hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
Date of registration:
17.11.2019
Date of assignment:
17.11.2019
Date of electronic submission:
11.08.2021
Date of proceeded defence:
03.09.2021
Opponents:
prof. Ing. Miroslav Oborník, Ph.D.
Advisors:
Mgr. Tomáš Pánek, Ph.D.
Preliminary scope of work
Organismus SUM-K byl objeven jako kontaminant laboratorní kultury mořských anaerobních nálevníků na základě analýzy metagenomu společenstva v této kultuře. Nyní je SUM-K k dispozici v monoeukaryotické kultuře. Je to malý bičíkovec s nezvyklou morfologií. Fylogenetická analýza založená na genu pro SSU rRNA ukázala, že SUM-K pravděpodobně představuje dosud neobjevenou hlubokou eukaryotickou linii a že jeho výzkum může pžispět k pochopení evoluce eukaryot jako takových. Z metagenomu byl zrekonstruován mitochondriální genom, který také vykazuje některé zajímavé vlastnosti. Cílem práce je fylogenomická analýza založená na nově získaných transkriptomických datechm, která by měla vyřešit fylogenetickou pozici organismu SUM-K. Transktipromická data budou též použita k predikci energetického metabolismu, jsou totiž indicie, že SUM-K bymohl být fakultativní anaerob nebo mikroaerofil. Další částí bude výzkum bičíkového aparátu pomocí transmisní elektronové mikroskopie.
- assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval