Development of new chemical tools for the study of redox biological processes

• Thesis title in Czech: Vývoj nových chemických nástrojů pro studium redoxních biologických procesů
• Thesis title in English: Development of new chemical tools for the study of redox biological processes
• Key words: chemické sondy, redoxní rovnováhy, posttranslační modifikace,
• English key words: chemical probes, redox balance, post-translational modifications
• Academic year of topic announcement: 2021/2022
• Thesis type: dissertation
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Organic Chemistry (31-270)
• Supervisor: doc. RNDr. Jiří Míšek, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 11.10.2021
• Date of assignment: 11.10.2021

Guidelines

Organic Synthesis I MC270P13A
Mechanisms of Organic Reactions MC270P98
Bioorganic chemistry MC270P78

Preliminary scope of work

Cílem práce je příprava nových aktivitních chemických sond, které umožní detekci proteinů v oblastech oxidačních událostí. Nejprve budou testovány sloiučeniny na bázi thioenoletherů. Oxidace siry v těchto sloučeninách na sulfoxid poskytne reaktivní intermediát schopný neselektivní Michaelovské adice s různými nukleofily proteinů. Tento přístip umožní globální profilování proteinů, které se vyskytují v oblastech oxidačního stresu v organismech.

Preliminary scope of work in English

The aim of the work is the preparation of new activity-based chemical probes, which will enable the detection of proteins in the areas of oxidative events. Compounds based on thioenol ethers will first be tested. Oxidation of the sulfur in these compounds to the sulfoxide will provide a reactive intermediate capable of non-selective Michael addition with various nucleophiles of proteins. This approach will allow global profiling of proteins that occur in areas of oxidative stress in organisms.