hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
15.10.2019
Date of assignment:
16.10.2019
Confirmed by Study dept. on:
16.10.2019
Advisors:
RNDr. Libuše Váchová, CSc.
Preliminary scope of work
Práce bude zaměřena na identifikaci nových regulačních komponent (proteinů, metabolitů) hrajících roli při diferenciaci kvasinkových buněk. Důraz bude kladen na komponenty dusíkového metabolismu, včetně interakce mezi dráhou TORC1 a dalšími procesy. Práce bude zahrnovat metody molekulární a buněčné biologie i biochemie, včetně analýzy deleční knihovny s cílem identifikovat "knockout" (KO) kmeny se změnami důležitých regulátorů metabolismu dusíku, přípravu KO kmenů i kmenů s vybranými proteiny značenými fluorescenčním proteinem a isolaci a detekci potenciálních signálních molekul (včetně identifikace metabolitů pomocí GS-MS a LC-MS).
Preliminary scope of work in English
The aim of the work is to contribute to elucidate components (proteins and metabolites) involved in regulation of differentiated yeast cells with emphasis on compounds involved in regulation of nitrogen metabolism including an interplay between TORC1 and other processes. Spectrum of different approaches will be used during the project, including high throughput analyses of yeast deletion strain library to identify knockout strains with changed nitrogen metabolism, construction of knockout strains and strains with proteins labeled with fluorescent tags and isolation and detection of potential signaling molecules (including identification of low Mw metabolites by GS-MS a LC-MS).
- assigned and confirmed by the Study Dept.