Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 385)
Thesis details
   Login via CAS
Rekombinační hot-spoty u různých organismů
Thesis title in Czech: Rekombinační hot-spoty u různých organismů
Thesis title in English: Recombination hot-spots in various organisms
Key words: crossing-over, dvouřetězcový zlom, evoluce, histonové modifikace, PRDM9 protein, preferenční místo, rekombinace
English key words: crossing-over, double-strand break, evolution, histone modifications, PRDM9 protein, hot-spot, recombination
Academic year of topic announcement: 2019/2020
Thesis type: Bachelor's thesis
Thesis language: čeština
Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
Supervisor: doc. RNDr. Dana Holá, Ph.D.
Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
Date of registration: 22.10.2019
Date of assignment: 09.12.2019
Date of electronic submission:15.05.2020
Date of proceeded defence: 10.07.2020
Opponents: Mgr. Martin Forman
 
 
 
Preliminary scope of work
Práce se zabývá evolucí rekombinačních charakteristik genomu. Je známo, že rozložení crossing-overu a jeho frekvence jsou ovlivňovány řadou parametrů souvisejích s architekturou chromozomů a genomu (velikost genomu, distribuce heterochromatinu, histonové modifikace, pohlavní chromozomy, počet a morfologie chromozomů, chromozomové přestavby, kinetická organizace chromozomů), pohlavím (samice mají často vyšší frekvenci rekombinací), často i polohou rekombinačních míst, která mohou blokovat crossing-over ve svém okolí. V práci by měly být podrobně analyzovány různé vlastnosti míst v genomu různých organizmů, v nichž dochází preferenčně k rekombinacím (rekombinačních hotspotů), jejich sekvenční charakteristice a specifickým proteinům, které jsou s těmito místy spojeny.
Preliminary scope of work in English
Thesis is dealing with evolution of genomic recombination landscape. Distribution and frequency of crossing-overs are influenced by many parameters related to architecture of chromosomes and genome (genome size, distribution of heterochromatin, histone modifications, sex chromosomes, number chromosomes and their morphology, chromosome rearrangements, kinetic organization of chromosomes). sex (females exhibit usually higher frequency of chiasmata than males), and sites of crossing-over, which usually block origin of these events nearby. The thesis should bring summary information on recombination hotspots of various organisms, i.e. genomic locations with preferential recombination, their sequences and specific proteins associated with these hotspots.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html