Vegetativní inkompatibilita v druhovém komplexu Aspergillus viridinutans

• Thesis title in Czech: Vegetativní inkompatibilita v druhovém komplexu Aspergillus viridinutans
• Thesis title in English: Vegetative incompatibility within Aspergillus viridinutans species complex
• Key words: vegetativní inkompatibilita, biologický druhový koncept, pohlavní rozmnožování, rozpoznání sebe sama, Aspergillus viridinutans
• English key words: vegetative incompatibility, biological species concept, sexual reproduction, self-recognition, Aspergillus viridinutans
• Academic year of topic announcement: 2018/2019
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Botany (31-120)
• Supervisor: Mgr. František Sklenář, Ph.D.

References

Glass, N. Louise, and Gretchen A. Kuldau. "Mating type and vegetative incompatibility in filamentous ascomycetes." Annual review of phytopathology 30.1 (1992): 201-224.
Paoletti, Mathieu. "Vegetative incompatibility in fungi: From recognition to cell death, whatever does the trick." Fungal Biology Reviews 30.4 (2016): 152-162.
Esser, Karl. "6 Heterogenic Incompatibility in Fungi." Growth, Differentiation and Sexuality. Springer International Publishing, 2016. 103-131.
Katan, Talma. "Current status of vegetative compatibility groups in Fusarium oxysporum." Phytoparasitica 27.1 (1999): 51-64.
Aanen, Duur K., et al. "Biology and genetics of vegetative incompatibility in fungi." Cellular and molecular biology of filamentous fungi. American Society of Microbiology, 2010. 274-288.
Hall, Charles, et al. "Evolution and diversity of a fungal self/nonself recognition locus." PLoS One 5.11 (2010): e14055.
Dyer, P. S., P. Inderbitzin, and R. Debuchy. "14 Mating-Type Structure, Function, Regulation and Evolution in the Pezizomycotina." Growth, differentiation and sexuality. Springer International Publishing, 2016. 351-385.
Zhao, Jiuhai, et al. "Identification of allorecognition loci in Neurospora crassa by genomics and evolutionary approaches." Molecular biology and evolution 32.9 (2015): 2417-2432.
Pal, K., et al. "Sexual and vegetative compatibility genes in the aspergilli." Studies in Mycology 59 (2007): 19-30.

Preliminary scope of work

Prvotní studie zaměřená na biologický druhový koncept u druhového komplexu Aspergillus viridinutans odhalila, že některé opačně pohlavně laděné izoláty (určeno na základě přítomného MAT-genu) v rámci stejného druhu nebyly schopny vytvořit pohlavní stádium a naopak některé izoláty vytvářely plodnice i s izoláty náležejícími k jiným druhům. Tuto příliš nízkou nebo naopak příliš rozsáhlou schopnost splývání s ostatními izoláty pravděpodobně způsobují geny pro vegetativní inkompatibilitu. Cílem této práce bude s využitím genomických dat identifikovat zodpovědné geny a vysvětlit evoluci těchto genů v rámci druhového komplexu Aspergillus viridinutans.