | I'm not buying you! Food selectivity of freshwater zooplankton species |
| Academic year of topic announcement: | 2024/2025 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Botany (31-120) |
| Supervisor: | doc. Mgr. Pavel Škaloud, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 11.11.2024 |
| Date of assignment: | 11.11.2024 |
| Confirmed by Study dept. on: | 26.01.2025 |
| Preliminary scope of work |
| Základní data - Zooplankton je důležitým článkem potravního řetězce mezi fytoplanktonem a vyššími trofickými hladinami. - Moderní studie sledující potravní preference zooplanktonu jsou výhradně zaměřeny na mořský fytoplankton. O složení potravy sladkovodních zooplanktonních druhů vypovídají pouze starší studie založené na čistě morfologických přístupech. - Křemičité zlativky představují ideální modelové organismy pro studium antipredačních morfologických adaptací – jednotlivé druhy se liší co do velikosti buněk, schopností tvorby kolonií, tvaru, počtu a velikosti ostnů a morfologie křemičitých šupin. Cíle práce - Studium potravní preference sladkovodních druhů zooplanktonu se zaměřením na křemičité zlativky. - Nalézt odpovědi na tyto otázky: --- Liší se jednotlivé druhy/rody/skupiny zooplanktonu v jejich potravní preferenci? --- Jsou křemičité zlativky preferovanou či naopak neoblíbenou potravou? --- Jaké morfologické adaptace hrají roli pro potravní selektivitu zooplanktonu? Metodika - Odběr vzorků v ČR: odběr sterilní planktonkou, přefiltrovaný vzorek do sterilních lahviček; zooplankton fixovat v 96% ethanolu. - Zpracování každého vzorku: --- Přefiltrovaný vzorek: zpracování na TEM (fixace ve formalínu) a na DNA metabarcoding (zmražení vzorku). --- Vzorek zooplanktonu: selekce dominantních druhů, jejich obrazová dokumentace, izolace 40 jedinců pomocí pinzety či kapiláry do dvou eppendorfek, včetně sterilizace jejich povrchu v 1% SAVO a propláchnutí v destilované vodě. 20 jedinců na TEM (fixace ve formalínu), 20 jedinců na metabarcoding (zamražení vzorku). --- Zaměření se na tři skupiny zooplanktonu: Cladocera, Copepoda, Rotifera. - Zpracování vzorků na TEM: vypálení v peroxidu vodíku, detailní analýza druhové diverzity pomocí identifikace křemičitých šupin. - Zpracování vzorků na DNA metabarcoding: testování různých dvojic primerů pro nalezení vhodné kombinace amplifikující pouze fytoplankton, příp. použití tzv. blocking primerů, sekvenace, analýza dat. - Porovnání výsledků, zhodnocení potravních preferencí a role morfologických adaptací |