Genome duplication in Stellaria genus – the more, the merrier? Link between ploidy levels and sexual polymorphism.
Thesis title in Czech:
Duplikace genomu v rodu Stellaria - čím více, tím lépe? Vztah mezi ploidní úrovní a sexuálními polymorfismy
Thesis title in English:
Genome duplication in Stellaria genus – the more, the merrier? Link between ploidy levels and sexual polymorphism.
Key words:
Stellaria palustris, sexuální polymorfismus, polyploidie, cytogeografie, sexuální rozmnožování, klonalita, hybridizace, střední Evropa, Skandinávie
English key words:
Stellaria palustris, sexual polymorphism, polyploidy, cytogeographic pattern, sexual reproduction, clonality, hybridization, Central Europe, Scandinavia
hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
26.10.2022
Date of assignment:
26.10.2022
Confirmed by Study dept. on:
15.02.2023
Date of electronic submission:
30.04.2024
Date of proceeded defence:
05.06.2024
Opponents:
Mgr. Jan Prančl, Ph.D.
Advisors:
doc. Clément Lafon Placette, Dr.
Preliminary scope of work
Ptačinec bahenní (Stellaria palustris) je vytrvalá, polyploidní, klonálně rostoucí, vlhkomilný druh z čeledi Caryophyllaceae. Druh se přirozeně vyskytuje v Eurasii, jeho distribuce ale není uniformní a početnost směrem na jih ubývá, přičemž v centrální Evropě je jeho výskyt spíše raritní. V České republice je druh řazen do skupiny silně ohrožených druhů (C2b) a na Slovensku patří k druhům zranitelným (VU). Informace o druhu jsou obecně nedostatečné, zejména pak v centrální Evropě. Cílem práce bude zhodnocení vybraných biologických parametrů (cytotypová variabilita, míra generativního rozmnožování, přítomnost sexuálních polymorfismů atd.) které mohou mít klíčový dopad na populační dynamiku a celkové přežívání tohto ohroženého druhu. Důraz bude kladen také na zhodnocení možné hybridizace s příbuzným běžným druhem S. graminea, která může být pro již tak ohrožený druh kritická. Nosnou částí bude studium vysoké polyploidie u druhu a její asociaci s sexuálními polymorfismy a sexuální reprodukcí. Design studie bude zahrnovat především populace ze střední Evropy, ale pro srovnávací účely bude sbírán také materiál ze Skandinávie, kde je druh mnohem početnější, přičemž se zde předpokládá i výraznější morfologická, genetická a karyologická variabilita. Z metodologického hlediska budou v práci kromě terénního výzkumu a mapování využity metody průtokové cytometrie, přímého počítání chromozomů, genetické analýzy, analýzy sexuálních polymorfismů a reprodukce, ale také hybridizační experimenty pro experimentální důkaz hybridizace meziS. palustrisaS. graminea.
Preliminary scope of work in English
Stellaria palustris(Caryophyllaceae) is a perennial, polyploid, clonal species inhabiting open wetland habitats. The species occurs naturally in Eurasia, but its distribution is not uniform and its abundance decreases towards the south, while its occurrence is rather rare in central Europe. In the Czech Republic, the species is classified as a highly endangered species (C2b) and in Slovakia as a vulnerable species (VU). Information about the species is generally insufficient, especially in central Europe. The goal of the thesis will be the evaluation of selected biological parameters (cytotype variability, rate of generative reproduction, presence of sexual polymorphisms, etc.) that can have a crucial impact on the population dynamics and overall survival of this endangered species. Emphasis will also be placed on the evaluation of possible hybridization with the related speciesS. graminea, which may be critical for the already endangered species. The main part will be the study of high polyploidy in the species and its association with sexual polymorphisms and sexual reproduction. The proposed study will mainly include populations from Central Europe, but for comparison, material from Scandinavia will also be collected, where the species is much more common and more pronounced morphological, genetic and karyological variability is expected here. From a methodological point of view, in addition to field research and mapping, the work will use the methods of flow cytometry, direct chromosome counting, genetic analysis, analysis of sexual polymorphisms and reproduction, as well as hybridization experiments for experimental evidence of hybridization betweenS. palustrisandS. graminea.
- assigned and confirmed by the Study Dept.