hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
05.11.2024
Date of assignment:
05.11.2024
Confirmed by Study dept. on:
29.01.2025
Date of electronic submission:
29.04.2025
Date of proceeded defence:
30.05.2025
Opponents:
Mgr. Kateřina Trejbalová, Ph.D.
Preliminary scope of work
Hlavním cílem bakalářské práce je shrnout nejnovější poznatky a nejasnosti týkající se molekulárních aspektů životního cyklu lidského polyomaviru BK. Práce se bude věnovat i) průběhu individuálních kroků infekčního cyklu BKPyV (vstupu do hostitelské buňky, transportu virionů od cytoplasmatické membrány do jádra, časné i pozdní transkripci virových proteinů a replikaci virového genomu, morfogenezi virionů a uvolnění virového potomstva z infikované buňky), ii) charakterizaci struktury a funkce jednotlivých BKPyV kódovaných proteinů a mikroRNA a iii) buněčných procesů vyvolaných replikací BKPyV, jako je poškození buněčné DNA, autofágie, buněčný stres atd. V případě, že nebude k dispozici dostatek literatury týkající se BKPyV, budou jednotlivé kroky infekčního cyklu a virové proteiny popsány na základě poznatků o modelovém polyomaviru SV40, popř. o lidském polyomaviru JC.
Preliminary scope of work in English
The main goal of the bachelor's thesis is to summarize the state of art of the molecular aspects of human polyomavirus BK life cycle. The work will focus on i) the course of the individual steps of the BKPyV infection cycle (entry into the host cell, transport of virions from the cytoplasmic membrane to the nucleus, early and late transcription of viral proteins and viral genome replication, virion morphogenesis and release of viral progeny from the infected cell), ii) characterization the structure and function of individual BKPyV-encoded proteins and microRNAs and iii) cellular processes induced by BKPyV replication, such as cellular DNA damage, autophagy, cell stress, etc. In the absence of sufficient literature regarding BKPyV, the individual steps of the infection cycle and viral proteins will be described based on knowledge about the model polyomavirus SV40, or on human polyomavirus JC.
- assigned and confirmed by the Study Dept.