Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 368)
Thesis details
   Login via CAS
Response of microbial soil community and microbe-mediated ecosystem processes to forest harvesting
Thesis title in Czech: Vliv kácení lesa na složení společenstev mikroorganismů a jejich aktivitu
Thesis title in English: Response of microbial soil community and microbe-mediated ecosystem processes to forest harvesting
Key words: ekologie mikroorganismů; ekosystémové procesy; lesní půda; bakterie; houby; mykorrhiza; metagenomika; metatranskriptomika
English key words: microbial ecology; ecosystem processes; forest soil; bacteria; fungi; mycorrhiza; metagenomics; metatranscriptomics
Academic year of topic announcement: 2019/2020
Thesis type: dissertation
Thesis language: angličtina
Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
Supervisor: prof. RNDr. Petr Baldrian, Ph.D.
Author: hidden - assigned by the advisor
Date of registration: 17.10.2019
Date of assignment: 17.10.2019
References
Boddy: The Fungi
Madigan, Martinko, Parker: Brock Biology of Microorganisms
Preliminary scope of work
Holoseč a selektivní probírka jsou běžnými typy managementu porostů v lesích temperátní a boreální zóny. Oba typy manipulace mají významný vliv na ekosystémové procesy. Kromě toho, že mají ekonomický význam, mohou být tyto manipulace chápány rovněž jako příležitost studovat vliv redukce primární produktivity na půdní procesy. Odstranění stromů přirozeně ovlivňuje zejména jejich mikrobiální symbionty, mykorrhizní houby. V tomto projektu navrhujeme studovat vliv managementu porostů na společenstva půdních mikroorganismů v lesích s dominancí ektomykorrhizní a arbuskulární mykorhizní symbiózy a v porostech s jejich směsí. Změny ekosystémových parametrů a jejich fungování, jako je například rozklad organické hmoty a obrat dusíku budou popsány v kontextu složení mikrobiálních společenstev a jejich transkripční aktivity. Projekt by měl ukázat k jakým přechodným změnám po manipulaci porostů dochází a jak na ně reagují různé skupiny mikroorganismů. To je důležité zejména pro návrh budoucích přístupů k managementu a ochraně lesních porostů zejména s ohledem na bilanci cyklu uhlíku.
Preliminary scope of work in English
Forest harvesting is economically important but due to the ecological importance of forests, it also represents a dramatic event in the ecosystem development. While clearcutting is a common practice in the temperate and boreal forests, variable retention harvesting is an alternative silvicultural practice in which some portion of the pre-harvest stand is retained after harvest. The broad objective is to maintain structural and functional elements from the pre-harvest condition to promote rapid recovery of biodiversity and ecological functions in the regenerating stands compared to clearcut stands. Harvesting of trees have profound effects on ecosystem processes that are associated with changes in the quality and decreases in the quantity of plant C inputs into the surrounding soil, as well as effects on soil nutrient availability and microclimatic conditions. Harvested stands also offer the opportunity to study the effect of reduced primary production on soil processes. Forest harvesting is known to have major effects on the main symbiotic fungi living on the roots of temperate trees, ectomycorrhizae, however, little is known about harvesting effects on symbiotic arbuscular mycorhizal fungi and bacteria. This project proposes to analyse the short term effects of forest harvesting on the activity and composition of soil microbial communities in forests with dominant ectomycorrhizal and arbuscular mycorrhizal symbiosis and those with mixed ECM/AM. The changes of ecosystem properties and functioning, such as decomposition and N cycling will be linked to the community composition of soil microbes and their transcriptional activity. The project should give a view of the temporary changes of forest stand manipulations as well as answer the response of individual groups of microbes. This is important both for the consideration of future forest management strategies and the predictions of forest management effects on C balance of forest soils.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html