Virus BK je lidský polyomavirus hojně rozšířený v lidské populaci. Vyskytuje se ve čtyřech hlavních subtypech. Je původcem komplikací při transplantacích ledviny. Přítomnost odlišných sérotypů u příjemce a dárce ledviny může být významným faktorem pro úspěšnost zákroku. Velká podobnost BK viru s jinými polyomaviry a především křížové reakce sérových protilátek s různými subtypy viru komplikují vývoj jednoduchého sérologického testu, který by dokázal odlišit jedince infikované různými subtypy. Cílem této diplomové práce je zmapovat ve VP1 proteinu BKV místa významná pro vazbu protilátek namířených proti subtypu BKV-I a BKV-IV. Gen kódujíc VP1 protein BKB-IV subtypu bude cíleně, opakovaně a mnohočetně mutován a důsledky mutací pro vazbu protilátek na virové částice vzniklé po expresi mutovaných genů budou vyhodnoceny pomocí imunologických testů. K dispozici jsou polyklonální králičí a lidská séra reagující s BKV-I a BKV-IV antigeny. Zkoumána bude rovněž role minoritních proteinů při interakci s těmito protilátkami. Identifikace epitopů, které budou hrát roli při odlišení sérotypů, může vést k návrhu subtypově specifického antigenu pro ELISA testy.
- assigned by the advisor