„Jména jsou klíčem k nové velké biologii“, a to zejména pro umožnění komunikace mezi vědci - tento názor je stále více a více přijímán v oborech organismální biologie. Jména jsou vytvářena prostřednictvím taxonomie - vědecké disciplíny formalizující proces, kdy jsou skupinám organismů sdílejícím určité znaky přidělována jména. Tradičně se k taxonomickým závěrům dospívá na základě morfologických znaků, ale od nástupu metod molekulární biologie do systematiky, je jako další kritérium často používána fylogenetická příbuznost. Někdy jsou využívány i další vlastnosti jako ekologické preference, přítomnnost sekundárních sloučenin a stupeň ploidie. Způsob, jak obhájit vymezení hranic mezi taxony (druhy, poddruhy, varietami) na základě všech těchto vlastností, se stal předmětem vážné debaty v taxonomii a vedl ke vzniku nového oboru„vymezování druhů“ (species delimitation), který hledá skupiny organismů, které sdílejí určité vlastnosti, pomocí jednotných statistických přístupů. Takovýto formalizovaný přistup by měl usnadnit vytváření nových solidně založených taxonomických konceptů. Cílem této bakalářské práce je představit vymezování druhů jako nový obor a shrnout jeho jednotlivé metodické nástroje. Práce se bude dále věnovat fenotypické plasticitě jako hlavnímu problému v morfologicky založené taxonomii a shrne současné taxonomické koncepce druhového komplexu Arabidopsis arenosa. Vytvoření nové taxonomické koncepce druhového komplexu Arabidopsis arenosa bude cílem navazující diplomové práce.
Preliminary scope of work in English
„Names are key to the big new biology“, especially in order to communicate among researchers - this view is more and more adopted in fields of organismal biology. Names are created in the scientific discipline of taxonomy; groups of organisms that share certain characteristics are given a name. Traditionally, taxonomic treatments were based on morphological characters, and since the advent of molecular biology in systematics, phylogenetic placement was often used as an additional criterion. Other characteristics, such as ecological preferences, secondary compounds and information about the cytotype, were partly considered as well. It has ever been strongly debated how to justify the definition of borders between taxa (e.g., species, subspecies, varieties), based on all those characteristics, and nowadays novel statistical approaches of species delimitation are available to assist in finding groups of organisms that share certain characteristics. This should facilitate to build a taxonomic concept. In this bachelor thesis, species delimitation will be introduced, methods of species delimitation summarized, phenotypic plasticity as a major issue in morphology-based taxonomy discussed, and the present taxonomic concepts of the Arabidopsis arenosa species complex summarized. A new taxonomic concept of the Arabidopsis arenosa species complex should be established in the subsequent master thesis.
- assigned by the advisor