Úloha RNA demetylázy FTO v regulaci mitochondriální dynamiky v in vitro modelu lidských astrocytů

• Thesis title in Czech: Úloha RNA demetylázy FTO v regulaci mitochondriální dynamiky v in vitro modelu lidských astrocytů
• Thesis title in English: The role of RNA demethylase FTO in the regulation of mitochondrial dynamics in an in vitro model of human astrocytes
• Key words: Mitochondriální fúze a dělení
• English key words: Mitochondrial fusion and fission
• Academic year of topic announcement: 2023/2024
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Physiology (31-152)
• Supervisor: Mgr. Petr Telenský, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 31.10.2023
• Date of assignment: 31.10.2023
• Confirmed by Study dept. on: 03.01.2024

Preliminary scope of work

Na lidských astrocytomových buňkách CCF-STTG1 bude charakterizována role FTO a m6A dráhy následujícími metodami:
1. Vliv m6A dráhy na dynamiku mitochondrií: Budou použity jak farmakologické (inhibitor MO-I-500), tak techniky manipulace exprese pro FTO. Budou analyzovány markery fúze mitochondrií (Mfn1, Mfn2, Opa1) a štěpení (Drp1, Mff, Mid, Fis1). Budou měřeny hladiny ATP, životaschopnost buněk a oxidativní stres.
2. Efekty farmakologické indukce mitofagie: Ověření indukce mitofagie Kaemferolem a Rhapontigeninem. Stanovení markerů mitofagie a exprese regulátorů m6A dráhy.
3. Analýza m6A epitranskriptomu: RNA bude izolována, následně bude provedena extrakce mRNA a hodnocena kvalita. Budou připraveny NGS knihovny a provedena analýza MeRIP. Vzorky budou odeslány k sekvenaci, následně bude provedena epitranskriptomická analýza.