hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
11.11.2024
Date of assignment:
11.11.2024
Confirmed by Study dept. on:
11.11.2024
Preliminary scope of work
Cílem práce je prozkoumat diverzitu metanogenních symbiontů u několika druhů metopidních nálevníků, u kterých je předpoklad, že mohou být ve vztahu k symbiontům promiskuitní, tj. buď jsou schopni hostit symbionty rodů Methanoregula a Methanobacterium (Metopus es), případně nepříbuzné linie jednoho rodu methanogenních archeí (Brachonella contorta, Urostomides striatus). Podle potřeby mohou být zahrnuty i další druhy metopidních nálevníků. Identita symbiontů bude zjištěna pomocí Sangerova a Illumina sekvenování části genu pro 16S rRNA z jednotlivých buněk nálevníků. Očekává se analýza přibližně 10 izolátů nálevníků z každého studovaného druhu, přičemž některé jsou již k dispozici v kultuře na pracovišti školitele, kdežto zbytek bude získán nově z přírody. Při zjištění, že jeden druh nálevníka je skutečně schopen hostit symbionty ze dvou nepříbuzných druhů, bude provedena základní TEM studie a bude studováno umístění symbiontů v buňce a jejich prostorový vztah s mitochondriemi hostitele.
- assigned and confirmed by the Study Dept.