Mezidruhová hybridizace u zástupců série Viridinutantes rodu Aspergillus
| Thesis title in Czech: | Mezidruhová hybridizace u zástupců série Viridinutantes rodu Aspergillus |
|---|---|
| Thesis title in English: | Investigating interspecific hybridization in Aspergillus series Viridinutantes |
| Academic year of topic announcement: | 2023/2024 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Botany (31-120) |
| Supervisor: | Mgr. František Sklenář, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 30.10.2023 |
| Date of assignment: | 30.10.2023 |
| Confirmed by Study dept. on: | 01.02.2024 |
| References |
| Hubka, V., Barrs, V., Dudová, Z., Sklenář, F., Kubátová, A., Matsuzawa, T., ... & Kolařík, M. (2018). Unravelling species boundaries in the Aspergillus viridinutans complex (section Fumigati): opportunistic human and animal pathogens capable of interspecific hybridization. Persoonia-Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi, 41(1), 142-174. Steenwyk, J. L., Lind, A. L., Ries, L. N., Dos Reis, T. F., Silva, L. P., Almeida, F., ... & Rokas, A. (2020). Pathogenic allodiploid hybrids of Aspergillus fungi. Current Biology, 30(13), 2495-2507. Steensels, J., Gallone, B., & Verstrepen, K. J. (2021). Interspecific hybridization as a driver of fungal evolution and adaptation. Nature Reviews Microbiology, 19(8), 485-500. Moran, B. M., Payne, C., Langdon, Q., Powell, D. L., Brandvain, Y., & Schumer, M. (2021). The genomic consequences of hybridization. Elife, 10, e69016. Steenwyk, J. L., Knowles, S. L., Bastos, R., Balamurugan, C., Rinker, D., Mead, M. E., ... & Rokas, A. (2023). Evolutionary origin, population diversity, and diagnostics for a cryptic hybrid pathogen. bioRxiv, 2023-07. Michelotti, L. A., Sun, S., Heitman, J., & James, T. Y. (2022). Clonal evolution in serially passaged Cryptococcus neoformans× deneoformans hybrids reveals a heterogenous landscape of genomic change. Genetics, 220(1), iyab142. |
| Preliminary scope of work |
| Cílem práce je prozkoumat proces mezidruhové hybridizace u vláknitých hub ze série Viridinutantes rodu Aspergillus. Z předchozích studií jsou k dispozici kmeny vzniklé křížícími experimenty mezi různými druhy série Viridinutantes. Náplní této práce bude provést zpětné křížení hybridních kmenů s rodičovskými druhy, zdokumentovat a porovnat fenotypové vlastnosti rodičovských druhů, hybridů i zpětných kříženců a získat molekulární data metodou RAD-Seq. Tento přístup pomůže získat nové informace o genetickém pozadí hybridizace (určité kmeny produkují mezidruhové hybridy velice ochotně, jiné naopak vůbec), možnosti přenosu genů významných pro virulenci nebo resistenci k antimykotikům pomocí introgrese, nebo populační struktuře série Viridinutantes. |
| Preliminary scope of work in English |
| The aim of this thesis is to investigate the interspecific hybridization in filamentous fungi of Aspergillus series Viridinutantes. Strains of hybrid origin prepared by crossing experiments between different species of the series Viridinutantes are already available from previous studies. The present thesis will involve backcrossing hybrid strains with the parental species, documenting and comparing the phenotypic characteristics of the parental species, hybrids and backcrosses, and obtaining molecular data by RAD-Seq. This approach will help to obtain new information on the genetic background of hybridization (certain strains produce interspecific hybrids very readily, others not at all), the possibility of transferring genes essential for virulence or resistance to antifungals by introgression, or the population structure of the series Viridinutantes. |