DNA/RNA interkalační činidla jako antivirotika: možné mechanismy účinku

• Thesis title in Czech: DNA/RNA interkalační činidla jako antivirotika: možné mechanismy účinku
• Thesis title in English: DNA/RNA intercalating agents as antivirotics: possible mechanisms of action
• Key words: Interkalace, antivirotika, virus lidské imunodeficience (HIV), virus chřipky, virus hepatitidy C (HCV)
• English key words: Intercalation, antivirotics, human immunodeficiency virus (HIV), influenza virus, hepatitis C virus (HCV)
• Academic year of topic announcement: 2019/2020
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: RNDr. Hana Španielová, Ph.D.
• Author: Mgr. Václav Kropáček - assigned by the advisor
• Date of registration: 30.03.2020
• Date of assignment: 30.12.2020
• Date of electronic submission: 13.08.2021
• Date of proceeded defence: 07.09.2021
• Opponents: RNDr. Jana Šmahelová

References

Al-Bari, Md. Abdul Alim. 2017. „Targeting Endosomal Acidification by Chloroquine Analogs as a Promising Strategy for the Treatment of Emerging Viral Diseases". Pharmacology Research & Perspectives 5 (1): e00293. https://doi.org/10.1002/prp2.293.
Engel, Sabrina, Thomas Heger, Roberta Mancini, Fabian Herzog, Jürgen Kartenbeck, Arnold Hayer, a Ari Helenius. 2011. „Role of Endosomes in Simian Virus 40 Entry and Infection". Journal of Virology 85 (9): 4198–4211. https://doi.org/10.1128/JVI.02179-10.
Fredericksen, B. L., B. L. Wei, J. Yao, T. Luo, a J. V. Garcia. 2002. „Inhibition of Endosomal/Lysosomal Degradation Increases the Infectivity of Human Immunodeficiency Virus". Journal of Virology 76 (22): 11440–46. https://doi.org/10.1128/JVI.76.22.11440-11446.2002.
Meshnick, S. R. 1990. „Chloroquine as Intercalator: A Hypothesis Revived". Parasitology Today 6 (3): 77–79. https://doi.org/10.1016/0169-4758(90)90215-P.
Paton, Nicholas I., Ruth L. Goodall, David T. Dunn, Samuel Franzen, Yolanda Collaco-Moraes, Brian G. Gazzard, Ian G. Williams, et al. 2012. „Effects of Hydroxychloroquine on Immune Activation and Disease Progression Among HIV-Infected Patients Not Receiving Antiretroviral Therapy: A Randomized Controlled Trial". JAMA 308 (4). https://doi.org/10.1001/jama.2012.6936.
Pépin, Geneviève, Charlotte Nejad, Belinda J. Thomas, Jonathan Ferrand, Kate McArthur, Philip G. Bardin, Bryan R.G. Williams, a Michael P. Gantier. 2017. „Activation of CGAS-Dependent Antiviral Responses by DNA Intercalating Agents". Nucleic Acids Research 45 (1): 198–205. https://doi.org/10.1093/nar/gkw878.
Schmidtke, M, U Schnittler, B Jahn, H.-M Dahse, a A Stelzner. 2001. „A Rapid Assay for Evaluation of Antiviral Activity against Coxsackie Virus B3, Influenza Virus A, and Herpes Simplex Virus Type 1". Journal of Virological Methods 95 (1–2): 133–43. https://doi.org/10.1016/S0166-0934(01)00305-6.

Preliminary scope of work

Při výzkumu léčby rakoviny nebo návrhu protivirové léčby je v poslední době většina úsilí zaměřena na identifikaci molekulárních mechanismů progrese rakoviny nebo životního cyklu konkrétního viru s cílem navrhnout specifické protinádorové nebo protivirové léčivo zaměřené na jednotlivé molekulární cíle. Na druhou stranu, racionálně navržené léky, které působí na více cílů, mohou být novým zdrojem terapeutik, protože mnoho z těchto léků již bylo použito v různých klinických podmínkách. Například látky, které se vmezeřují (interkalují) do DNA nebo RNA mohou sloužit jako historický příklad léčiv, která se používají jako antiprotozoální, antibakteriální a protirakovinné látky. V poslední době byly některé z nich také zkoumány pro své antivirové vlastnosti, přesto mechanismus jejich antivirové selektivity není zcela jasný. Tato bakalářská práce by měla poskytnout přehled mechanismu působení DNA / RNA interkalátorů obecně a zaměřit se na ty sloučeniny, u nichž se prokázalo antivirové působení. Cílem práce by mělo být shrnout poznatky, které nabízejí jakákoliv relevantní vysvětlení jejich selektivního antivirového účinku a podat přehled o tom, jak se selektivní antivirové účinky zjišťují a ověřují.

Preliminary scope of work in English

Most of the efforts in cancer and antiviral therapy have recently been focused on identifying molecular mechanisms of cancer or specific virus life cycle progression in order to design precise anti-cancer or antiviral drug targeting single molecules. On the other hand, rationally designed drugs that act on multiple targets is an exciting area of cancer research since many of these drugs has been already used in various clinical settings. For example, DNA/RNA intercalating agents can serve as an example of this class of drugs that have been historically used as antiprotozoal, antibacterial and anticancer agents. Recently, some of them have been also investigated for their antiviral properties, yet, the mechanism of their antiviral selectivity is not completely clear. The bachelor thesis should give an overview of the mechanism of action of DNA/RNA intercalators in general and focus on those compounds that have proven antiviral action to decipher the mode of their antiviral selectivity and summarize the assays used in research to reveal the selective antiviral effects of selected compounds.