Interakce proteinů Whi3 a Yap6 při mírném osmotickém stresu
| Thesis title in Czech: | Interakce proteinů Whi3 a Yap6 při mírném osmotickém stresu |
|---|---|
| Thesis title in English: | Interaction of Whi3 and Yap6 under mild osmotic stress |
| Key words: | morfologie kolonií, signální dráha filamentárního růstu, osmotický stres,fluorescenční proteiny, Saccharomyces cerevisiae |
| English key words: | colony morphology, filamentous pathway, osmotic stress,fluorescent stress, Saccharomyces cerevisiae |
| Academic year of topic announcement: | 2019/2020 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Genetics and Microbiology (31-140) |
| Supervisor: | RNDr. Michaela Schierová, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor |
| Date of registration: | 14.11.2019 |
| Date of assignment: | 10.12.2019 |
| Date of electronic submission: | 26.04.2021 |
| Date of proceeded defence: | 26.05.2021 |
| Opponents: | doc. RNDr. Olga Heidingsfeld, CSc. |
| Preliminary scope of work |
| Protein Whi3 je RNA vazebný protein, ovlivňující nejen velikost a tvar buněk, ale i produkci sekretovaných proteinů a v neposlední řadě i morfologii kolonií. Několika nezávislými signálními drahami ovlivňuje transkripci významného genu FLO11, jehož exprese je charakteristická pro buňky strukturovaných kolonií. Protein Yap6 je transkripční faktor s pozitivními i negativními účinky, jehož hladina je je zvýšená u kmene s delecí WHI3. Protein interaguje s Tup1-Cyc8 a podílí se na regulaci metabolismu uhlíku, rovněž zvyšuje osmotoleranci. Mimo jiné, exprese YAP6 je regulována Sok2p, takže je jeho regulace závislá i na signální dráze zprostředkované Yak1p a tedy i Whi3p. Mezi cílové geny proteinu Yap6 patří TEC1, PHD1, FLO8, STE2, STE7, STE12 a STE18, které jsou zapojeny do filamentárního růstu. Cílem diplomové práce bude zjistit, zda se interakce Whi3 a Yap6 mění v závislosti na stáří kolonie, zdroji uhlíku v médiu, teplotě při kultivaci atd. Dílčí cíle: Připravit kmeny s mutacemi YAP6, produkující fluorescenčně značený Flo11p. Analyzovat produkci Flo11p kolonií kmenů různého genotypu (WHI3, YAP6 - delece genů, zvýšená exprese) během kultivace za standardních i stresových podmínek. Charakterizovat morfologii kolonií vybraných kmenů s mutacemi WHI3 a YAP6 a sledovat jejich citlivost vůči osmotickému stresu. |