Současné přístupy celogenomového sekvenování a de novo sestavení genomu

• Thesis title in Czech: Současné přístupy celogenomového sekvenování a de novo sestavení genomu
• Thesis title in English: Current approaches to whole genome sequencing and de novo genome assembly
• Key words: sekvenování nové generace, sekvenování třetí generace, celogenomové sekvenování, de novo sestavení genomu, algoritmy genomového sestavení
• English key words: next generation sequencing, third generation sequencing, whole genome sequencing, de novo assembly, genome assembly algorithms
• Academic year of topic announcement: 2017/2018
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Zoology (31-170)
• Supervisor: RNDr. Radka Reifová, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 13.11.2017
• Date of assignment: 13.11.2017
• Date of electronic submission: 07.05.2018
• Date of proceeded defence: 12.06.2018
• Opponents: Mgr. Jan Röslein
• Advisors: Mgr. Jan Pačes, Ph.D.

Preliminary scope of work

Cílem práce bude shrnout současné metody celogenomového sekvenování, a dále metody asembly a anotace genomu. Navazující diplomová práce se bude týkat celogenomového sekvenování, assembly a anotace genomu slavíka obecného (Luscinia megarhynchos).