Pevná média pro kultivaci bakterií: agar a jeho alternativy

• Thesis title in Czech: Pevná média pro kultivaci bakterií: agar a jeho alternativy
• Thesis title in English: Beyond agar: alternative solid media for cultivation of bacteria
• Academic year of topic announcement: 2023/2024
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 26.08.2024
• Date of assignment: 26.08.2024
• Confirmed by Study dept. on: 15.10.2024

Preliminary scope of work

Pevná média jsou nezastupitelná pro kultivaci bakterií. Kromě izolace jednotlivých bakterií z polymikrobiálních vzorků poskytují informace o fenotypu bakterie - spolu s morfologií kolonií je možné hodnotit vybrané biochemicko-fyziologické vlastnosti mikroba. Jako ztužovač živných roztoků při přípravě pevných médií se, díky svým výhodným vlastnostem (termostabilita pevných médií, absence degradace běžnými bakteriemi, minimální negativní vliv na růst bakterií), v moderní mikrobiologii používá téměř výhradně agar. Existuje mnoho dalších aditiv ztužujících vodné roztoky, jež fungují na obdobných základních fyzikálně-chemických principech solidifikace tekutin. Mezi známé přírodní látky s touto funkcí patří polysacharidy (škrob, pektin) a proteiny (želatina). Jako pevná kultivační média mohou také sloužit tepelně sterilizované orgány/struktury mnohobuněčných organismů (např. vaječný bílek nebo zásobní orgány rostlin).
BP shrne poznatky o alternativních možnostech ztužování živných roztoků, které by mohly být využitelné při kultivaci bakterií. Budou pojednány jak historické alternativy z počátků mikrobiologie v 19 století, tak moderní syntetické látky. Na BP bude možné navázat diplomovou prací zaměřenou na použití různých médií pro kultivaci bakterií v domácích/školních podmínkách (tj. mimo specializovanou laboratoř). Důraz bude proto kladen na výše zmíněné přírodní látky, které jsou z didaktického hlediska vhodné pro svou notorickou známost a významnou biologickou funkci v organismech, z nichž jsou získávány. Jejich hydrolýza pomocí mikrobiálních exoenzymů může být na příslušných médiích detekována, čímž lze studentům vizuálně demonstrovat roli bakterií v rozkladných procesech a koloběhu látek v ekosystému.